FuNGI

A0A2N6NXG4

Protein Details

Accession

A0A2N6NXG4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-40	MSAPPPKNTNGPPKRKPNPLRPMRPKPRPKPPVSAKQAGQ	Hydrophilic
177-202	APVAKDVVPKKPKKQKEERTVFNRGP	Hydrophilic
480-500	ATTPQGKQKHGDKKNKSLKRA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-37	NGPPKRKPNPLRPMRPKPRPKPPVSAKQ
185-196	PKKPKKQKEERT
468-542	EKGKNKVPGAQGATTPQGKQKHGDKKNKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKLKKTAATAPGSRSGTPVPGVVRKKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPKNTNGPPKRKPNPLRPMRPKPRPKPPVSAKQAGQKPGSAGASQMTAQNGSRQSLEELRKQYGGWSEPPPPYQYSDIPIMTTKKALLEGIRYHLMKLSSTKADGRPIDPTDQEDFSRPVTLHRRDARLPPPGRAVKEEVPQRVPIDEQERERLAQIKAEKEAQRAINQAKIAPVAKDVVPKKPKKQKEERTVFNRGPRTAAAKKESDLRYEEALPWHLEDVDGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDQSVFRMVPLEKWYRFTAKPHFQAFTLDQAEEYMNRKIDVGRWVMKDEEKKTGQQDLEATRRMLYGAGMIKTESDTFKAASRAEKMEHDEIDMSGDEFQDDDEAPMFERNDDEDTKDSKERIRREQLGANLFGDGDEGQVDQELQQQLREELERQKFGKATRKALIKRDREEIYESDDSEDNPWSSSSDDDSSDEENEEKKEDDKKERENKDDKDDKDEKGKNKVPGAQGATTPQGKQKHGDKKNKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKLKKTAATAPGSRSGTPVPGVVRKKKLGAGSASDGEATAGEISDGAGPRKKMKLVSSANGTPSASRAGSPTPAGASPPPSSAGIEPWEILEKIPDTGISIVELIKPFQSRVGTKPGQMKRDDWIKLVTRICRYGAGKMLYKRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.87
3	0.89
4	0.88
5	0.89
6	0.89
7	0.91
8	0.91
9	0.93
10	0.93
11	0.95
12	0.95
13	0.94
14	0.94
15	0.93
16	0.89
17	0.89
18	0.88
19	0.88
20	0.86
21	0.84
22	0.77
23	0.77
24	0.77
25	0.72
26	0.64
27	0.55
28	0.48
29	0.45
30	0.43
31	0.33
32	0.27
33	0.21
34	0.21
35	0.2
36	0.2
37	0.16
38	0.15
39	0.16
40	0.21
41	0.22
42	0.22
43	0.22
44	0.21
45	0.24
46	0.31
47	0.36
48	0.37
49	0.39
50	0.41
51	0.41
52	0.4
53	0.39
54	0.37
55	0.36
56	0.33
57	0.33
58	0.37
59	0.4
60	0.43
61	0.42
62	0.38
63	0.38
64	0.38
65	0.35
66	0.32
67	0.34
68	0.31
69	0.29
70	0.32
71	0.31
72	0.28
73	0.27
74	0.23
75	0.19
76	0.2
77	0.21
78	0.19
79	0.22
80	0.24
81	0.28
82	0.33
83	0.31
84	0.31
85	0.32
86	0.3
87	0.26
88	0.26
89	0.27
90	0.24
91	0.27
92	0.31
93	0.31
94	0.38
95	0.38
96	0.37
97	0.37
98	0.37
99	0.39
100	0.35
101	0.36
102	0.32
103	0.32
104	0.31
105	0.28
106	0.26
107	0.24
108	0.26
109	0.21
110	0.25
111	0.32
112	0.36
113	0.43
114	0.47
115	0.52
116	0.53
117	0.61
118	0.6
119	0.61
120	0.58
121	0.53
122	0.56
123	0.55
124	0.54
125	0.5
126	0.49
127	0.44
128	0.49
129	0.52
130	0.47
131	0.44
132	0.45
133	0.42
134	0.36
135	0.32
136	0.3
137	0.3
138	0.29
139	0.3
140	0.32
141	0.33
142	0.33
143	0.33
144	0.33
145	0.27
146	0.28
147	0.29
148	0.27
149	0.28
150	0.35
151	0.36
152	0.33
153	0.39
154	0.36
155	0.35
156	0.37
157	0.37
158	0.33
159	0.31
160	0.3
161	0.25
162	0.25
163	0.23
164	0.18
165	0.17
166	0.15
167	0.16
168	0.23
169	0.24
170	0.3
171	0.39
172	0.44
173	0.53
174	0.61
175	0.68
176	0.71
177	0.8
178	0.81
179	0.83
180	0.87
181	0.86
182	0.83
183	0.83
184	0.77
185	0.73
186	0.69
187	0.58
188	0.51
189	0.43
190	0.43
191	0.4
192	0.41
193	0.39
194	0.34
195	0.35
196	0.41
197	0.41
198	0.36
199	0.34
200	0.31
201	0.29
202	0.28
203	0.29
204	0.22
205	0.23
206	0.2
207	0.18
208	0.16
209	0.13
210	0.11
211	0.11
212	0.12
213	0.14
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.11
220	0.09
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.1
243	0.08
244	0.11
245	0.16
246	0.22
247	0.21
248	0.25
249	0.27
250	0.29
251	0.31
252	0.33
253	0.38
254	0.4
255	0.46
256	0.45
257	0.44
258	0.4
259	0.42
260	0.38
261	0.35
262	0.27
263	0.21
264	0.18
265	0.18
266	0.18
267	0.15
268	0.17
269	0.13
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.12
274	0.15
275	0.18
276	0.2
277	0.22
278	0.23
279	0.24
280	0.25
281	0.28
282	0.31
283	0.28
284	0.31
285	0.28
286	0.29
287	0.3
288	0.33
289	0.3
290	0.26
291	0.27
292	0.25
293	0.28
294	0.27
295	0.25
296	0.21
297	0.2
298	0.19
299	0.15
300	0.11
301	0.1
302	0.11
303	0.11
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.12
309	0.09
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.1
314	0.12
315	0.12
316	0.13
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.18
321	0.2
322	0.21
323	0.2
324	0.18
325	0.16
326	0.14
327	0.14
328	0.12
329	0.08
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.07
345	0.08
346	0.1
347	0.11
348	0.12
349	0.14
350	0.16
351	0.19
352	0.2
353	0.2
354	0.22
355	0.28
356	0.32
357	0.38
358	0.44
359	0.46
360	0.48
361	0.51
362	0.51
363	0.48
364	0.44
365	0.35
366	0.27
367	0.22
368	0.18
369	0.14
370	0.09
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.08
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.12
383	0.12
384	0.13
385	0.14
386	0.13
387	0.19
388	0.23
389	0.27
390	0.27
391	0.29
392	0.31
393	0.34
394	0.41
395	0.38
396	0.4
397	0.41
398	0.49
399	0.51
400	0.58
401	0.63
402	0.61
403	0.59
404	0.6
405	0.56
406	0.5
407	0.49
408	0.41
409	0.38
410	0.32
411	0.29
412	0.25
413	0.23
414	0.21
415	0.19
416	0.19
417	0.12
418	0.11
419	0.11
420	0.09
421	0.1
422	0.1
423	0.11
424	0.11
425	0.12
426	0.13
427	0.15
428	0.16
429	0.16
430	0.15
431	0.14
432	0.14
433	0.13
434	0.14
435	0.12
436	0.14
437	0.21
438	0.26
439	0.35
440	0.4
441	0.49
442	0.58
443	0.63
444	0.69
445	0.7
446	0.69
447	0.7
448	0.71
449	0.63
450	0.62
451	0.6
452	0.54
453	0.55
454	0.57
455	0.52
456	0.53
457	0.58
458	0.54
459	0.54
460	0.58
461	0.5
462	0.51
463	0.51
464	0.42
465	0.37
466	0.34
467	0.34
468	0.29
469	0.28
470	0.27
471	0.28
472	0.28
473	0.32
474	0.39
475	0.46
476	0.54
477	0.64
478	0.66
479	0.72
480	0.81
481	0.83
482	0.8
483	0.78
484	0.75
485	0.73
486	0.73
487	0.65
488	0.59
489	0.53
490	0.49
491	0.43
492	0.36
493	0.28
494	0.21
495	0.23
496	0.22
497	0.21
498	0.23
499	0.22
500	0.27
501	0.36
502	0.41
503	0.39
504	0.45
505	0.53
506	0.59
507	0.64
508	0.68
509	0.69
510	0.69
511	0.69
512	0.64
513	0.62
514	0.55
515	0.48
516	0.4
517	0.32
518	0.28
519	0.25
520	0.24
521	0.2
522	0.25
523	0.33
524	0.39
525	0.44
526	0.45
527	0.47
528	0.49
529	0.5
530	0.47
531	0.44
532	0.42
533	0.4
534	0.39
535	0.36
536	0.31
537	0.27
538	0.21
539	0.17
540	0.12
541	0.07
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.05
546	0.08
547	0.09
548	0.11
549	0.15
550	0.17
551	0.22
552	0.27
553	0.29
554	0.31
555	0.35
556	0.42
557	0.45
558	0.5
559	0.53
560	0.53
561	0.52
562	0.49
563	0.45
564	0.35
565	0.29
566	0.27
567	0.2
568	0.16
569	0.16
570	0.17
571	0.19
572	0.2
573	0.2
574	0.18
575	0.18
576	0.2
577	0.2
578	0.22
579	0.21
580	0.22
581	0.22
582	0.21
583	0.23
584	0.21
585	0.22
586	0.2
587	0.2
588	0.18
589	0.18
590	0.2
591	0.18
592	0.18
593	0.18
594	0.16
595	0.15
596	0.16
597	0.14
598	0.13
599	0.14
600	0.14
601	0.11
602	0.11
603	0.11
604	0.14
605	0.15
606	0.14
607	0.16
608	0.17
609	0.17
610	0.21
611	0.26
612	0.26
613	0.3
614	0.39
615	0.39
616	0.43
617	0.53
618	0.56
619	0.57
620	0.57
621	0.55
622	0.53
623	0.59
624	0.56
625	0.48
626	0.49
627	0.47
628	0.51
629	0.55
630	0.54
631	0.51
632	0.51
633	0.5
634	0.5
635	0.47
636	0.45
637	0.47
638	0.46
639	0.47

A0A2N6NXG4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer