Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MDK8

Protein Details
Accession B8MDK8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-74RTATSNPQAKGKKNKQKESKKKVKGARDYQQKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-67AKGKKNKQKESKKKVKGA
Subcellular Location(s) mito 20, cyto 5, cyto_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAYAFRALPVTAGHISASCRSTLRQNSAIAPFLYPLGQQQVRTATSNPQAKGKKNKQKESKKKVKGARDYQQKDLSLIDQYALCDAMRYIRAFEVGRDRERSKYEIHIRLKSRKDGPVIRNMVRFPHAVQTESRICVIAPPGSKHAKDALEAGASIVGEQEVFENIKKGIIEFERCICHTDSLDALNKAGLGRILGPRGLMPSVKTGTVVDDVGIRVQMLRGGTVYRERDAVIRMPIGQLGFSPDQLRDNLRAALEQVKKDTTQLSDRVPKEVYEVVLSSTNGPGFSLNGDFRSDSSPEPAYLTGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.2
4 0.21
5 0.17
6 0.18
7 0.19
8 0.28
9 0.34
10 0.39
11 0.4
12 0.42
13 0.46
14 0.48
15 0.5
16 0.41
17 0.34
18 0.27
19 0.23
20 0.21
21 0.15
22 0.14
23 0.18
24 0.2
25 0.2
26 0.22
27 0.27
28 0.28
29 0.31
30 0.3
31 0.29
32 0.35
33 0.42
34 0.4
35 0.44
36 0.47
37 0.53
38 0.62
39 0.66
40 0.69
41 0.73
42 0.82
43 0.84
44 0.89
45 0.93
46 0.93
47 0.93
48 0.92
49 0.91
50 0.89
51 0.88
52 0.88
53 0.86
54 0.85
55 0.85
56 0.79
57 0.77
58 0.75
59 0.65
60 0.55
61 0.47
62 0.38
63 0.29
64 0.24
65 0.18
66 0.13
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.09
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.15
79 0.15
80 0.18
81 0.24
82 0.26
83 0.29
84 0.33
85 0.34
86 0.36
87 0.38
88 0.38
89 0.31
90 0.36
91 0.41
92 0.45
93 0.49
94 0.53
95 0.56
96 0.62
97 0.64
98 0.61
99 0.58
100 0.53
101 0.54
102 0.55
103 0.53
104 0.54
105 0.55
106 0.51
107 0.49
108 0.45
109 0.4
110 0.34
111 0.31
112 0.22
113 0.23
114 0.21
115 0.19
116 0.19
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.22
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.13
128 0.18
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.24
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.16
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.1
157 0.11
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.18
162 0.19
163 0.22
164 0.19
165 0.18
166 0.16
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.17
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.08
178 0.05
179 0.07
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.14
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.16
212 0.18
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.21
218 0.23
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.18
224 0.16
225 0.14
226 0.1
227 0.14
228 0.13
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.17
233 0.18
234 0.21
235 0.18
236 0.2
237 0.22
238 0.21
239 0.2
240 0.2
241 0.27
242 0.29
243 0.28
244 0.29
245 0.29
246 0.29
247 0.3
248 0.31
249 0.27
250 0.28
251 0.3
252 0.34
253 0.41
254 0.42
255 0.44
256 0.42
257 0.38
258 0.36
259 0.35
260 0.28
261 0.22
262 0.22
263 0.2
264 0.22
265 0.22
266 0.19
267 0.19
268 0.18
269 0.15
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.13
274 0.16
275 0.15
276 0.16
277 0.18
278 0.19
279 0.2
280 0.23
281 0.23
282 0.2
283 0.23
284 0.24
285 0.22
286 0.25