Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8LSX3

Protein Details
Accession B8LSX3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-299RGSASDLPARKKRKHDSIRCKRDVILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-286KKR
Subcellular Location(s) plas 21, E.R. 3, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MVELCPAITTPGTYWTFCPSLGAAIAFLVFFSLTFFVHIAQGVYYRKAYTWVISMSVLWQAITYILRIISIKNPTSLGDYAGWFVLILISPLWTNAYVYMVFGRMVWNYVPDGTLWRVPAWRFGYYFVFLDIVAFIVQVYGAASAEVNNTNTTKILRGIHIYMGGVAIQQFFIFGFCAFAYEFWRTILEQKKTTEGDNTASTDLSLQSGFTLLYALILVLILISLRIFFRLAEYSKGLQSTIPNHEAYQYCFDSLPMLLAFIILSVVHPGAVMRGSASDLPARKKRKHDSIRCKRDVILVSVRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.26
4 0.25
5 0.26
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.17
10 0.11
11 0.1
12 0.11
13 0.08
14 0.08
15 0.06
16 0.05
17 0.04
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.13
29 0.15
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.2
35 0.21
36 0.18
37 0.2
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.18
42 0.16
43 0.17
44 0.15
45 0.11
46 0.1
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.14
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.21
62 0.25
63 0.24
64 0.21
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.14
105 0.14
106 0.21
107 0.22
108 0.22
109 0.21
110 0.22
111 0.24
112 0.23
113 0.23
114 0.16
115 0.14
116 0.11
117 0.11
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.1
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.1
173 0.17
174 0.25
175 0.26
176 0.28
177 0.29
178 0.33
179 0.34
180 0.34
181 0.32
182 0.25
183 0.24
184 0.23
185 0.24
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.14
190 0.12
191 0.1
192 0.08
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.08
217 0.12
218 0.14
219 0.17
220 0.2
221 0.22
222 0.23
223 0.24
224 0.22
225 0.19
226 0.21
227 0.23
228 0.26
229 0.27
230 0.27
231 0.26
232 0.31
233 0.31
234 0.31
235 0.31
236 0.26
237 0.24
238 0.23
239 0.23
240 0.2
241 0.18
242 0.17
243 0.1
244 0.1
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.06
249 0.06
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.12
265 0.16
266 0.2
267 0.29
268 0.37
269 0.45
270 0.5
271 0.59
272 0.68
273 0.74
274 0.8
275 0.84
276 0.86
277 0.9
278 0.94
279 0.9
280 0.83
281 0.74
282 0.71
283 0.64
284 0.59