Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2S6C0C1

Protein Details
Accession A0A2S6C0C1    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
675-706LAKVEKANPTKKKKEGKAHKGRGKKRNTLGDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-34RARHGPIGGIKGPAVPPRKRAPAKQAAP
522-530KRGRGRPKK
677-700KVEKANPTKKKKEGKAHKGRGKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MPGPVPRARHGPIGGIKGPAVPPRKRAPAKQAAPAEKKCPNKECGSTRFSEDDGKIVCLDCYTEIAENNIVAEVTFEENAGGRATVQGGTVNENSRHARTLGSSAYRKVGGGERNSLADVQNAGRKALEQLCPKLGILQQVQIQAEQIWVLAANINFSAGRRTDEVVAACLYAACRRQRDNKILLMDIAELLQINVFRLGEVYKDMCRELYITQDHSVGHQHLVELEPLIYKYCDKLQFAEKTKDVASDALKIIRRMNRDWIVSGRHPAGLCGACIILAARMNNFQRTVREVVFVSKVADVTIAKRVEEFRRTKASGLTVDEFRKYANRMVHQHNPPSFGLPDHNARKFARARARREEHMKMLELRESQMRSPSAQHIIIPDDLSEGSSRLSSVEAGTPAPDQTVPVPVQHVPAAAPMVAVQGPASPVEHQSTPPPTQGDEAPNNGLLEPNAKRKRKDEAGEPPSADPESAPRVESPKRQRTEGPEPQPSIRYDADGFAIPALPVQAVAEALRASEEPTGEKRGRGRPKKEPVQAPEVEISEEELAEEDYLETQIEEALANGEVQEMQSEVEKLKEAEKIEAEQLRAATLAAEQMKVDSEKGRQARLARGVDYFGKAPDWEPGVILTAAELEAEFENDPEVANCILSETERKIKEQIWVAHNEDWLRKQAEKELLAKVEKANPTKKKKEGKAHKGRGKKRNTLGDGTVLTESSTPIETPADAARAMLEKRAPMKSQHVDFSALQRIYGRETPSRAGSATPSESRSQTPATREQSAGPVEDEDDGSDEGDAEVQENPAKLVQPATWDNLDEEPAAEEEDDEDLYKLATEGHDEFGSVYGGDDDYGSGEEYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.42
3 0.39
4 0.36
5 0.38
6 0.37
7 0.39
8 0.36
9 0.41
10 0.48
11 0.58
12 0.62
13 0.67
14 0.7
15 0.73
16 0.75
17 0.77
18 0.78
19 0.77
20 0.79
21 0.76
22 0.73
23 0.7
24 0.73
25 0.73
26 0.7
27 0.66
28 0.64
29 0.69
30 0.7
31 0.7
32 0.66
33 0.6
34 0.59
35 0.56
36 0.5
37 0.48
38 0.4
39 0.38
40 0.34
41 0.33
42 0.28
43 0.26
44 0.24
45 0.17
46 0.18
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.16
53 0.17
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.09
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.12
76 0.16
77 0.19
78 0.23
79 0.23
80 0.27
81 0.3
82 0.29
83 0.31
84 0.27
85 0.25
86 0.23
87 0.27
88 0.28
89 0.33
90 0.34
91 0.34
92 0.37
93 0.36
94 0.33
95 0.31
96 0.32
97 0.31
98 0.31
99 0.35
100 0.33
101 0.34
102 0.34
103 0.33
104 0.27
105 0.22
106 0.2
107 0.17
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.18
112 0.18
113 0.21
114 0.25
115 0.29
116 0.31
117 0.35
118 0.37
119 0.38
120 0.37
121 0.36
122 0.32
123 0.32
124 0.27
125 0.27
126 0.28
127 0.31
128 0.32
129 0.27
130 0.26
131 0.2
132 0.18
133 0.14
134 0.1
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.13
146 0.11
147 0.14
148 0.15
149 0.17
150 0.18
151 0.21
152 0.22
153 0.2
154 0.19
155 0.17
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.17
161 0.2
162 0.24
163 0.3
164 0.4
165 0.48
166 0.56
167 0.58
168 0.59
169 0.57
170 0.54
171 0.49
172 0.4
173 0.32
174 0.23
175 0.18
176 0.12
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.18
198 0.19
199 0.21
200 0.21
201 0.23
202 0.22
203 0.22
204 0.25
205 0.19
206 0.17
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.16
221 0.2
222 0.2
223 0.24
224 0.3
225 0.38
226 0.44
227 0.48
228 0.43
229 0.41
230 0.4
231 0.38
232 0.31
233 0.26
234 0.21
235 0.19
236 0.19
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.28
241 0.29
242 0.32
243 0.31
244 0.38
245 0.38
246 0.38
247 0.39
248 0.37
249 0.38
250 0.36
251 0.37
252 0.3
253 0.28
254 0.26
255 0.24
256 0.24
257 0.19
258 0.17
259 0.13
260 0.12
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.13
269 0.15
270 0.17
271 0.18
272 0.18
273 0.19
274 0.23
275 0.26
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.22
280 0.22
281 0.21
282 0.18
283 0.14
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.16
290 0.15
291 0.14
292 0.16
293 0.19
294 0.23
295 0.31
296 0.33
297 0.31
298 0.39
299 0.4
300 0.4
301 0.39
302 0.38
303 0.32
304 0.33
305 0.3
306 0.26
307 0.27
308 0.26
309 0.24
310 0.2
311 0.2
312 0.18
313 0.2
314 0.22
315 0.26
316 0.32
317 0.38
318 0.46
319 0.49
320 0.54
321 0.51
322 0.49
323 0.43
324 0.4
325 0.34
326 0.26
327 0.23
328 0.19
329 0.25
330 0.27
331 0.29
332 0.3
333 0.3
334 0.36
335 0.37
336 0.42
337 0.44
338 0.46
339 0.51
340 0.58
341 0.62
342 0.62
343 0.65
344 0.62
345 0.57
346 0.51
347 0.46
348 0.39
349 0.35
350 0.32
351 0.26
352 0.23
353 0.21
354 0.2
355 0.18
356 0.2
357 0.19
358 0.17
359 0.19
360 0.21
361 0.21
362 0.2
363 0.2
364 0.17
365 0.18
366 0.18
367 0.15
368 0.12
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.11
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.12
419 0.16
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.16
424 0.17
425 0.19
426 0.21
427 0.18
428 0.19
429 0.18
430 0.18
431 0.17
432 0.16
433 0.14
434 0.09
435 0.11
436 0.12
437 0.21
438 0.29
439 0.32
440 0.34
441 0.37
442 0.45
443 0.48
444 0.5
445 0.48
446 0.51
447 0.53
448 0.54
449 0.52
450 0.44
451 0.38
452 0.35
453 0.26
454 0.15
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.16
461 0.19
462 0.28
463 0.35
464 0.41
465 0.42
466 0.44
467 0.47
468 0.51
469 0.58
470 0.6
471 0.57
472 0.54
473 0.54
474 0.53
475 0.52
476 0.44
477 0.38
478 0.29
479 0.24
480 0.18
481 0.17
482 0.17
483 0.14
484 0.13
485 0.09
486 0.09
487 0.07
488 0.06
489 0.05
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.11
506 0.17
507 0.17
508 0.19
509 0.24
510 0.33
511 0.43
512 0.5
513 0.56
514 0.6
515 0.69
516 0.77
517 0.79
518 0.77
519 0.72
520 0.7
521 0.64
522 0.56
523 0.48
524 0.38
525 0.31
526 0.23
527 0.19
528 0.12
529 0.1
530 0.08
531 0.06
532 0.06
533 0.05
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.04
549 0.05
550 0.04
551 0.04
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.08
560 0.09
561 0.11
562 0.14
563 0.14
564 0.16
565 0.17
566 0.18
567 0.22
568 0.24
569 0.22
570 0.2
571 0.19
572 0.16
573 0.15
574 0.13
575 0.09
576 0.06
577 0.1
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.1
583 0.11
584 0.12
585 0.11
586 0.12
587 0.19
588 0.22
589 0.23
590 0.26
591 0.28
592 0.34
593 0.39
594 0.39
595 0.34
596 0.32
597 0.33
598 0.31
599 0.3
600 0.24
601 0.17
602 0.15
603 0.14
604 0.13
605 0.14
606 0.15
607 0.13
608 0.12
609 0.12
610 0.13
611 0.13
612 0.12
613 0.08
614 0.07
615 0.06
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.07
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.07
632 0.07
633 0.08
634 0.11
635 0.13
636 0.21
637 0.22
638 0.24
639 0.26
640 0.28
641 0.33
642 0.38
643 0.41
644 0.38
645 0.43
646 0.45
647 0.45
648 0.45
649 0.41
650 0.36
651 0.31
652 0.31
653 0.29
654 0.27
655 0.26
656 0.31
657 0.36
658 0.36
659 0.38
660 0.38
661 0.39
662 0.39
663 0.39
664 0.34
665 0.34
666 0.36
667 0.39
668 0.44
669 0.49
670 0.58
671 0.65
672 0.72
673 0.75
674 0.79
675 0.83
676 0.85
677 0.86
678 0.88
679 0.9
680 0.9
681 0.9
682 0.9
683 0.89
684 0.87
685 0.85
686 0.83
687 0.82
688 0.79
689 0.74
690 0.66
691 0.62
692 0.53
693 0.46
694 0.37
695 0.27
696 0.22
697 0.16
698 0.15
699 0.11
700 0.1
701 0.08
702 0.09
703 0.1
704 0.09
705 0.11
706 0.12
707 0.12
708 0.11
709 0.11
710 0.11
711 0.14
712 0.15
713 0.16
714 0.16
715 0.19
716 0.24
717 0.29
718 0.3
719 0.31
720 0.4
721 0.44
722 0.47
723 0.48
724 0.45
725 0.44
726 0.43
727 0.44
728 0.44
729 0.36
730 0.32
731 0.29
732 0.28
733 0.3
734 0.33
735 0.32
736 0.28
737 0.32
738 0.35
739 0.36
740 0.37
741 0.32
742 0.29
743 0.27
744 0.28
745 0.3
746 0.29
747 0.29
748 0.31
749 0.32
750 0.33
751 0.34
752 0.34
753 0.33
754 0.36
755 0.42
756 0.44
757 0.46
758 0.45
759 0.43
760 0.44
761 0.41
762 0.37
763 0.29
764 0.24
765 0.21
766 0.21
767 0.19
768 0.13
769 0.14
770 0.12
771 0.11
772 0.1
773 0.09
774 0.08
775 0.09
776 0.08
777 0.07
778 0.08
779 0.09
780 0.11
781 0.11
782 0.12
783 0.13
784 0.14
785 0.14
786 0.15
787 0.15
788 0.2
789 0.23
790 0.26
791 0.26
792 0.26
793 0.28
794 0.27
795 0.27
796 0.21
797 0.18
798 0.15
799 0.14
800 0.14
801 0.12
802 0.1
803 0.1
804 0.11
805 0.11
806 0.1
807 0.1
808 0.09
809 0.09
810 0.09
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.12
815 0.13
816 0.17
817 0.17
818 0.17
819 0.18
820 0.17
821 0.17
822 0.13
823 0.11
824 0.09
825 0.09
826 0.09
827 0.08
828 0.07
829 0.08
830 0.09