FuNGI

A0A2S6CLH3

Protein Details

Accession

A0A2S6CLH3

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-167	AEEEAERERKKKKKEKKRDKPSRRRRGEDEDDF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
130-161	KRKRSAEEEAERERKKKKKEKKRDKPSRRRRG
175-194	GKRSRKGKGSKPSGSSKRER

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035441 TFIIS/LEDGF_dom_sf IPR017923 TFIIS_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08711 Med26
PROSITE	View protein in PROSITE PS51319 TFIIS_N

Amino Acid Sequences

MEDLEQPETPTINSREDEPEGNNDQTDPLRPELEEENDAGGTPPMADPTADTEVQEELPTNGADEANDDEADGGNPANTDRAVQDDEDDDSELEELDEQEFADFDATALNIPDKPIDVDESNVALLGVHKRKRSAEEEAERERKKKKKEKKRDKPSRRRRGEDEDDFEGGPEMDGKRSRKGKGSKPSGSSKRERTPIDLDSLPPDERRRRALDAKIDEALKTHRVSRRKAAQDMEERADGELSEMRTRIAKACEADAQARQRGEVAVQKLKILPEVVELMNRNTIQSQLVDPDINILESVRFMLEPADQDAALPNYQIQRELFAILSKLNIGKEALVASAIGKVVLFYTKSSQPQPDIKRQAEQLVAEWTRVILNKGKDARSKPVETRGYDPLVAAASQRMGGSQVDRTAVAAEKRKRALELPGPANRARVLGGVGSYSIAPVSNLSNAQGVSARKTQGANDEAFRRIAARSSQKAGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.32
3	0.34
4	0.37
5	0.32
6	0.36
7	0.37
8	0.37
9	0.34
10	0.29
11	0.28
12	0.27
13	0.29
14	0.26
15	0.24
16	0.24
17	0.23
18	0.26
19	0.28
20	0.31
21	0.28
22	0.25
23	0.24
24	0.22
25	0.23
26	0.2
27	0.15
28	0.1
29	0.1
30	0.09
31	0.08
32	0.09
33	0.08
34	0.09
35	0.14
36	0.19
37	0.18
38	0.18
39	0.17
40	0.19
41	0.19
42	0.19
43	0.14
44	0.1
45	0.12
46	0.11
47	0.11
48	0.11
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.12
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.11
59	0.1
60	0.07
61	0.06
62	0.06
63	0.07
64	0.08
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.12
69	0.14
70	0.14
71	0.15
72	0.15
73	0.17
74	0.17
75	0.17
76	0.13
77	0.11
78	0.11
79	0.1
80	0.08
81	0.07
82	0.07
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.05
91	0.05
92	0.05
93	0.05
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.07
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.09
102	0.1
103	0.13
104	0.13
105	0.14
106	0.14
107	0.15
108	0.14
109	0.13
110	0.11
111	0.08
112	0.09
113	0.15
114	0.21
115	0.25
116	0.27
117	0.3
118	0.33
119	0.39
120	0.43
121	0.44
122	0.46
123	0.5
124	0.55
125	0.61
126	0.67
127	0.64
128	0.63
129	0.63
130	0.61
131	0.63
132	0.67
133	0.69
134	0.72
135	0.81
136	0.88
137	0.91
138	0.95
139	0.96
140	0.97
141	0.97
142	0.97
143	0.97
144	0.95
145	0.9
146	0.86
147	0.85
148	0.83
149	0.79
150	0.73
151	0.65
152	0.57
153	0.49
154	0.42
155	0.32
156	0.22
157	0.14
158	0.11
159	0.08
160	0.09
161	0.15
162	0.17
163	0.24
164	0.29
165	0.32
166	0.38
167	0.46
168	0.52
169	0.58
170	0.66
171	0.65
172	0.65
173	0.73
174	0.73
175	0.71
176	0.69
177	0.67
178	0.64
179	0.64
180	0.6
181	0.55
182	0.52
183	0.47
184	0.44
185	0.37
186	0.3
187	0.26
188	0.27
189	0.23
190	0.2
191	0.23
192	0.25
193	0.26
194	0.31
195	0.32
196	0.35
197	0.41
198	0.45
199	0.48
200	0.46
201	0.46
202	0.43
203	0.39
204	0.34
205	0.28
206	0.24
207	0.19
208	0.16
209	0.19
210	0.22
211	0.27
212	0.31
213	0.38
214	0.45
215	0.47
216	0.51
217	0.48
218	0.5
219	0.51
220	0.52
221	0.46
222	0.37
223	0.32
224	0.27
225	0.24
226	0.17
227	0.11
228	0.09
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.1
234	0.1
235	0.12
236	0.12
237	0.13
238	0.13
239	0.15
240	0.17
241	0.18
242	0.19
243	0.2
244	0.21
245	0.22
246	0.21
247	0.19
248	0.17
249	0.16
250	0.16
251	0.16
252	0.18
253	0.19
254	0.19
255	0.2
256	0.21
257	0.21
258	0.2
259	0.16
260	0.12
261	0.09
262	0.11
263	0.11
264	0.12
265	0.13
266	0.12
267	0.15
268	0.15
269	0.14
270	0.11
271	0.12
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.1
281	0.09
282	0.08
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.09
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.11
298	0.11
299	0.1
300	0.09
301	0.09
302	0.11
303	0.12
304	0.14
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.15
309	0.13
310	0.11
311	0.12
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.12
336	0.17
337	0.2
338	0.24
339	0.27
340	0.3
341	0.39
342	0.45
343	0.51
344	0.55
345	0.54
346	0.55
347	0.53
348	0.52
349	0.46
350	0.4
351	0.32
352	0.31
353	0.29
354	0.25
355	0.23
356	0.19
357	0.18
358	0.18
359	0.19
360	0.16
361	0.18
362	0.26
363	0.32
364	0.37
365	0.42
366	0.45
367	0.52
368	0.53
369	0.57
370	0.54
371	0.58
372	0.6
373	0.56
374	0.56
375	0.52
376	0.48
377	0.43
378	0.38
379	0.29
380	0.24
381	0.21
382	0.17
383	0.12
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.12
391	0.13
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.16
396	0.16
397	0.19
398	0.22
399	0.28
400	0.33
401	0.39
402	0.43
403	0.44
404	0.45
405	0.44
406	0.47
407	0.47
408	0.5
409	0.51
410	0.53
411	0.56
412	0.54
413	0.54
414	0.45
415	0.38
416	0.29
417	0.22
418	0.17
419	0.14
420	0.14
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.07
430	0.09
431	0.11
432	0.12
433	0.13
434	0.15
435	0.15
436	0.16
437	0.19
438	0.19
439	0.21
440	0.26
441	0.26
442	0.27
443	0.29
444	0.3
445	0.34
446	0.37
447	0.35
448	0.35
449	0.38
450	0.37
451	0.36
452	0.34
453	0.27
454	0.24
455	0.25
456	0.28
457	0.34
458	0.38
459	0.44

A0A2S6CLH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer