Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CJM6

Protein Details
Accession A0A0D1CJM6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MTLPRRPPPPRTPRKPPKLAQHWDRPPADPHydrophilic
351-370ASEREQRHRREQREQQRYKQBasic
693-714QVEHKVKLRPLRPKQLKNSEVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-18RRPPPPRTPRKPPK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR002931  Transglutaminase-like  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000111  C:nucleotide-excision repair factor 2 complex  
GO:0071942  C:XPC complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG uma:UMAG_11163  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF03835  Rad4  
PF01841  Transglut_core  
Amino Acid Sequences MTLPRRPPPPRTPRKPPKLAQHWDRPPADPEEVFDVQSISSDDESTTTPSAASTAKMPSTTARASAAPARASRSKQHLPPKDVIEISTDESVAHQDEALDDMEMSDFEDVDPAAPATTGASSAASEDLDMEDVDLDADQSAQDLHDMYAAAYREVQAKYDNSTGTGEDEYEGSDDEEGRNQDDDASAGSKPIPIFKDGKGQHRGVEISVGSHSTKQTNSSKQKSNNFLTPRDRQNRITAHKLLVLSMLAHARVRNKWCNDAELRDTLAHSVPEFLITKLRSIHPKKVTEQRERIRMFESFLSELVRWWSSRFRLDPTMVASSALRQPDQDIATGVLPGSGRRIDGWIVETASEREQRHRREQREQQRYKQECERQATSVEASNGNSKGKAKAKARDNANNDSTSTGSATLQPPTKAMEITIFAPGPVIRPIFLRLLPAAEHIVSPAGLRERAEQRSGSRETSAQLFCALCRSIGIPARLVVSPQPLSWSVGASKLANTTQPGSLADKKPNQLRVRAKKSASHRFASKPINELTSDDDDDDDHSVSAASSSAHTKGMSNVISVGSRSSADEATASDSSTGKQITSSTKGSAGLTKKAVLGAAAKTSSHHNNVSRGHRSQPISVDDTASDISSGRSVNDARKAGASRKTSGTSSTKNKGKARQVDVVDADPAGLQDEEHDDYRPEKWKHLKTPLQVEHKVKLRPLRPKQLKNSEVASEDTWADPVDLQAPPTMWVEVFSKPYQKWITVDPIRCMIRPCGNRHMEPAAFDRQNKLLYVVAFEEDGYARDVTARYTKTLNSRVSRLRPPTRCKGEEDWWTRVVRGIHRPQRLDRDAMEDAELQDNSSREPMPSSINAFKDHPIYFIEKFLKRDEVVFPRRQIATFQGMAVFRKADVQTLRSSRQWYNEGRVSKKARGAQVVKSRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.93
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.9
7 0.89
8 0.88
9 0.87
10 0.86
11 0.81
12 0.73
13 0.66
14 0.62
15 0.57
16 0.46
17 0.4
18 0.38
19 0.36
20 0.33
21 0.29
22 0.23
23 0.18
24 0.19
25 0.17
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.12
31 0.14
32 0.16
33 0.16
34 0.14
35 0.13
36 0.13
37 0.15
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.16
42 0.18
43 0.19
44 0.2
45 0.21
46 0.26
47 0.26
48 0.25
49 0.24
50 0.22
51 0.25
52 0.3
53 0.32
54 0.3
55 0.3
56 0.34
57 0.38
58 0.41
59 0.45
60 0.48
61 0.52
62 0.56
63 0.65
64 0.69
65 0.69
66 0.72
67 0.7
68 0.67
69 0.6
70 0.52
71 0.45
72 0.38
73 0.34
74 0.28
75 0.23
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.15
80 0.13
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.19
145 0.22
146 0.26
147 0.25
148 0.21
149 0.22
150 0.21
151 0.2
152 0.19
153 0.15
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.12
177 0.12
178 0.17
179 0.17
180 0.19
181 0.22
182 0.23
183 0.33
184 0.35
185 0.43
186 0.45
187 0.44
188 0.43
189 0.43
190 0.42
191 0.33
192 0.32
193 0.23
194 0.18
195 0.17
196 0.17
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.22
203 0.29
204 0.37
205 0.46
206 0.52
207 0.59
208 0.64
209 0.72
210 0.74
211 0.72
212 0.7
213 0.65
214 0.64
215 0.63
216 0.62
217 0.64
218 0.64
219 0.63
220 0.58
221 0.61
222 0.63
223 0.62
224 0.62
225 0.55
226 0.49
227 0.48
228 0.45
229 0.37
230 0.29
231 0.23
232 0.16
233 0.14
234 0.13
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.15
239 0.2
240 0.27
241 0.33
242 0.35
243 0.42
244 0.43
245 0.48
246 0.47
247 0.46
248 0.43
249 0.37
250 0.36
251 0.29
252 0.28
253 0.23
254 0.21
255 0.16
256 0.12
257 0.12
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.11
262 0.15
263 0.15
264 0.17
265 0.18
266 0.22
267 0.29
268 0.34
269 0.42
270 0.45
271 0.5
272 0.54
273 0.61
274 0.67
275 0.67
276 0.72
277 0.69
278 0.71
279 0.68
280 0.63
281 0.56
282 0.48
283 0.41
284 0.33
285 0.29
286 0.2
287 0.19
288 0.2
289 0.17
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.12
294 0.13
295 0.18
296 0.18
297 0.24
298 0.25
299 0.27
300 0.31
301 0.32
302 0.32
303 0.31
304 0.31
305 0.26
306 0.24
307 0.2
308 0.17
309 0.19
310 0.18
311 0.14
312 0.12
313 0.13
314 0.16
315 0.17
316 0.15
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.11
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.13
339 0.18
340 0.17
341 0.24
342 0.31
343 0.36
344 0.47
345 0.55
346 0.58
347 0.63
348 0.72
349 0.75
350 0.79
351 0.8
352 0.78
353 0.8
354 0.77
355 0.72
356 0.71
357 0.68
358 0.63
359 0.63
360 0.56
361 0.47
362 0.44
363 0.4
364 0.32
365 0.27
366 0.21
367 0.16
368 0.15
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.16
373 0.15
374 0.2
375 0.24
376 0.31
377 0.33
378 0.39
379 0.46
380 0.52
381 0.58
382 0.6
383 0.6
384 0.59
385 0.56
386 0.49
387 0.42
388 0.36
389 0.29
390 0.21
391 0.16
392 0.11
393 0.08
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.16
401 0.16
402 0.13
403 0.13
404 0.11
405 0.1
406 0.11
407 0.12
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.08
417 0.1
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.1
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.11
437 0.16
438 0.18
439 0.2
440 0.2
441 0.2
442 0.26
443 0.27
444 0.24
445 0.2
446 0.19
447 0.18
448 0.22
449 0.21
450 0.15
451 0.14
452 0.13
453 0.12
454 0.14
455 0.13
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.1
460 0.14
461 0.14
462 0.13
463 0.13
464 0.15
465 0.14
466 0.14
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.13
472 0.12
473 0.13
474 0.13
475 0.13
476 0.1
477 0.11
478 0.12
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.11
488 0.11
489 0.14
490 0.2
491 0.22
492 0.27
493 0.29
494 0.32
495 0.36
496 0.43
497 0.42
498 0.44
499 0.52
500 0.56
501 0.61
502 0.64
503 0.61
504 0.59
505 0.65
506 0.67
507 0.62
508 0.55
509 0.51
510 0.48
511 0.53
512 0.53
513 0.45
514 0.39
515 0.35
516 0.33
517 0.29
518 0.27
519 0.24
520 0.21
521 0.2
522 0.16
523 0.15
524 0.13
525 0.14
526 0.14
527 0.1
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.05
534 0.04
535 0.05
536 0.07
537 0.08
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.14
543 0.14
544 0.12
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.12
549 0.11
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.08
557 0.08
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.12
565 0.12
566 0.08
567 0.08
568 0.1
569 0.14
570 0.18
571 0.19
572 0.18
573 0.19
574 0.21
575 0.21
576 0.24
577 0.23
578 0.22
579 0.22
580 0.22
581 0.21
582 0.2
583 0.19
584 0.14
585 0.14
586 0.11
587 0.12
588 0.11
589 0.11
590 0.11
591 0.16
592 0.19
593 0.2
594 0.24
595 0.24
596 0.3
597 0.37
598 0.43
599 0.45
600 0.43
601 0.44
602 0.46
603 0.45
604 0.42
605 0.4
606 0.37
607 0.35
608 0.33
609 0.3
610 0.24
611 0.23
612 0.2
613 0.15
614 0.11
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.07
620 0.09
621 0.11
622 0.15
623 0.22
624 0.22
625 0.22
626 0.25
627 0.27
628 0.3
629 0.36
630 0.36
631 0.32
632 0.35
633 0.37
634 0.34
635 0.37
636 0.38
637 0.38
638 0.41
639 0.47
640 0.48
641 0.54
642 0.59
643 0.62
644 0.65
645 0.66
646 0.65
647 0.64
648 0.61
649 0.57
650 0.53
651 0.46
652 0.37
653 0.28
654 0.22
655 0.14
656 0.12
657 0.08
658 0.06
659 0.05
660 0.05
661 0.09
662 0.11
663 0.11
664 0.12
665 0.12
666 0.14
667 0.18
668 0.27
669 0.25
670 0.31
671 0.4
672 0.48
673 0.56
674 0.65
675 0.68
676 0.65
677 0.75
678 0.75
679 0.74
680 0.73
681 0.68
682 0.64
683 0.63
684 0.6
685 0.53
686 0.53
687 0.51
688 0.55
689 0.6
690 0.65
691 0.69
692 0.76
693 0.82
694 0.85
695 0.81
696 0.74
697 0.68
698 0.6
699 0.52
700 0.45
701 0.35
702 0.26
703 0.24
704 0.2
705 0.16
706 0.13
707 0.11
708 0.09
709 0.09
710 0.1
711 0.09
712 0.1
713 0.11
714 0.11
715 0.12
716 0.13
717 0.13
718 0.1
719 0.12
720 0.13
721 0.15
722 0.19
723 0.19
724 0.24
725 0.24
726 0.32
727 0.33
728 0.33
729 0.32
730 0.32
731 0.4
732 0.42
733 0.46
734 0.41
735 0.45
736 0.45
737 0.44
738 0.43
739 0.38
740 0.39
741 0.42
742 0.46
743 0.49
744 0.52
745 0.53
746 0.54
747 0.55
748 0.47
749 0.43
750 0.42
751 0.4
752 0.38
753 0.38
754 0.37
755 0.34
756 0.35
757 0.32
758 0.29
759 0.23
760 0.2
761 0.22
762 0.19
763 0.17
764 0.15
765 0.14
766 0.14
767 0.11
768 0.12
769 0.11
770 0.1
771 0.09
772 0.11
773 0.11
774 0.13
775 0.2
776 0.2
777 0.2
778 0.23
779 0.27
780 0.34
781 0.42
782 0.47
783 0.45
784 0.5
785 0.57
786 0.62
787 0.67
788 0.68
789 0.7
790 0.71
791 0.75
792 0.79
793 0.8
794 0.76
795 0.73
796 0.71
797 0.68
798 0.69
799 0.67
800 0.62
801 0.57
802 0.55
803 0.48
804 0.45
805 0.42
806 0.39
807 0.42
808 0.48
809 0.53
810 0.59
811 0.65
812 0.67
813 0.73
814 0.7
815 0.64
816 0.55
817 0.53
818 0.48
819 0.43
820 0.39
821 0.3
822 0.27
823 0.27
824 0.25
825 0.19
826 0.19
827 0.18
828 0.18
829 0.19
830 0.18
831 0.14
832 0.17
833 0.18
834 0.21
835 0.24
836 0.29
837 0.32
838 0.34
839 0.36
840 0.36
841 0.37
842 0.38
843 0.35
844 0.3
845 0.27
846 0.3
847 0.28
848 0.33
849 0.38
850 0.37
851 0.39
852 0.42
853 0.44
854 0.39
855 0.42
856 0.43
857 0.45
858 0.49
859 0.53
860 0.52
861 0.53
862 0.54
863 0.52
864 0.46
865 0.42
866 0.41
867 0.34
868 0.32
869 0.3
870 0.3
871 0.32
872 0.31
873 0.25
874 0.18
875 0.24
876 0.23
877 0.25
878 0.27
879 0.29
880 0.35
881 0.41
882 0.46
883 0.44
884 0.49
885 0.47
886 0.5
887 0.54
888 0.52
889 0.54
890 0.57
891 0.6
892 0.59
893 0.64
894 0.64
895 0.63
896 0.64
897 0.63
898 0.62
899 0.64
900 0.65
901 0.65