Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S6BV96

Protein Details
Accession A0A2S6BV96    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-31NMSSSDVKAEKKKRKRAEKAEEEEELEHydrophilic
33-62DVNLPEPPSKKAKRKEKKAKSKPAATETTDHydrophilic
300-329EEYTAEQKKRHAKKKKKPMKWFINRIHGRMBasic
379-420AAARDAPREKSNKKRDPNLKKMNKDERQELRRKKHDARLTAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-23AEKKKRKRAEK
40-55PSKKAKRKEKKAKSKP
307-321KKRHAKKKKKPMKWF
384-416APREKSNKKRDPNLKKMNKDERQELRRKKHDAR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSRENMSSSDVKAEKKKRKRAEKAEEEEELEIDVNLPEPPSKKAKRKEKKAKSKPAATETTDAANDGSATINAQEDKIHPSRSLQVPVAKGEEAGKRSDYGVWIGNLSFKTTKETLRRFFLDRGGIDETSITRLNLPVDHNTKQNKGFAYVDFTTEAVLNIAVTCTEKLLDGRKVLIKNAKSFEGRPAKTKAEEDAAKHGNTSTKAPSKRVFVGNLSFDITKDELAEHFAQAGTVEDVFLATFEDSGKCKGFGWVTFADIEAAEKAVKGFIFKQQQDDDEDSEAADSEKEKEKGSDSDSEEYTAEQKKRHAKKKKKPMKWFINRIHGRMMKLEFAEDKQTRYQKRYGKGRGGAAKHHGEEQAGNGAEEESIETLAAQAAAARDAPREKSNKKRDPNLKKMNKDERQELRRKKHDARLTAPGAALAKAQRSDKASGTAVAGTGKKVTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.66
3 0.76
4 0.78
5 0.86
6 0.91
7 0.92
8 0.93
9 0.94
10 0.92
11 0.88
12 0.8
13 0.71
14 0.61
15 0.5
16 0.39
17 0.28
18 0.19
19 0.13
20 0.1
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.11
25 0.13
26 0.17
27 0.27
28 0.36
29 0.45
30 0.55
31 0.66
32 0.74
33 0.84
34 0.9
35 0.92
36 0.94
37 0.95
38 0.96
39 0.95
40 0.94
41 0.91
42 0.87
43 0.83
44 0.76
45 0.68
46 0.58
47 0.51
48 0.42
49 0.33
50 0.25
51 0.18
52 0.14
53 0.11
54 0.1
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.18
64 0.22
65 0.23
66 0.22
67 0.24
68 0.32
69 0.35
70 0.39
71 0.36
72 0.37
73 0.37
74 0.39
75 0.39
76 0.31
77 0.27
78 0.26
79 0.27
80 0.24
81 0.24
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.23
86 0.19
87 0.17
88 0.18
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.18
93 0.17
94 0.19
95 0.18
96 0.15
97 0.2
98 0.22
99 0.29
100 0.34
101 0.42
102 0.44
103 0.48
104 0.52
105 0.5
106 0.5
107 0.49
108 0.45
109 0.37
110 0.37
111 0.34
112 0.3
113 0.26
114 0.24
115 0.2
116 0.17
117 0.18
118 0.13
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.14
123 0.16
124 0.2
125 0.24
126 0.26
127 0.32
128 0.35
129 0.38
130 0.38
131 0.39
132 0.33
133 0.32
134 0.32
135 0.26
136 0.29
137 0.25
138 0.24
139 0.21
140 0.2
141 0.17
142 0.15
143 0.14
144 0.07
145 0.07
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.12
157 0.15
158 0.15
159 0.18
160 0.22
161 0.23
162 0.26
163 0.31
164 0.29
165 0.32
166 0.33
167 0.34
168 0.31
169 0.31
170 0.37
171 0.4
172 0.38
173 0.37
174 0.4
175 0.39
176 0.39
177 0.39
178 0.32
179 0.28
180 0.3
181 0.27
182 0.29
183 0.29
184 0.27
185 0.26
186 0.25
187 0.22
188 0.21
189 0.21
190 0.2
191 0.24
192 0.27
193 0.3
194 0.32
195 0.33
196 0.36
197 0.37
198 0.33
199 0.28
200 0.3
201 0.27
202 0.25
203 0.23
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.06
212 0.1
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.12
238 0.13
239 0.12
240 0.16
241 0.15
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.13
246 0.11
247 0.11
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.08
257 0.14
258 0.22
259 0.23
260 0.28
261 0.29
262 0.3
263 0.33
264 0.34
265 0.29
266 0.23
267 0.22
268 0.17
269 0.15
270 0.14
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.19
280 0.22
281 0.24
282 0.28
283 0.26
284 0.29
285 0.29
286 0.29
287 0.26
288 0.24
289 0.25
290 0.24
291 0.23
292 0.22
293 0.28
294 0.36
295 0.46
296 0.56
297 0.63
298 0.68
299 0.77
300 0.86
301 0.91
302 0.91
303 0.92
304 0.93
305 0.93
306 0.93
307 0.93
308 0.9
309 0.9
310 0.83
311 0.74
312 0.72
313 0.64
314 0.55
315 0.49
316 0.42
317 0.35
318 0.31
319 0.31
320 0.24
321 0.22
322 0.3
323 0.26
324 0.27
325 0.31
326 0.38
327 0.41
328 0.44
329 0.51
330 0.49
331 0.57
332 0.65
333 0.67
334 0.68
335 0.69
336 0.72
337 0.72
338 0.68
339 0.64
340 0.6
341 0.56
342 0.48
343 0.46
344 0.38
345 0.31
346 0.29
347 0.25
348 0.25
349 0.2
350 0.18
351 0.16
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.12
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.04
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.08
368 0.08
369 0.11
370 0.14
371 0.19
372 0.24
373 0.32
374 0.4
375 0.5
376 0.6
377 0.67
378 0.73
379 0.8
380 0.85
381 0.87
382 0.9
383 0.91
384 0.9
385 0.89
386 0.9
387 0.91
388 0.88
389 0.84
390 0.82
391 0.82
392 0.82
393 0.83
394 0.83
395 0.83
396 0.84
397 0.86
398 0.85
399 0.85
400 0.84
401 0.82
402 0.78
403 0.77
404 0.71
405 0.65
406 0.56
407 0.48
408 0.4
409 0.32
410 0.29
411 0.21
412 0.21
413 0.23
414 0.24
415 0.27
416 0.3
417 0.33
418 0.33
419 0.36
420 0.33
421 0.31
422 0.31
423 0.27
424 0.24
425 0.25
426 0.23
427 0.19
428 0.2