Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S6CGF1

Protein Details
Accession A0A2S6CGF1    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21SADNKGKKRKSGDNVEPIAKHydrophilic
53-76TTVAEKPSREKKTNKPAKKVVEEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-11GKKRK
58-70KPSREKKTNKPAK
252-301WKGAKAVKGNGKARPRNRIEGSRLRKGTDREGWEKRITRESERRKEKAAK
335-340PKKSKK
377-381RKTKS
389-396EKTKKRET
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.833, cyto 10.5, mito_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSADNKGKKRKSGDNVEPIAKKVKTTAVVNKSADRPSPAKSALKGSKTTKVETTVAEKPSREKKTNKPAKKVVEEVVVEEEPVAAEADDESDGGAELTPDQTAALLAGFSSDESENEDDVDRDQDGIPIERLPALPKTEKEIARELKISRIKPKKDGTADPEATPGVVYMSRLPHGFYEKQLRAYLAQFGDVTNLRLARNKKTGKSKHYAFVEFAASTVADIVVKTMDKYLMFGHILQCKRVPPEQVKEGIWKGAKAVKGNGKARPRNRIEGSRLRKGTDREGWEKRITRESERRKEKAAKLAEMGYDFDMPDVKGVEAVSAPKEIEQAKGGAEPKKSKKAVKNAEEEAPIVEETVVAAVENGANGKAVVAEKTTKRKTKSGEVKTTTEKTKKRETKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.8
3 0.8
4 0.74
5 0.66
6 0.64
7 0.54
8 0.44
9 0.37
10 0.37
11 0.35
12 0.4
13 0.47
14 0.47
15 0.54
16 0.56
17 0.58
18 0.57
19 0.55
20 0.51
21 0.47
22 0.42
23 0.38
24 0.43
25 0.43
26 0.42
27 0.41
28 0.48
29 0.5
30 0.53
31 0.55
32 0.53
33 0.57
34 0.55
35 0.56
36 0.5
37 0.47
38 0.44
39 0.4
40 0.42
41 0.4
42 0.41
43 0.41
44 0.38
45 0.41
46 0.48
47 0.54
48 0.55
49 0.56
50 0.61
51 0.69
52 0.79
53 0.81
54 0.81
55 0.82
56 0.84
57 0.83
58 0.77
59 0.7
60 0.66
61 0.57
62 0.49
63 0.45
64 0.35
65 0.28
66 0.23
67 0.19
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.16
122 0.19
123 0.19
124 0.24
125 0.3
126 0.32
127 0.33
128 0.39
129 0.38
130 0.38
131 0.41
132 0.36
133 0.37
134 0.41
135 0.41
136 0.43
137 0.48
138 0.49
139 0.53
140 0.58
141 0.57
142 0.57
143 0.59
144 0.55
145 0.56
146 0.54
147 0.47
148 0.43
149 0.34
150 0.28
151 0.23
152 0.17
153 0.08
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.16
163 0.16
164 0.18
165 0.26
166 0.26
167 0.29
168 0.29
169 0.28
170 0.25
171 0.25
172 0.25
173 0.16
174 0.16
175 0.13
176 0.12
177 0.14
178 0.12
179 0.12
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.15
184 0.17
185 0.2
186 0.29
187 0.32
188 0.37
189 0.46
190 0.54
191 0.56
192 0.61
193 0.59
194 0.57
195 0.57
196 0.53
197 0.43
198 0.38
199 0.32
200 0.24
201 0.21
202 0.14
203 0.1
204 0.08
205 0.07
206 0.05
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.14
222 0.2
223 0.2
224 0.2
225 0.22
226 0.21
227 0.24
228 0.26
229 0.28
230 0.28
231 0.34
232 0.38
233 0.4
234 0.39
235 0.4
236 0.38
237 0.37
238 0.31
239 0.25
240 0.22
241 0.22
242 0.23
243 0.2
244 0.25
245 0.27
246 0.35
247 0.4
248 0.45
249 0.51
250 0.57
251 0.6
252 0.65
253 0.63
254 0.63
255 0.64
256 0.65
257 0.63
258 0.66
259 0.68
260 0.67
261 0.63
262 0.57
263 0.56
264 0.52
265 0.51
266 0.48
267 0.48
268 0.47
269 0.51
270 0.55
271 0.57
272 0.58
273 0.54
274 0.54
275 0.51
276 0.52
277 0.57
278 0.62
279 0.66
280 0.71
281 0.7
282 0.7
283 0.75
284 0.72
285 0.71
286 0.67
287 0.59
288 0.53
289 0.52
290 0.46
291 0.38
292 0.33
293 0.25
294 0.19
295 0.16
296 0.13
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.14
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.19
318 0.23
319 0.25
320 0.3
321 0.37
322 0.44
323 0.53
324 0.57
325 0.61
326 0.66
327 0.72
328 0.76
329 0.76
330 0.76
331 0.71
332 0.71
333 0.64
334 0.56
335 0.46
336 0.37
337 0.28
338 0.2
339 0.15
340 0.1
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.19
359 0.26
360 0.36
361 0.46
362 0.51
363 0.55
364 0.62
365 0.66
366 0.7
367 0.74
368 0.75
369 0.76
370 0.75
371 0.76
372 0.77
373 0.77
374 0.75
375 0.74
376 0.7
377 0.66
378 0.71