FuNGI

A0A2N6NLD7

Protein Details

Accession

A0A2N6NLD7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
94-117	AAEERRARGRSRFRSKRSRGDTMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
58-113	GTRAPAAGRFRPRNVRRDEAERDSLARQEEKKASERAAEERRARGRSRFRSKRSRG

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MVRGRAPARGTRRGAASGGTERPATDAPAPAPTPTSTDAPAASTSETTTARRGSSTRGTRAPAAGRFRPRNVRRDEAERDSLARQEEKKASERAAEERRARGRSRFRSKRSRGDTMGRGGFGRIISGASGPFSSGIGGGPSRGGSGWFGGGAGGIGGGGGFGGRGMKHESKGPNFAQGRDIYREARINADKLHIMSPEEELDSEDEAMIAALSSKDTSKMPMGIYRKEHKEAGIIVATTAELEAKENATGEEESLWVDGESGTLPPQDQPEEGVWAMGSKSLIKEEPEAEDSMDVDLDAVPEMQDRAATAVPAKVKKVMPQDPESKMIQSDLDLLARELGAVSVNGESAPELANKDGRLYLFQFPPLMPPLRESSTPQGPAKVKAETSAVSVDDIPAITDSTAVDLTGENAAAADDDDDDDDSDEETEEERAQAELKHGFKSQFLSQGGMIGRLNVRRSGKVELDWGGHVLEMSPAAGMNFLTTAVIVEESDEKPVVSAAASARPTGGDCVGMGKIMGRFTVAPIWSEEEDWNVAPEELECA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.42
3	0.4
4	0.37
5	0.36
6	0.33
7	0.29
8	0.27
9	0.29
10	0.27
11	0.25
12	0.21
13	0.22
14	0.21
15	0.27
16	0.27
17	0.25
18	0.26
19	0.24
20	0.25
21	0.24
22	0.26
23	0.21
24	0.22
25	0.22
26	0.22
27	0.22
28	0.19
29	0.18
30	0.15
31	0.15
32	0.17
33	0.19
34	0.18
35	0.21
36	0.22
37	0.22
38	0.24
39	0.25
40	0.27
41	0.36
42	0.42
43	0.45
44	0.47
45	0.5
46	0.5
47	0.55
48	0.54
49	0.51
50	0.51
51	0.51
52	0.56
53	0.59
54	0.63
55	0.69
56	0.7
57	0.72
58	0.72
59	0.72
60	0.68
61	0.7
62	0.71
63	0.67
64	0.66
65	0.58
66	0.53
67	0.47
68	0.44
69	0.39
70	0.37
71	0.32
72	0.34
73	0.37
74	0.39
75	0.43
76	0.43
77	0.42
78	0.41
79	0.42
80	0.43
81	0.46
82	0.5
83	0.49
84	0.53
85	0.58
86	0.58
87	0.59
88	0.59
89	0.62
90	0.64
91	0.71
92	0.74
93	0.76
94	0.82
95	0.87
96	0.88
97	0.86
98	0.83
99	0.78
100	0.76
101	0.73
102	0.7
103	0.64
104	0.54
105	0.46
106	0.38
107	0.33
108	0.25
109	0.19
110	0.11
111	0.09
112	0.08
113	0.09
114	0.08
115	0.07
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.05
139	0.04
140	0.03
141	0.02
142	0.02
143	0.02
144	0.02
145	0.02
146	0.02
147	0.02
148	0.02
149	0.03
150	0.03
151	0.05
152	0.12
153	0.14
154	0.15
155	0.22
156	0.28
157	0.3
158	0.37
159	0.36
160	0.39
161	0.38
162	0.38
163	0.37
164	0.34
165	0.35
166	0.32
167	0.34
168	0.26
169	0.28
170	0.3
171	0.26
172	0.29
173	0.27
174	0.25
175	0.24
176	0.24
177	0.22
178	0.21
179	0.22
180	0.16
181	0.15
182	0.14
183	0.14
184	0.13
185	0.12
186	0.11
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.05
195	0.04
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.04
201	0.04
202	0.06
203	0.06
204	0.08
205	0.09
206	0.12
207	0.12
208	0.18
209	0.21
210	0.25
211	0.3
212	0.35
213	0.38
214	0.38
215	0.38
216	0.33
217	0.32
218	0.28
219	0.25
220	0.19
221	0.15
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.08
226	0.07
227	0.05
228	0.03
229	0.04
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.06
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.09
257	0.09
258	0.11
259	0.1
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.06
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.1
272	0.1
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.12
277	0.12
278	0.11
279	0.09
280	0.08
281	0.06
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.06
297	0.09
298	0.12
299	0.14
300	0.14
301	0.17
302	0.18
303	0.23
304	0.31
305	0.35
306	0.36
307	0.41
308	0.47
309	0.45
310	0.48
311	0.44
312	0.36
313	0.29
314	0.25
315	0.2
316	0.13
317	0.13
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.09
341	0.1
342	0.11
343	0.12
344	0.11
345	0.13
346	0.16
347	0.2
348	0.19
349	0.2
350	0.2
351	0.19
352	0.21
353	0.22
354	0.21
355	0.17
356	0.18
357	0.21
358	0.23
359	0.24
360	0.25
361	0.28
362	0.31
363	0.36
364	0.34
365	0.37
366	0.36
367	0.4
368	0.38
369	0.35
370	0.28
371	0.25
372	0.27
373	0.2
374	0.2
375	0.18
376	0.15
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.1
381	0.09
382	0.08
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.06
387	0.05
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.13
422	0.18
423	0.19
424	0.22
425	0.24
426	0.25
427	0.26
428	0.3
429	0.29
430	0.31
431	0.3
432	0.29
433	0.26
434	0.3
435	0.28
436	0.26
437	0.23
438	0.17
439	0.2
440	0.22
441	0.24
442	0.25
443	0.28
444	0.29
445	0.32
446	0.36
447	0.36
448	0.34
449	0.36
450	0.33
451	0.32
452	0.29
453	0.27
454	0.21
455	0.18
456	0.15
457	0.11
458	0.09
459	0.07
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.07
476	0.11
477	0.11
478	0.14
479	0.13
480	0.13
481	0.12
482	0.13
483	0.12
484	0.08
485	0.1
486	0.1
487	0.17
488	0.18
489	0.18
490	0.18
491	0.18
492	0.19
493	0.19
494	0.18
495	0.12
496	0.11
497	0.14
498	0.14
499	0.13
500	0.12
501	0.12
502	0.14
503	0.14
504	0.14
505	0.13
506	0.13
507	0.15
508	0.22
509	0.19
510	0.18
511	0.2
512	0.25
513	0.24
514	0.26
515	0.24
516	0.21
517	0.23
518	0.22
519	0.21
520	0.17
521	0.17
522	0.15

A0A2N6NLD7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer