Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N6NZ91

Protein Details
Accession A0A2N6NZ91    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-53LELSAYKKVPNNKKRTDARQGTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-142EKKANKSKDSSAGKKRGETKSKGSKEDEPSKKKGRESRAEKT
457-478GEKEKDKGTEARRGRRGRGGRG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF03467  Smg4_UPF3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MLALSETVIAATWEDAKNSFTSPALVGPPSLELSAYKKVPNNKKRTDARQGTIDQDPEFMAFLEGLANPVPLRDSADLDDDDANKGENKVTTTPLVEYLKEKKANKSKDSSAGKKRGETKSKGSKEDEPSKKKGRESRAEKTEKVEKSSTTTVKILTKKAATEQAADAAKNAAKAINAAAAQDAPKSRRAGIASAARILQRDLGLSPGSAHRRARQDAAKADAKAKEASQAEEVPGTSQSTEPAATQEGRAKTNGPTGKSQPGRKGRDGRNGVKTAAVAEAAPQPSATNPPVILKKKEGQANAPNNSASAATGPNSHQNATTKAAAEKNSNPAAATNSKSGQAQKKSPSVTPGATKAFIKHAVHSQGVTEAALRQALEPLGAITAIEMDKRKGFAYIDFGDHDGLVKAIAASPLAVAQGSVQILERKDKKMAPTGSATVAGTATTPAAADLDKAKDGEKEKDKGTEARRGRRGRGGRGNNGGGAANAQAANAPGAQAAQKNGPSATSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.16
4 0.17
5 0.18
6 0.19
7 0.15
8 0.16
9 0.16
10 0.18
11 0.2
12 0.19
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.17
17 0.16
18 0.13
19 0.12
20 0.16
21 0.23
22 0.25
23 0.27
24 0.31
25 0.41
26 0.52
27 0.61
28 0.66
29 0.68
30 0.76
31 0.81
32 0.85
33 0.86
34 0.84
35 0.79
36 0.77
37 0.71
38 0.66
39 0.61
40 0.54
41 0.43
42 0.35
43 0.31
44 0.23
45 0.2
46 0.16
47 0.11
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.12
60 0.13
61 0.15
62 0.16
63 0.2
64 0.2
65 0.21
66 0.23
67 0.2
68 0.2
69 0.17
70 0.16
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.17
76 0.18
77 0.2
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.26
82 0.26
83 0.24
84 0.26
85 0.3
86 0.36
87 0.42
88 0.44
89 0.47
90 0.55
91 0.63
92 0.65
93 0.66
94 0.63
95 0.66
96 0.72
97 0.72
98 0.73
99 0.73
100 0.69
101 0.68
102 0.71
103 0.71
104 0.71
105 0.67
106 0.67
107 0.68
108 0.72
109 0.72
110 0.67
111 0.66
112 0.66
113 0.71
114 0.71
115 0.68
116 0.69
117 0.73
118 0.73
119 0.72
120 0.71
121 0.7
122 0.7
123 0.72
124 0.74
125 0.75
126 0.76
127 0.71
128 0.68
129 0.67
130 0.59
131 0.56
132 0.48
133 0.38
134 0.38
135 0.44
136 0.41
137 0.35
138 0.34
139 0.31
140 0.36
141 0.39
142 0.35
143 0.32
144 0.32
145 0.3
146 0.32
147 0.36
148 0.3
149 0.29
150 0.26
151 0.27
152 0.27
153 0.25
154 0.22
155 0.17
156 0.17
157 0.15
158 0.14
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.11
170 0.13
171 0.11
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.2
176 0.22
177 0.21
178 0.25
179 0.29
180 0.26
181 0.26
182 0.27
183 0.23
184 0.22
185 0.21
186 0.16
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.13
195 0.16
196 0.19
197 0.2
198 0.24
199 0.29
200 0.31
201 0.36
202 0.36
203 0.38
204 0.37
205 0.42
206 0.41
207 0.36
208 0.37
209 0.34
210 0.31
211 0.26
212 0.23
213 0.23
214 0.2
215 0.2
216 0.19
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.16
240 0.23
241 0.24
242 0.21
243 0.23
244 0.25
245 0.33
246 0.36
247 0.39
248 0.41
249 0.48
250 0.51
251 0.55
252 0.61
253 0.59
254 0.64
255 0.68
256 0.65
257 0.63
258 0.59
259 0.53
260 0.44
261 0.38
262 0.28
263 0.21
264 0.16
265 0.08
266 0.07
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.13
274 0.12
275 0.09
276 0.09
277 0.13
278 0.2
279 0.24
280 0.26
281 0.27
282 0.3
283 0.35
284 0.39
285 0.37
286 0.37
287 0.42
288 0.48
289 0.47
290 0.44
291 0.39
292 0.34
293 0.33
294 0.26
295 0.17
296 0.1
297 0.08
298 0.07
299 0.09
300 0.1
301 0.16
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.2
306 0.22
307 0.24
308 0.25
309 0.2
310 0.21
311 0.24
312 0.24
313 0.26
314 0.26
315 0.28
316 0.28
317 0.27
318 0.24
319 0.22
320 0.24
321 0.24
322 0.23
323 0.2
324 0.19
325 0.2
326 0.22
327 0.27
328 0.31
329 0.33
330 0.37
331 0.4
332 0.45
333 0.47
334 0.47
335 0.44
336 0.4
337 0.37
338 0.34
339 0.33
340 0.3
341 0.29
342 0.28
343 0.26
344 0.26
345 0.29
346 0.27
347 0.25
348 0.28
349 0.31
350 0.31
351 0.29
352 0.26
353 0.21
354 0.2
355 0.18
356 0.12
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.12
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.21
383 0.22
384 0.23
385 0.23
386 0.23
387 0.21
388 0.2
389 0.19
390 0.12
391 0.09
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.09
409 0.12
410 0.14
411 0.22
412 0.27
413 0.28
414 0.33
415 0.36
416 0.39
417 0.45
418 0.47
419 0.43
420 0.44
421 0.44
422 0.4
423 0.39
424 0.34
425 0.25
426 0.22
427 0.17
428 0.12
429 0.1
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.1
438 0.13
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.21
443 0.25
444 0.33
445 0.38
446 0.4
447 0.41
448 0.46
449 0.49
450 0.52
451 0.54
452 0.54
453 0.55
454 0.61
455 0.68
456 0.69
457 0.7
458 0.72
459 0.75
460 0.75
461 0.77
462 0.76
463 0.75
464 0.77
465 0.74
466 0.65
467 0.58
468 0.48
469 0.37
470 0.28
471 0.2
472 0.14
473 0.11
474 0.1
475 0.09
476 0.1
477 0.11
478 0.1
479 0.09
480 0.07
481 0.08
482 0.11
483 0.13
484 0.15
485 0.2
486 0.21
487 0.23
488 0.24