FuNGI

B8MIJ1

Protein Details

Accession

B8MIJ1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-32	HDHVRIARWVRNRGKPRATFTPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 14, pero 5, cyto_nucl 4.5, nucl 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MGSSSSATRHDHVXRIARWVRNRGKPRATFTPTLHYNNTSYTAPKEKAALFREVLHPEPPEADLSDIGPQYRYPKPYTMPPITLDEVRTAVTNVKPDKAPGPDGIPNLVLQRLLPTIEAYLSTTVILCKPGKPDYSDPKAYRPIALLSTIGKALESVLARRLSYLVEQYNLLPKQHIGGYRGRSCELAIHLLLEETHSAWREGSRVASGLALDAAGAFDNVNHIRLIHDLRKRQVPDDLIGWIESFLSNRRTSITLLEGNMGEFLVNTGIPQGSLLSPILFLFFNADLIEQILAECPDVIVLGYIDDIFIMTYRTSAAANCHTLTKVHQVAERWERTHASKFAPAKYQLTHFWRKHQMVPKPSGRLDVPLIIKGVEIKPTDSIKYLGVYLDTHLTGEVHVQEMRKKAAKLVAGLSLIAGSTWGTPLVHLRKIYTAVLQLQIIYACSTWYIRGGRGFTGAQRAAEQAIRSIQDQALHQISGAFKRTSRQALEVCLHVPPAELMLAKLAEEACLRIMTSPLRSTLYQIRGQAHCNDPYTSPLHRLETAINRKLGSDTSQRIETIYPFVVPLWWEPSEARIDDTREEAIKAIEVISGIDITIQFFTDGSSFDNGIGAAVYSSIGQAYKLVGSSDTHTVYAGELEGIDAALEILLRSQPCDDNPHEATIYTDNQAAIRATCQPGRSSGSISFDGSYDTWASYATTDLDGVYDYINYPYGSVSPEATCRLCKEVEGTVGACQLWTASLSDNQSTNEDGIAAARGIMTGLEFSVNPTTNR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.53
3	0.58
4	0.6
5	0.67
6	0.7
7	0.76
8	0.77
9	0.78
10	0.8
11	0.81
12	0.81
13	0.81
14	0.79
15	0.75
16	0.7
17	0.7
18	0.66
19	0.65
20	0.6
21	0.53
22	0.47
23	0.43
24	0.43
25	0.35
26	0.31
27	0.31
28	0.35
29	0.33
30	0.33
31	0.35
32	0.35
33	0.42
34	0.44
35	0.44
36	0.38
37	0.4
38	0.44
39	0.44
40	0.42
41	0.37
42	0.35
43	0.3
44	0.3
45	0.27
46	0.22
47	0.19
48	0.18
49	0.15
50	0.15
51	0.19
52	0.18
53	0.17
54	0.16
55	0.17
56	0.21
57	0.26
58	0.3
59	0.29
60	0.34
61	0.38
62	0.46
63	0.54
64	0.55
65	0.52
66	0.51
67	0.52
68	0.5
69	0.48
70	0.4
71	0.32
72	0.27
73	0.24
74	0.21
75	0.17
76	0.18
77	0.18
78	0.24
79	0.25
80	0.28
81	0.28
82	0.3
83	0.34
84	0.34
85	0.35
86	0.3
87	0.34
88	0.35
89	0.35
90	0.35
91	0.3
92	0.26
93	0.25
94	0.23
95	0.17
96	0.12
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.11
102	0.11
103	0.11
104	0.12
105	0.11
106	0.11
107	0.1
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.11
112	0.15
113	0.14
114	0.16
115	0.21
116	0.26
117	0.29
118	0.33
119	0.41
120	0.46
121	0.53
122	0.6
123	0.58
124	0.59
125	0.64
126	0.59
127	0.52
128	0.44
129	0.39
130	0.31
131	0.3
132	0.25
133	0.18
134	0.19
135	0.17
136	0.15
137	0.12
138	0.1
139	0.09
140	0.12
141	0.11
142	0.11
143	0.16
144	0.17
145	0.17
146	0.18
147	0.18
148	0.16
149	0.17
150	0.21
151	0.18
152	0.17
153	0.18
154	0.19
155	0.27
156	0.27
157	0.25
158	0.21
159	0.19
160	0.2
161	0.23
162	0.25
163	0.21
164	0.26
165	0.33
166	0.37
167	0.4
168	0.38
169	0.35
170	0.31
171	0.32
172	0.27
173	0.23
174	0.18
175	0.16
176	0.15
177	0.15
178	0.14
179	0.11
180	0.1
181	0.07
182	0.09
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.11
187	0.11
188	0.12
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.1
195	0.09
196	0.08
197	0.06
198	0.05
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.03
204	0.03
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.12
212	0.18
213	0.22
214	0.28
215	0.32
216	0.37
217	0.44
218	0.45
219	0.44
220	0.44
221	0.39
222	0.35
223	0.31
224	0.28
225	0.21
226	0.2
227	0.18
228	0.12
229	0.1
230	0.08
231	0.07
232	0.09
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.15
237	0.16
238	0.17
239	0.19
240	0.2
241	0.19
242	0.19
243	0.2
244	0.18
245	0.17
246	0.16
247	0.13
248	0.08
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.08
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.04
277	0.04
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.09
304	0.11
305	0.13
306	0.14
307	0.15
308	0.14
309	0.15
310	0.16
311	0.2
312	0.2
313	0.19
314	0.21
315	0.22
316	0.28
317	0.35
318	0.36
319	0.3
320	0.29
321	0.29
322	0.3
323	0.34
324	0.31
325	0.25
326	0.28
327	0.31
328	0.32
329	0.35
330	0.34
331	0.31
332	0.3
333	0.3
334	0.29
335	0.33
336	0.4
337	0.36
338	0.41
339	0.47
340	0.48
341	0.53
342	0.55
343	0.55
344	0.52
345	0.58
346	0.56
347	0.53
348	0.51
349	0.46
350	0.38
351	0.34
352	0.28
353	0.26
354	0.21
355	0.17
356	0.17
357	0.15
358	0.14
359	0.14
360	0.13
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.14
365	0.15
366	0.16
367	0.15
368	0.15
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.11
388	0.13
389	0.15
390	0.18
391	0.18
392	0.19
393	0.21
394	0.22
395	0.21
396	0.21
397	0.21
398	0.17
399	0.17
400	0.15
401	0.11
402	0.09
403	0.07
404	0.05
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.04
409	0.03
410	0.04
411	0.09
412	0.13
413	0.15
414	0.16
415	0.16
416	0.18
417	0.2
418	0.2
419	0.16
420	0.15
421	0.14
422	0.15
423	0.14
424	0.12
425	0.11
426	0.1
427	0.09
428	0.07
429	0.06
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.09
435	0.1
436	0.11
437	0.13
438	0.15
439	0.15
440	0.17
441	0.17
442	0.15
443	0.2
444	0.19
445	0.17
446	0.16
447	0.16
448	0.15
449	0.16
450	0.15
451	0.1
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.13
456	0.12
457	0.13
458	0.13
459	0.16
460	0.15
461	0.14
462	0.13
463	0.13
464	0.14
465	0.14
466	0.17
467	0.14
468	0.13
469	0.16
470	0.2
471	0.23
472	0.24
473	0.26
474	0.24
475	0.28
476	0.29
477	0.28
478	0.25
479	0.2
480	0.19
481	0.14
482	0.12
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.05
488	0.07
489	0.07
490	0.06
491	0.07
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.06
500	0.08
501	0.09
502	0.12
503	0.13
504	0.14
505	0.16
506	0.16
507	0.2
508	0.26
509	0.29
510	0.3
511	0.32
512	0.35
513	0.34
514	0.37
515	0.38
516	0.35
517	0.33
518	0.32
519	0.3
520	0.25
521	0.27
522	0.28
523	0.24
524	0.25
525	0.25
526	0.25
527	0.25
528	0.25
529	0.27
530	0.33
531	0.4
532	0.4
533	0.39
534	0.36
535	0.36
536	0.36
537	0.32
538	0.27
539	0.26
540	0.25
541	0.26
542	0.28
543	0.27
544	0.27
545	0.27
546	0.23
547	0.2
548	0.16
549	0.13
550	0.12
551	0.12
552	0.12
553	0.12
554	0.12
555	0.13
556	0.13
557	0.14
558	0.13
559	0.16
560	0.19
561	0.18
562	0.19
563	0.17
564	0.19
565	0.19
566	0.21
567	0.21
568	0.18
569	0.18
570	0.16
571	0.14
572	0.12
573	0.11
574	0.1
575	0.08
576	0.07
577	0.07
578	0.06
579	0.06
580	0.05
581	0.06
582	0.05
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.08
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.11
596	0.1
597	0.09
598	0.08
599	0.06
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.06
609	0.06
610	0.07
611	0.08
612	0.08
613	0.09
614	0.1
615	0.13
616	0.17
617	0.17
618	0.16
619	0.16
620	0.16
621	0.15
622	0.14
623	0.11
624	0.07
625	0.06
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.04
631	0.03
632	0.03
633	0.03
634	0.03
635	0.04
636	0.07
637	0.07
638	0.08
639	0.11
640	0.13
641	0.15
642	0.22
643	0.24
644	0.29
645	0.31
646	0.33
647	0.31
648	0.29
649	0.3
650	0.27
651	0.27
652	0.21
653	0.2
654	0.17
655	0.17
656	0.19
657	0.17
658	0.14
659	0.13
660	0.17
661	0.19
662	0.22
663	0.24
664	0.23
665	0.26
666	0.31
667	0.31
668	0.3
669	0.3
670	0.32
671	0.32
672	0.32
673	0.28
674	0.23
675	0.24
676	0.2
677	0.19
678	0.14
679	0.13
680	0.11
681	0.11
682	0.11
683	0.09
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.09
691	0.09
692	0.08
693	0.07
694	0.08
695	0.08
696	0.1
697	0.1
698	0.1
699	0.1
700	0.11
701	0.12
702	0.13
703	0.14
704	0.14
705	0.17
706	0.21
707	0.23
708	0.24
709	0.25
710	0.28
711	0.26
712	0.25
713	0.26
714	0.26
715	0.28
716	0.28
717	0.26
718	0.24
719	0.25
720	0.24
721	0.2
722	0.15
723	0.12
724	0.09
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.14
729	0.18
730	0.21
731	0.22
732	0.23
733	0.24
734	0.25
735	0.23
736	0.19
737	0.16
738	0.13
739	0.12
740	0.12
741	0.1
742	0.08
743	0.07
744	0.07
745	0.07
746	0.07
747	0.06
748	0.05
749	0.06
750	0.07
751	0.07
752	0.1
753	0.16

B8MIJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer