Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I0RKH0

Protein Details
Accession A0A2I0RKH0    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
442-464QAEKERLRKREARKRKAESGDGTBasic
480-499AAAPKLTKKEQTKKAKEATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-458KERLRKREARKRKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAYPMQPQAPKQPPNPYPPYGAPPSASPPAQSAFAPPAKRQRLSPDPRSPAGNSPVYAQSPVYGNYGHSPVQSPYAPQFASPQGPFNTPQQYSPPAGQWPSQQQQQSQYQPIQQRPSQISPPPPSSSLLMPPPPRPKEDKDEKIGVDDIGDSLFGSGINLKDEENYLHSTWHNRHSQNESFQTNNSTSFGSNGSSGNNSYGYITQGTSFGSQGQNGAFAGTIGRPLSQEDIEKEARRKREQAARRQAEQQAYHLNNQFLQGNSVRKRMHQRAMENGVKLDITGVYVRTPEPQQQPQIMVNSDGTTGIAAVKTKPEAMIESGVAYEHMLTLLSLATQERMRGVVDDAYALARARRYGDHGRVIPADFAGISTGPGKQSQETIVSDSVTGSQWDKPTQTPSEGVNGDSQINGLKSTPSPGPVQTVAYQGSLHLKLREIATRDAQAEKERLRKREARKRKAESGDGTTPMDIAPDTPTEAVVAAAPKLTKKEQTKKAKEATASTEAKALETSNQTAAMMALGTKKNRYAWMTGGSKPDATTNRFAKPASGTATPKAQREPQKGPAEAKKTEEKKAPTWGDWREDDVHGKSVELRDLILVLDRDGRDKRTLAKALMRLPVDSNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.73
3 0.66
4 0.63
5 0.6
6 0.61
7 0.56
8 0.52
9 0.44
10 0.4
11 0.42
12 0.41
13 0.37
14 0.31
15 0.28
16 0.28
17 0.28
18 0.25
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.33
23 0.35
24 0.43
25 0.49
26 0.51
27 0.52
28 0.54
29 0.59
30 0.65
31 0.7
32 0.7
33 0.69
34 0.7
35 0.71
36 0.64
37 0.61
38 0.58
39 0.52
40 0.42
41 0.39
42 0.41
43 0.38
44 0.35
45 0.28
46 0.23
47 0.21
48 0.22
49 0.2
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.27
63 0.26
64 0.24
65 0.27
66 0.26
67 0.31
68 0.29
69 0.32
70 0.29
71 0.32
72 0.33
73 0.35
74 0.39
75 0.33
76 0.35
77 0.34
78 0.36
79 0.36
80 0.37
81 0.34
82 0.31
83 0.33
84 0.33
85 0.33
86 0.38
87 0.4
88 0.44
89 0.44
90 0.42
91 0.47
92 0.53
93 0.54
94 0.51
95 0.5
96 0.5
97 0.55
98 0.58
99 0.57
100 0.51
101 0.52
102 0.52
103 0.54
104 0.54
105 0.52
106 0.54
107 0.53
108 0.56
109 0.52
110 0.47
111 0.44
112 0.4
113 0.36
114 0.32
115 0.32
116 0.33
117 0.33
118 0.39
119 0.47
120 0.48
121 0.5
122 0.52
123 0.53
124 0.56
125 0.64
126 0.64
127 0.61
128 0.64
129 0.6
130 0.56
131 0.51
132 0.4
133 0.3
134 0.23
135 0.16
136 0.1
137 0.09
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.06
144 0.06
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.18
156 0.23
157 0.26
158 0.32
159 0.37
160 0.35
161 0.39
162 0.45
163 0.49
164 0.51
165 0.53
166 0.49
167 0.43
168 0.42
169 0.41
170 0.35
171 0.3
172 0.24
173 0.19
174 0.16
175 0.15
176 0.15
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.17
218 0.21
219 0.24
220 0.29
221 0.32
222 0.37
223 0.4
224 0.42
225 0.44
226 0.5
227 0.56
228 0.61
229 0.67
230 0.66
231 0.65
232 0.66
233 0.64
234 0.59
235 0.51
236 0.43
237 0.4
238 0.37
239 0.38
240 0.35
241 0.31
242 0.26
243 0.26
244 0.25
245 0.16
246 0.17
247 0.17
248 0.21
249 0.23
250 0.29
251 0.28
252 0.31
253 0.4
254 0.44
255 0.49
256 0.48
257 0.48
258 0.5
259 0.57
260 0.56
261 0.47
262 0.41
263 0.33
264 0.27
265 0.23
266 0.16
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.1
276 0.16
277 0.2
278 0.24
279 0.27
280 0.27
281 0.29
282 0.29
283 0.3
284 0.24
285 0.2
286 0.16
287 0.14
288 0.12
289 0.1
290 0.08
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.14
342 0.2
343 0.25
344 0.3
345 0.31
346 0.32
347 0.32
348 0.32
349 0.26
350 0.19
351 0.15
352 0.09
353 0.08
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.14
366 0.14
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.11
377 0.12
378 0.14
379 0.15
380 0.16
381 0.21
382 0.22
383 0.23
384 0.22
385 0.21
386 0.25
387 0.24
388 0.23
389 0.2
390 0.19
391 0.17
392 0.15
393 0.14
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.18
406 0.18
407 0.2
408 0.18
409 0.2
410 0.19
411 0.18
412 0.17
413 0.14
414 0.17
415 0.17
416 0.17
417 0.16
418 0.15
419 0.17
420 0.19
421 0.22
422 0.21
423 0.23
424 0.24
425 0.26
426 0.27
427 0.27
428 0.26
429 0.26
430 0.27
431 0.29
432 0.36
433 0.39
434 0.41
435 0.47
436 0.53
437 0.61
438 0.67
439 0.73
440 0.75
441 0.79
442 0.83
443 0.86
444 0.84
445 0.81
446 0.75
447 0.71
448 0.65
449 0.57
450 0.5
451 0.4
452 0.33
453 0.25
454 0.2
455 0.12
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.14
472 0.16
473 0.23
474 0.33
475 0.43
476 0.52
477 0.63
478 0.71
479 0.76
480 0.8
481 0.78
482 0.71
483 0.65
484 0.62
485 0.6
486 0.53
487 0.44
488 0.4
489 0.35
490 0.32
491 0.28
492 0.21
493 0.17
494 0.18
495 0.19
496 0.17
497 0.17
498 0.17
499 0.16
500 0.15
501 0.11
502 0.08
503 0.07
504 0.11
505 0.15
506 0.17
507 0.19
508 0.22
509 0.24
510 0.3
511 0.32
512 0.3
513 0.31
514 0.38
515 0.4
516 0.41
517 0.44
518 0.4
519 0.37
520 0.34
521 0.37
522 0.33
523 0.34
524 0.38
525 0.37
526 0.4
527 0.41
528 0.41
529 0.38
530 0.36
531 0.36
532 0.33
533 0.34
534 0.34
535 0.34
536 0.43
537 0.44
538 0.43
539 0.43
540 0.47
541 0.51
542 0.56
543 0.6
544 0.61
545 0.66
546 0.67
547 0.69
548 0.7
549 0.67
550 0.62
551 0.6
552 0.6
553 0.56
554 0.59
555 0.6
556 0.57
557 0.55
558 0.62
559 0.62
560 0.57
561 0.6
562 0.59
563 0.57
564 0.53
565 0.53
566 0.47
567 0.45
568 0.45
569 0.4
570 0.39
571 0.33
572 0.31
573 0.31
574 0.29
575 0.3
576 0.25
577 0.22
578 0.18
579 0.18
580 0.18
581 0.18
582 0.15
583 0.13
584 0.19
585 0.19
586 0.24
587 0.27
588 0.3
589 0.3
590 0.32
591 0.38
592 0.42
593 0.47
594 0.47
595 0.52
596 0.55
597 0.57
598 0.61
599 0.55
600 0.48