Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8M4F2

Protein Details
Accession B8M4F2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-169DSDIQKQKGTSRKRKSRRAANVRVGDKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-161KGTSRKRKSRRA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MIAAIVNHRYLLDACHKQTKGIISLREWMRSTVSPSYASDALDTAEDIQAAYLNLENQVDFLNTVRSILSLWVSSYEILNESEIEAGDLSFRLLSGAFRRKVKNSIQSDQGSRIGKNYFPVLHDEEAHQSLTEMDASHEENGDSDIQKQKGTSRKRKSRRAANVRVGDKDLKCKACQGYHDLQQCFYLFPKRAYEGWTKRESIRRRVNKNLEQDHSLTEETCAATFYVAFTLAVGAAMSITKYPLKNSAILDSGSTLYVFNKIARFINFRRAPDIDVLWAGDSPVNIIGYGDLRLFNVAYCPSFATNLVLLRQLQKMDYWWDNRPSYNCLRRADNTIVAYLKDRYAQFVLEDIPNDHPNMRMAFFTARKPVKADAIKWHLRLGHPGPEAMRHLVNFHDFETSSINGFKCLILVTDRYSGLIWDYYLTDWKQETILMALQHLFNYLDRQYKIKPLKIKCDNEILKQPKVKDWLHSQEHVDIKPSPPDTQALDGAAERSGGVVKDKARAMRDAVKLPADLSPEIYRIAVYLLNRTPRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.43
3 0.43
4 0.43
5 0.47
6 0.47
7 0.46
8 0.45
9 0.45
10 0.39
11 0.48
12 0.5
13 0.51
14 0.47
15 0.4
16 0.38
17 0.36
18 0.39
19 0.35
20 0.34
21 0.31
22 0.31
23 0.34
24 0.31
25 0.29
26 0.24
27 0.19
28 0.17
29 0.15
30 0.14
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.12
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.08
82 0.16
83 0.25
84 0.29
85 0.35
86 0.4
87 0.44
88 0.51
89 0.57
90 0.59
91 0.57
92 0.58
93 0.6
94 0.6
95 0.59
96 0.56
97 0.53
98 0.46
99 0.38
100 0.37
101 0.31
102 0.27
103 0.27
104 0.27
105 0.23
106 0.21
107 0.27
108 0.27
109 0.27
110 0.27
111 0.26
112 0.26
113 0.25
114 0.24
115 0.19
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.08
121 0.07
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.11
129 0.12
130 0.11
131 0.13
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.21
136 0.25
137 0.32
138 0.43
139 0.5
140 0.55
141 0.65
142 0.74
143 0.84
144 0.88
145 0.9
146 0.9
147 0.91
148 0.9
149 0.89
150 0.87
151 0.8
152 0.72
153 0.65
154 0.6
155 0.5
156 0.48
157 0.44
158 0.39
159 0.36
160 0.39
161 0.4
162 0.37
163 0.38
164 0.38
165 0.37
166 0.42
167 0.49
168 0.44
169 0.4
170 0.38
171 0.36
172 0.29
173 0.25
174 0.24
175 0.19
176 0.2
177 0.23
178 0.24
179 0.24
180 0.29
181 0.37
182 0.38
183 0.42
184 0.44
185 0.43
186 0.45
187 0.53
188 0.54
189 0.54
190 0.58
191 0.6
192 0.64
193 0.72
194 0.77
195 0.75
196 0.79
197 0.75
198 0.67
199 0.61
200 0.55
201 0.46
202 0.39
203 0.32
204 0.22
205 0.16
206 0.14
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.13
232 0.15
233 0.18
234 0.19
235 0.2
236 0.19
237 0.19
238 0.18
239 0.14
240 0.13
241 0.1
242 0.09
243 0.07
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.14
252 0.19
253 0.19
254 0.29
255 0.31
256 0.31
257 0.33
258 0.32
259 0.31
260 0.27
261 0.26
262 0.17
263 0.13
264 0.13
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.16
305 0.2
306 0.21
307 0.24
308 0.29
309 0.3
310 0.32
311 0.33
312 0.34
313 0.38
314 0.42
315 0.44
316 0.41
317 0.44
318 0.44
319 0.47
320 0.46
321 0.41
322 0.35
323 0.31
324 0.29
325 0.25
326 0.25
327 0.19
328 0.16
329 0.16
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.14
335 0.14
336 0.16
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.15
344 0.14
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.12
349 0.13
350 0.17
351 0.19
352 0.21
353 0.28
354 0.28
355 0.28
356 0.31
357 0.31
358 0.34
359 0.36
360 0.37
361 0.37
362 0.44
363 0.48
364 0.46
365 0.47
366 0.41
367 0.38
368 0.41
369 0.35
370 0.35
371 0.31
372 0.31
373 0.29
374 0.29
375 0.31
376 0.26
377 0.24
378 0.16
379 0.17
380 0.17
381 0.2
382 0.17
383 0.16
384 0.16
385 0.15
386 0.15
387 0.18
388 0.17
389 0.15
390 0.17
391 0.17
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.12
400 0.14
401 0.17
402 0.17
403 0.17
404 0.17
405 0.16
406 0.15
407 0.14
408 0.11
409 0.08
410 0.09
411 0.1
412 0.14
413 0.14
414 0.15
415 0.15
416 0.16
417 0.15
418 0.15
419 0.14
420 0.12
421 0.15
422 0.12
423 0.13
424 0.14
425 0.14
426 0.13
427 0.14
428 0.12
429 0.1
430 0.13
431 0.16
432 0.21
433 0.21
434 0.25
435 0.27
436 0.36
437 0.43
438 0.46
439 0.52
440 0.53
441 0.62
442 0.69
443 0.72
444 0.67
445 0.7
446 0.67
447 0.65
448 0.68
449 0.63
450 0.6
451 0.59
452 0.58
453 0.53
454 0.56
455 0.52
456 0.49
457 0.52
458 0.55
459 0.56
460 0.57
461 0.54
462 0.54
463 0.57
464 0.51
465 0.45
466 0.37
467 0.34
468 0.37
469 0.36
470 0.31
471 0.28
472 0.3
473 0.3
474 0.31
475 0.3
476 0.24
477 0.23
478 0.21
479 0.2
480 0.17
481 0.14
482 0.1
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.12
487 0.15
488 0.17
489 0.23
490 0.27
491 0.32
492 0.33
493 0.36
494 0.39
495 0.43
496 0.47
497 0.46
498 0.46
499 0.44
500 0.41
501 0.39
502 0.36
503 0.31
504 0.25
505 0.25
506 0.24
507 0.22
508 0.23
509 0.22
510 0.18
511 0.15
512 0.16
513 0.15
514 0.13
515 0.19
516 0.24