Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MK11

Protein Details
Accession B8MK11    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-121DAENLKLIGRHKRKRRDDEEGEPKRKREGRREKRKRAQRDSDVESGBasic
159-180MDAAMKQKTRRRRKADGIDLEQHydrophilic
398-417EDRFRRMKARQLNAGKPSRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-136GRHKRKRRDDEEGEPKRKREGRREKRKRAQRDSDVESGDAKAGRRKAAKSRRE
150-172RRRRALDRAMDAAMKQKTRRRRK
402-417RRMKARQLNAGKPSRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEPQADSPAADPDRAELQAELDDLNDNNGGATEENPEISDDESVLSEVDEAQFEDFNPDDVAIEDRPALDVDAENLKLIGRHKRKRRDDEEGEPKRKREGRREKRKRAQRDSDVESGDAKAGRRKAAKSRREATPEDEETLSPEERRRRALDRAMDAAMKQKTRRRRKADGIDLEQMADAEIEDMRRRMTDAARLDAEARRQGQPAMHKLKMLPEVLNLLNRNQYTASLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGELPAYNIQRDLMDVLGKLPINKDSLVASGIGKVIVFYTKSKRPELKIKRQAERLLADWTRPILQRSDDYSKRVYEEVEFDPTRLVNRANIAQQTAEEARARELLPPRLANRARREMGHTSYSIVPRSTVIQDNKFARPVGASGEDRFRRMKARQLNAGKPSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.22
4 0.25
5 0.23
6 0.23
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.14
12 0.11
13 0.12
14 0.11
15 0.13
16 0.11
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.09
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.12
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.14
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.17
70 0.25
71 0.32
72 0.42
73 0.52
74 0.63
75 0.73
76 0.81
77 0.86
78 0.86
79 0.84
80 0.85
81 0.86
82 0.86
83 0.84
84 0.78
85 0.7
86 0.69
87 0.67
88 0.64
89 0.64
90 0.66
91 0.68
92 0.75
93 0.85
94 0.88
95 0.92
96 0.94
97 0.94
98 0.93
99 0.92
100 0.9
101 0.87
102 0.82
103 0.77
104 0.68
105 0.58
106 0.48
107 0.38
108 0.3
109 0.23
110 0.18
111 0.17
112 0.18
113 0.23
114 0.27
115 0.31
116 0.4
117 0.48
118 0.56
119 0.6
120 0.63
121 0.65
122 0.67
123 0.65
124 0.6
125 0.58
126 0.52
127 0.46
128 0.4
129 0.33
130 0.29
131 0.29
132 0.24
133 0.17
134 0.2
135 0.24
136 0.26
137 0.3
138 0.32
139 0.34
140 0.4
141 0.46
142 0.48
143 0.44
144 0.45
145 0.42
146 0.38
147 0.33
148 0.33
149 0.29
150 0.25
151 0.25
152 0.28
153 0.37
154 0.48
155 0.58
156 0.6
157 0.66
158 0.74
159 0.8
160 0.84
161 0.82
162 0.76
163 0.69
164 0.61
165 0.52
166 0.42
167 0.31
168 0.21
169 0.13
170 0.07
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.16
182 0.17
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.17
190 0.18
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.21
196 0.28
197 0.31
198 0.3
199 0.29
200 0.29
201 0.32
202 0.33
203 0.3
204 0.21
205 0.16
206 0.18
207 0.18
208 0.21
209 0.17
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.14
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.1
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.17
279 0.23
280 0.27
281 0.34
282 0.39
283 0.44
284 0.54
285 0.61
286 0.66
287 0.7
288 0.75
289 0.76
290 0.78
291 0.76
292 0.71
293 0.63
294 0.54
295 0.51
296 0.43
297 0.36
298 0.31
299 0.28
300 0.26
301 0.25
302 0.24
303 0.19
304 0.21
305 0.24
306 0.3
307 0.37
308 0.37
309 0.39
310 0.4
311 0.39
312 0.39
313 0.36
314 0.3
315 0.23
316 0.25
317 0.24
318 0.29
319 0.27
320 0.25
321 0.26
322 0.25
323 0.24
324 0.21
325 0.2
326 0.15
327 0.18
328 0.22
329 0.25
330 0.27
331 0.26
332 0.24
333 0.23
334 0.26
335 0.23
336 0.22
337 0.2
338 0.19
339 0.19
340 0.21
341 0.22
342 0.22
343 0.27
344 0.31
345 0.35
346 0.39
347 0.39
348 0.46
349 0.52
350 0.54
351 0.57
352 0.6
353 0.57
354 0.55
355 0.6
356 0.57
357 0.56
358 0.53
359 0.44
360 0.38
361 0.41
362 0.42
363 0.38
364 0.31
365 0.27
366 0.23
367 0.27
368 0.27
369 0.3
370 0.34
371 0.36
372 0.43
373 0.47
374 0.5
375 0.49
376 0.45
377 0.38
378 0.32
379 0.28
380 0.26
381 0.28
382 0.26
383 0.27
384 0.37
385 0.38
386 0.39
387 0.41
388 0.38
389 0.4
390 0.41
391 0.48
392 0.48
393 0.55
394 0.62
395 0.69
396 0.75
397 0.77