FuNGI

A0A2S6C4S1

Protein Details

Accession

A0A2S6C4S1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-33	TMSRPTSMVERQPKRKKEQRTDIWSNLLR	Hydrophilic
72-98	PPPAQPPTRNQDKRQQKPKGELRLSNK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 10, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008467 Dynein1_light_intermed_chain
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005868 C:cytoplasmic dynein complex GO:0005874 C:microtubule GO:0007018 P:microtubule-based movement

Amino Acid Sequences

MATTTMSRPTSMVERQPKRKKEQRTDIWSNLLRQTRDAQARNRTQAVQHRELIVCGGSPDDQRSFIQSLARPPPAQPPTRNQDKRQQKPKGELRLSNKYAYGYGHVTLYSPPQQSGTGVQVLGVESEEVACLEVHTLPEPTEEYVGTLRGLLQGKKHSEGEPPDAEQNESEDTATEGPRLPGVCILLSWKEPWKFLVQLKRWLQLLAQALLQPGIAATDPLDILKEAQLSITVVAQHTEAQEELFKEGYKEEDFDYISQCLRTVILPLHPLSALIYTTSAAPPQPPGSSLSEPQKVVFNSIGLDLATLSPKRTRSGSAVEKKEELAVKHEFMDRMAIVIPAGWDSPAFIRTLSETFSPEDIVNGWLADLQPPPPPKPQASPPTEDSKSAEKAASGGAEVYESSPVLEDAHDMAEPMSPSKMLPSAVQSYERRVLDPQAHKAPKPPQIEVVTKADQRFLAEMREHLQQLEAQDRERESKGHNSGVSHTGLSGSSTRVGGLPAGESTGALSELGDVSFNVGGVSYDTITAEAAINALKRPQTRDNGDGPMSPPSSTRTHTPKPRGPGGNRIDASGSKETLGSGMKSPESKAPLDVDKLEEYFQSLLNKSGGSGSKSSTPSKKAGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.64
3	0.74
4	0.8
5	0.83
6	0.86
7	0.87
8	0.88
9	0.89
10	0.89
11	0.89
12	0.89
13	0.84
14	0.85
15	0.78
16	0.71
17	0.67
18	0.63
19	0.54
20	0.47
21	0.46
22	0.46
23	0.51
24	0.53
25	0.54
26	0.57
27	0.65
28	0.69
29	0.68
30	0.62
31	0.59
32	0.62
33	0.63
34	0.59
35	0.54
36	0.52
37	0.48
38	0.46
39	0.41
40	0.32
41	0.23
42	0.17
43	0.15
44	0.12
45	0.14
46	0.17
47	0.17
48	0.19
49	0.2
50	0.24
51	0.24
52	0.24
53	0.29
54	0.28
55	0.34
56	0.39
57	0.44
58	0.4
59	0.4
60	0.48
61	0.49
62	0.53
63	0.5
64	0.52
65	0.56
66	0.66
67	0.72
68	0.68
69	0.7
70	0.74
71	0.8
72	0.82
73	0.83
74	0.79
75	0.82
76	0.86
77	0.87
78	0.83
79	0.81
80	0.79
81	0.79
82	0.75
83	0.67
84	0.59
85	0.49
86	0.43
87	0.36
88	0.31
89	0.23
90	0.2
91	0.18
92	0.17
93	0.17
94	0.16
95	0.2
96	0.22
97	0.21
98	0.2
99	0.21
100	0.22
101	0.22
102	0.24
103	0.22
104	0.18
105	0.16
106	0.16
107	0.15
108	0.15
109	0.14
110	0.11
111	0.08
112	0.05
113	0.06
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.06
120	0.07
121	0.07
122	0.09
123	0.09
124	0.09
125	0.1
126	0.11
127	0.11
128	0.12
129	0.11
130	0.11
131	0.11
132	0.12
133	0.11
134	0.09
135	0.09
136	0.13
137	0.16
138	0.16
139	0.19
140	0.26
141	0.29
142	0.32
143	0.34
144	0.31
145	0.34
146	0.37
147	0.4
148	0.35
149	0.34
150	0.34
151	0.33
152	0.32
153	0.26
154	0.23
155	0.18
156	0.16
157	0.14
158	0.1
159	0.11
160	0.12
161	0.12
162	0.11
163	0.1
164	0.1
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.11
169	0.12
170	0.11
171	0.1
172	0.12
173	0.12
174	0.12
175	0.14
176	0.19
177	0.19
178	0.2
179	0.22
180	0.23
181	0.26
182	0.31
183	0.39
184	0.37
185	0.45
186	0.48
187	0.5
188	0.47
189	0.42
190	0.37
191	0.32
192	0.31
193	0.22
194	0.19
195	0.17
196	0.16
197	0.16
198	0.15
199	0.09
200	0.06
201	0.05
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.08
234	0.09
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.12
240	0.12
241	0.13
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.11
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.1
253	0.12
254	0.12
255	0.13
256	0.12
257	0.12
258	0.11
259	0.1
260	0.08
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.12
274	0.16
275	0.18
276	0.21
277	0.24
278	0.26
279	0.26
280	0.26
281	0.27
282	0.22
283	0.22
284	0.19
285	0.14
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.07
290	0.07
291	0.05
292	0.05
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.09
297	0.11
298	0.12
299	0.13
300	0.15
301	0.17
302	0.24
303	0.33
304	0.39
305	0.42
306	0.42
307	0.41
308	0.39
309	0.39
310	0.33
311	0.24
312	0.2
313	0.18
314	0.17
315	0.18
316	0.19
317	0.17
318	0.15
319	0.16
320	0.11
321	0.1
322	0.1
323	0.08
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.06
337	0.07
338	0.08
339	0.09
340	0.09
341	0.1
342	0.11
343	0.11
344	0.12
345	0.11
346	0.1
347	0.09
348	0.09
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.05
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.12
358	0.14
359	0.17
360	0.21
361	0.24
362	0.25
363	0.28
364	0.36
365	0.41
366	0.43
367	0.45
368	0.44
369	0.48
370	0.47
371	0.44
372	0.39
373	0.34
374	0.32
375	0.28
376	0.25
377	0.17
378	0.17
379	0.16
380	0.14
381	0.09
382	0.07
383	0.06
384	0.05
385	0.06
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.1
408	0.09
409	0.1
410	0.13
411	0.17
412	0.19
413	0.25
414	0.24
415	0.28
416	0.33
417	0.33
418	0.3
419	0.27
420	0.29
421	0.32
422	0.37
423	0.39
424	0.42
425	0.45
426	0.44
427	0.5
428	0.53
429	0.53
430	0.52
431	0.47
432	0.44
433	0.46
434	0.49
435	0.46
436	0.45
437	0.41
438	0.4
439	0.39
440	0.34
441	0.29
442	0.27
443	0.25
444	0.2
445	0.19
446	0.17
447	0.18
448	0.19
449	0.22
450	0.21
451	0.19
452	0.18
453	0.16
454	0.17
455	0.22
456	0.21
457	0.18
458	0.21
459	0.23
460	0.26
461	0.26
462	0.26
463	0.23
464	0.31
465	0.34
466	0.36
467	0.36
468	0.34
469	0.36
470	0.37
471	0.35
472	0.26
473	0.21
474	0.17
475	0.15
476	0.15
477	0.13
478	0.11
479	0.11
480	0.11
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.09
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.05
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.06
517	0.06
518	0.07
519	0.08
520	0.09
521	0.12
522	0.15
523	0.18
524	0.24
525	0.32
526	0.39
527	0.45
528	0.5
529	0.52
530	0.54
531	0.53
532	0.49
533	0.43
534	0.4
535	0.35
536	0.3
537	0.26
538	0.24
539	0.26
540	0.26
541	0.32
542	0.35
543	0.44
544	0.53
545	0.62
546	0.65
547	0.69
548	0.77
549	0.78
550	0.74
551	0.75
552	0.71
553	0.71
554	0.64
555	0.57
556	0.51
557	0.43
558	0.44
559	0.38
560	0.32
561	0.23
562	0.22
563	0.21
564	0.21
565	0.22
566	0.17
567	0.17
568	0.19
569	0.22
570	0.23
571	0.25
572	0.29
573	0.31
574	0.3
575	0.3
576	0.31
577	0.33
578	0.35
579	0.35
580	0.33
581	0.32
582	0.32
583	0.3
584	0.25
585	0.23
586	0.2
587	0.21
588	0.22
589	0.2
590	0.22
591	0.22
592	0.22
593	0.2
594	0.25
595	0.26
596	0.25
597	0.26
598	0.26
599	0.32
600	0.36
601	0.43
602	0.44
603	0.46

A0A2S6C4S1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer