Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N6P113

Protein Details
Accession A0A2N6P113    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-426KTSPEAPKVLRKKKPVNVFMKRPVRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-426KVLRKKKPVNVFMKRPVRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 11, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVKSLYEMATAVAVKNIESIVSVGYLSYLSVRHILLKVDNARQLRQIELNCPQLHGETGELWLRLIEKDFPLEFKAKAYMPKSQDKWFKVWEKYKVDHDRSIRESEEQLRAALMGLRQDKEKNTSKIVEGRFLPSDAIRPKKRNGPKDHTTGVLTFGGGSRTKTLTGAGVMRKARREAREVRNIQGTLSRSVVAPIRLLEKQHLKAPPPAMVRERRIAAQPAFRTPETEEREQRLQELEKKHAAALEEHSQRAAYITDSEEDSDMDQEPTYKPPKQRATPVSATVAGPSSSSTPGKPAVPGRKVIGSRGSMFQRKFGAGKSLKSPTKPVRVTTTTTTTTTASRDMSPTAKKRTTSSAKLDEPAAGPSKRPATEPAQVSPNRVLPRQPSPPEDIVRSMSLKTSPEAPKVLRKKKPVNVFMKRPVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.07
17 0.08
18 0.11
19 0.12
20 0.15
21 0.17
22 0.19
23 0.2
24 0.28
25 0.32
26 0.36
27 0.42
28 0.41
29 0.41
30 0.44
31 0.43
32 0.39
33 0.4
34 0.36
35 0.37
36 0.4
37 0.46
38 0.41
39 0.4
40 0.37
41 0.32
42 0.3
43 0.25
44 0.2
45 0.12
46 0.15
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.15
54 0.15
55 0.13
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.22
60 0.24
61 0.23
62 0.21
63 0.24
64 0.22
65 0.28
66 0.29
67 0.34
68 0.37
69 0.46
70 0.48
71 0.53
72 0.59
73 0.56
74 0.59
75 0.59
76 0.61
77 0.62
78 0.66
79 0.66
80 0.65
81 0.65
82 0.7
83 0.72
84 0.69
85 0.67
86 0.63
87 0.62
88 0.58
89 0.59
90 0.5
91 0.42
92 0.4
93 0.38
94 0.39
95 0.32
96 0.28
97 0.24
98 0.22
99 0.2
100 0.18
101 0.14
102 0.14
103 0.17
104 0.17
105 0.2
106 0.22
107 0.24
108 0.29
109 0.37
110 0.35
111 0.36
112 0.38
113 0.39
114 0.44
115 0.43
116 0.41
117 0.34
118 0.34
119 0.31
120 0.29
121 0.26
122 0.19
123 0.24
124 0.25
125 0.33
126 0.36
127 0.39
128 0.42
129 0.51
130 0.6
131 0.63
132 0.67
133 0.67
134 0.67
135 0.7
136 0.68
137 0.6
138 0.53
139 0.43
140 0.36
141 0.27
142 0.2
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.12
155 0.15
156 0.14
157 0.19
158 0.21
159 0.23
160 0.25
161 0.28
162 0.32
163 0.3
164 0.36
165 0.4
166 0.46
167 0.54
168 0.54
169 0.53
170 0.53
171 0.5
172 0.44
173 0.38
174 0.32
175 0.23
176 0.21
177 0.19
178 0.13
179 0.14
180 0.16
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.16
188 0.2
189 0.21
190 0.26
191 0.27
192 0.26
193 0.3
194 0.31
195 0.33
196 0.29
197 0.3
198 0.3
199 0.33
200 0.34
201 0.32
202 0.32
203 0.27
204 0.27
205 0.29
206 0.26
207 0.26
208 0.25
209 0.26
210 0.28
211 0.27
212 0.26
213 0.24
214 0.31
215 0.3
216 0.34
217 0.34
218 0.35
219 0.38
220 0.36
221 0.35
222 0.29
223 0.27
224 0.28
225 0.29
226 0.29
227 0.28
228 0.29
229 0.28
230 0.26
231 0.24
232 0.19
233 0.2
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.22
238 0.21
239 0.2
240 0.19
241 0.15
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.14
258 0.18
259 0.22
260 0.25
261 0.34
262 0.43
263 0.46
264 0.55
265 0.56
266 0.59
267 0.58
268 0.57
269 0.51
270 0.44
271 0.39
272 0.3
273 0.25
274 0.17
275 0.13
276 0.11
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.16
283 0.16
284 0.19
285 0.25
286 0.32
287 0.33
288 0.36
289 0.36
290 0.4
291 0.4
292 0.39
293 0.37
294 0.31
295 0.3
296 0.33
297 0.37
298 0.37
299 0.37
300 0.38
301 0.35
302 0.34
303 0.33
304 0.29
305 0.33
306 0.3
307 0.32
308 0.35
309 0.41
310 0.42
311 0.43
312 0.5
313 0.48
314 0.55
315 0.55
316 0.52
317 0.52
318 0.53
319 0.55
320 0.52
321 0.5
322 0.43
323 0.41
324 0.4
325 0.32
326 0.3
327 0.27
328 0.24
329 0.2
330 0.19
331 0.19
332 0.2
333 0.25
334 0.32
335 0.37
336 0.43
337 0.46
338 0.46
339 0.48
340 0.55
341 0.59
342 0.58
343 0.6
344 0.59
345 0.58
346 0.58
347 0.56
348 0.48
349 0.4
350 0.37
351 0.34
352 0.26
353 0.24
354 0.27
355 0.32
356 0.31
357 0.32
358 0.32
359 0.33
360 0.4
361 0.43
362 0.42
363 0.44
364 0.45
365 0.47
366 0.46
367 0.46
368 0.42
369 0.4
370 0.41
371 0.38
372 0.46
373 0.51
374 0.53
375 0.51
376 0.54
377 0.59
378 0.59
379 0.56
380 0.51
381 0.45
382 0.43
383 0.4
384 0.33
385 0.29
386 0.27
387 0.26
388 0.24
389 0.29
390 0.31
391 0.34
392 0.39
393 0.4
394 0.48
395 0.57
396 0.66
397 0.66
398 0.71
399 0.76
400 0.79
401 0.86
402 0.86
403 0.86
404 0.86
405 0.87
406 0.88