Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U9W4N5

Protein Details
Accession U9W4N5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-78AKTIAKTTPHHRHNHHRKMASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-121RSNRGGRGGRGPKSGGHGGGHRKGGG
396-433GKGRAAGGGGGGGGKRGGRGGGERKDSGKGGRGREEKG
Subcellular Location(s) mito 26.5, cyto_mito 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002745  Ptrans_KptA/Tpt1  
IPR042081  RNA_2'-PTrans_C  
IPR042080  RNA_2'-PTrans_N  
Gene Ontology GO:0000215  F:tRNA 2'-phosphotransferase activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
KEGG ncr:NCU06254  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01885  PTS_2-RNA  
Amino Acid Sequences MRNIGNGNLLLTAAGGVGKLRFTINPTHPRLSRLLIAGQQSRASIHSTTTTTTTTTIAKTIAKTTPHHRHNHHRKMASPAEDQATHHQDLADRASRSNRGGRGGRGPKSGGHGGGHRKGGGRDVDLSRALSRLLRHQAASAGITLDAEGYAPLDKVLAWGPIRSLKPTFPEILKAVKESDKQRFAIKLAPGKEKEDGEKSEEPGDWLIRANQGHSIKLESEGLLRRLVLGRGGGGGQQQQQQQGQETEGEDGGTIPIPETVVHGTYFAFWDKIIQSGGLKPMGRNHVHFSTGLPEDTERGVISGMRSDAEVLVFVDVERSIRDAEEAEKEDKEGKGIKWWMSDNGVVLTEGDKDGLVPLKYFKEVRGRRQGVGLLWKDGHKVADLPEGLEIRMPMGKGRAAGGGGGGGGKRGGRGGGERKDSGKGGRGREEKGNGEEAKPLEMDSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.05
4 0.06
5 0.07
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.13
10 0.23
11 0.31
12 0.41
13 0.47
14 0.54
15 0.54
16 0.57
17 0.58
18 0.53
19 0.48
20 0.41
21 0.38
22 0.35
23 0.4
24 0.4
25 0.38
26 0.35
27 0.31
28 0.29
29 0.26
30 0.25
31 0.19
32 0.17
33 0.19
34 0.19
35 0.21
36 0.22
37 0.22
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.17
45 0.19
46 0.2
47 0.23
48 0.26
49 0.28
50 0.32
51 0.4
52 0.48
53 0.54
54 0.61
55 0.63
56 0.7
57 0.77
58 0.84
59 0.83
60 0.77
61 0.73
62 0.74
63 0.73
64 0.68
65 0.59
66 0.52
67 0.47
68 0.44
69 0.42
70 0.41
71 0.39
72 0.33
73 0.31
74 0.28
75 0.25
76 0.27
77 0.3
78 0.29
79 0.24
80 0.25
81 0.29
82 0.32
83 0.34
84 0.38
85 0.35
86 0.36
87 0.39
88 0.41
89 0.47
90 0.52
91 0.52
92 0.49
93 0.47
94 0.42
95 0.44
96 0.43
97 0.34
98 0.28
99 0.3
100 0.34
101 0.37
102 0.37
103 0.32
104 0.32
105 0.31
106 0.34
107 0.3
108 0.24
109 0.25
110 0.25
111 0.27
112 0.26
113 0.26
114 0.22
115 0.2
116 0.19
117 0.15
118 0.15
119 0.19
120 0.25
121 0.25
122 0.25
123 0.25
124 0.26
125 0.25
126 0.25
127 0.18
128 0.12
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.17
149 0.18
150 0.2
151 0.21
152 0.19
153 0.22
154 0.25
155 0.26
156 0.21
157 0.23
158 0.23
159 0.25
160 0.24
161 0.22
162 0.21
163 0.23
164 0.27
165 0.29
166 0.35
167 0.35
168 0.35
169 0.37
170 0.36
171 0.34
172 0.35
173 0.33
174 0.31
175 0.31
176 0.37
177 0.35
178 0.36
179 0.37
180 0.32
181 0.31
182 0.3
183 0.27
184 0.27
185 0.27
186 0.26
187 0.26
188 0.25
189 0.23
190 0.19
191 0.18
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.16
199 0.16
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.09
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.08
223 0.1
224 0.13
225 0.15
226 0.16
227 0.18
228 0.18
229 0.19
230 0.18
231 0.16
232 0.13
233 0.13
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.11
264 0.13
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.19
269 0.26
270 0.27
271 0.27
272 0.3
273 0.29
274 0.29
275 0.29
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.2
280 0.15
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.13
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.1
312 0.15
313 0.18
314 0.19
315 0.19
316 0.2
317 0.23
318 0.22
319 0.22
320 0.22
321 0.19
322 0.25
323 0.29
324 0.31
325 0.31
326 0.33
327 0.33
328 0.31
329 0.31
330 0.24
331 0.21
332 0.19
333 0.15
334 0.14
335 0.12
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.08
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.15
346 0.17
347 0.2
348 0.21
349 0.24
350 0.31
351 0.37
352 0.46
353 0.54
354 0.56
355 0.54
356 0.57
357 0.56
358 0.49
359 0.52
360 0.44
361 0.37
362 0.35
363 0.35
364 0.32
365 0.31
366 0.27
367 0.19
368 0.19
369 0.17
370 0.22
371 0.22
372 0.2
373 0.22
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.18
378 0.13
379 0.14
380 0.14
381 0.12
382 0.14
383 0.16
384 0.15
385 0.17
386 0.17
387 0.15
388 0.15
389 0.13
390 0.11
391 0.09
392 0.1
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.1
401 0.18
402 0.27
403 0.34
404 0.4
405 0.43
406 0.44
407 0.48
408 0.48
409 0.44
410 0.44
411 0.42
412 0.43
413 0.5
414 0.53
415 0.53
416 0.59
417 0.61
418 0.58
419 0.55
420 0.57
421 0.49
422 0.45
423 0.46
424 0.39
425 0.35
426 0.3