FuNGI

B8LTM6

Protein Details

Accession

B8LTM6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
143-163	LNKHCKQIKLCARSKRWWNSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto_nucl 6.5, nucl 5.5, pero 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MRHDLFINNDPDEPTRPHKPRDSTASFETSTEPRVSIIDLTISSQALGPLSGWEIESQRLTPSDHVMIWASWEPPATMSTEPTRKEVTGWQIEALLGDKKALQEAKDTWNELAKTQPILTDTTSTEEVEREAEWIERTLTEVLNKHCKQIKLCARSKRWWNSEIEAERSVYSKARKAYQAGEISEEEHREARTTPALTDEASGEVIAATFSEKEEVFRHRAFPQAPNSNMQLQLPERGSAHKLVNEEVVKNALFSQGLEKAPGTDLLNFRAIRLLWNLDSERVVSLTRQCLRLGIHPRVWKTAKGVLLRKNGKTNYTLASAYRVISLLKCLGKVIEKLVAELITNFAEAQDLFHDGQFGGRQQRSAIDAVACLVEEIHQAWANGKLAAALFMDIEGAFDHVILAKLVEVLREASVDGDLIHWVISFLSDRRVTLVIDGHVGKEVPISSGLPQGSPVSPILFVLYVHGLSRAIERSVLEVRCLSFVDDQGLVTAASSVKEACRILEKAAEVAIERQVAQNVSRARIRVGGELATVKSTVRWLGILLDNQLTWKSHYNARIKTARNTIIRLNSLCRANGLPPALVRRIQKATVQAQLLWGAEIWWQGQKTWAQRIQILINKQARGITGMFPKTPIGALIREAALEPATVLLDARVARYTARLLALPDTHPTAQILPVTLRHGDLHAQPGEQPLDDREWASRDNKVLNRLGQRLAKHLAQRLNRDPSGGIERTERCELKSFPGSIRVLDKEEALTEANQQRAGTTFWSDGSRLDTGRAGAGVTLQAVPGGPWEHVEVPMGHGHEVFDAELVGVATALEWALERQPLGPIWVFLDAQNAIDRLRSTRPGPGQALVLRAHKAAEKLALRGQPVTIQWVPGHSGIEGNEQADQAAKRAASKQTAPGFEHLSLAHVRRACTEARRAAVSEWAQINAVQGRHRDGRVYKMPRGWNLDPVAGKAPKRLASRYYQLKTGHAPIGTYLYRIGRRESPECQACKEPHETVRHVLFECRGRRTGRRTLYQALKKAGVPLPTAAEEDPEARLFAEPRATQGLLQFVAEANLFNDKERTAREAESSDAWGWDTLEEGGLGVTLEDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.41
3	0.46
4	0.52
5	0.59
6	0.64
7	0.68
8	0.73
9	0.73
10	0.69
11	0.68
12	0.66
13	0.58
14	0.51
15	0.47
16	0.39
17	0.36
18	0.31
19	0.25
20	0.2
21	0.2
22	0.2
23	0.17
24	0.16
25	0.15
26	0.14
27	0.16
28	0.17
29	0.16
30	0.15
31	0.14
32	0.13
33	0.11
34	0.11
35	0.09
36	0.08
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.11
41	0.13
42	0.15
43	0.17
44	0.16
45	0.17
46	0.19
47	0.21
48	0.21
49	0.24
50	0.25
51	0.23
52	0.24
53	0.24
54	0.22
55	0.23
56	0.24
57	0.19
58	0.17
59	0.17
60	0.16
61	0.15
62	0.16
63	0.14
64	0.13
65	0.16
66	0.23
67	0.3
68	0.31
69	0.34
70	0.37
71	0.34
72	0.36
73	0.38
74	0.4
75	0.41
76	0.4
77	0.37
78	0.34
79	0.34
80	0.32
81	0.27
82	0.21
83	0.13
84	0.12
85	0.13
86	0.13
87	0.18
88	0.2
89	0.19
90	0.22
91	0.26
92	0.33
93	0.37
94	0.38
95	0.34
96	0.39
97	0.39
98	0.33
99	0.35
100	0.3
101	0.27
102	0.26
103	0.26
104	0.21
105	0.23
106	0.24
107	0.21
108	0.2
109	0.22
110	0.22
111	0.21
112	0.2
113	0.18
114	0.17
115	0.15
116	0.14
117	0.11
118	0.11
119	0.12
120	0.12
121	0.13
122	0.13
123	0.12
124	0.14
125	0.15
126	0.15
127	0.18
128	0.22
129	0.27
130	0.37
131	0.37
132	0.42
133	0.46
134	0.49
135	0.48
136	0.54
137	0.58
138	0.58
139	0.65
140	0.69
141	0.7
142	0.75
143	0.82
144	0.81
145	0.78
146	0.73
147	0.7
148	0.64
149	0.67
150	0.62
151	0.57
152	0.48
153	0.43
154	0.38
155	0.34
156	0.31
157	0.26
158	0.25
159	0.26
160	0.28
161	0.33
162	0.37
163	0.39
164	0.42
165	0.45
166	0.47
167	0.43
168	0.42
169	0.36
170	0.34
171	0.33
172	0.3
173	0.23
174	0.19
175	0.19
176	0.16
177	0.17
178	0.18
179	0.21
180	0.21
181	0.2
182	0.21
183	0.22
184	0.21
185	0.21
186	0.18
187	0.14
188	0.13
189	0.12
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.07
199	0.07
200	0.1
201	0.13
202	0.19
203	0.24
204	0.25
205	0.28
206	0.28
207	0.35
208	0.36
209	0.39
210	0.43
211	0.46
212	0.46
213	0.46
214	0.47
215	0.44
216	0.42
217	0.36
218	0.31
219	0.23
220	0.27
221	0.25
222	0.23
223	0.21
224	0.23
225	0.25
226	0.24
227	0.26
228	0.23
229	0.23
230	0.22
231	0.28
232	0.27
233	0.26
234	0.22
235	0.22
236	0.19
237	0.18
238	0.17
239	0.12
240	0.1
241	0.1
242	0.13
243	0.15
244	0.16
245	0.17
246	0.16
247	0.16
248	0.17
249	0.19
250	0.16
251	0.16
252	0.17
253	0.19
254	0.25
255	0.23
256	0.23
257	0.23
258	0.22
259	0.19
260	0.21
261	0.22
262	0.16
263	0.21
264	0.21
265	0.2
266	0.2
267	0.18
268	0.16
269	0.14
270	0.13
271	0.11
272	0.14
273	0.21
274	0.24
275	0.25
276	0.24
277	0.26
278	0.27
279	0.34
280	0.38
281	0.36
282	0.39
283	0.43
284	0.45
285	0.5
286	0.5
287	0.44
288	0.4
289	0.39
290	0.39
291	0.41
292	0.46
293	0.46
294	0.54
295	0.58
296	0.57
297	0.59
298	0.56
299	0.51
300	0.47
301	0.42
302	0.35
303	0.32
304	0.3
305	0.22
306	0.24
307	0.22
308	0.2
309	0.18
310	0.15
311	0.13
312	0.12
313	0.14
314	0.14
315	0.14
316	0.14
317	0.14
318	0.15
319	0.17
320	0.18
321	0.18
322	0.18
323	0.17
324	0.17
325	0.18
326	0.17
327	0.14
328	0.13
329	0.13
330	0.08
331	0.08
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.08
339	0.09
340	0.09
341	0.1
342	0.09
343	0.1
344	0.11
345	0.12
346	0.17
347	0.17
348	0.17
349	0.17
350	0.19
351	0.2
352	0.2
353	0.18
354	0.12
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.09
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.07
366	0.08
367	0.09
368	0.11
369	0.12
370	0.11
371	0.11
372	0.1
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.05
414	0.1
415	0.1
416	0.11
417	0.12
418	0.14
419	0.13
420	0.13
421	0.15
422	0.11
423	0.13
424	0.13
425	0.12
426	0.11
427	0.11
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.06
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.11
436	0.12
437	0.1
438	0.11
439	0.12
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.07
448	0.07
449	0.06
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.11
462	0.16
463	0.16
464	0.15
465	0.14
466	0.15
467	0.15
468	0.15
469	0.14
470	0.09
471	0.1
472	0.11
473	0.1
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.11
489	0.12
490	0.12
491	0.14
492	0.14
493	0.12
494	0.13
495	0.12
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.08
504	0.09
505	0.12
506	0.13
507	0.15
508	0.16
509	0.16
510	0.16
511	0.19
512	0.2
513	0.17
514	0.16
515	0.14
516	0.14
517	0.14
518	0.14
519	0.1
520	0.09
521	0.07
522	0.06
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.05
528	0.07
529	0.09
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.1
536	0.09
537	0.09
538	0.11
539	0.12
540	0.16
541	0.23
542	0.3
543	0.32
544	0.37
545	0.42
546	0.42
547	0.44
548	0.47
549	0.46
550	0.41
551	0.41
552	0.38
553	0.35
554	0.35
555	0.31
556	0.27
557	0.25
558	0.24
559	0.22
560	0.19
561	0.16
562	0.15
563	0.17
564	0.16
565	0.12
566	0.12
567	0.15
568	0.16
569	0.18
570	0.18
571	0.2
572	0.21
573	0.22
574	0.24
575	0.26
576	0.27
577	0.28
578	0.28
579	0.24
580	0.22
581	0.22
582	0.19
583	0.14
584	0.11
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.1
593	0.14
594	0.16
595	0.23
596	0.26
597	0.25
598	0.26
599	0.29
600	0.31
601	0.31
602	0.3
603	0.3
604	0.31
605	0.3
606	0.29
607	0.28
608	0.23
609	0.21
610	0.2
611	0.17
612	0.18
613	0.19
614	0.19
615	0.19
616	0.19
617	0.17
618	0.16
619	0.13
620	0.09
621	0.08
622	0.09
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.09
628	0.07
629	0.06
630	0.05
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.03
636	0.05
637	0.05
638	0.06
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.09
644	0.09
645	0.1
646	0.1
647	0.1
648	0.12
649	0.14
650	0.13
651	0.14
652	0.15
653	0.14
654	0.14
655	0.14
656	0.12
657	0.12
658	0.11
659	0.11
660	0.09
661	0.1
662	0.12
663	0.12
664	0.12
665	0.11
666	0.11
667	0.13
668	0.13
669	0.17
670	0.16
671	0.16
672	0.15
673	0.18
674	0.17
675	0.15
676	0.14
677	0.1
678	0.12
679	0.13
680	0.13
681	0.11
682	0.13
683	0.16
684	0.17
685	0.18
686	0.18
687	0.24
688	0.26
689	0.3
690	0.32
691	0.34
692	0.38
693	0.38
694	0.4
695	0.38
696	0.36
697	0.35
698	0.35
699	0.34
700	0.32
701	0.35
702	0.37
703	0.38
704	0.44
705	0.47
706	0.51
707	0.47
708	0.44
709	0.39
710	0.35
711	0.37
712	0.31
713	0.25
714	0.23
715	0.25
716	0.28
717	0.33
718	0.3
719	0.25
720	0.29
721	0.29
722	0.3
723	0.34
724	0.31
725	0.27
726	0.34
727	0.33
728	0.29
729	0.32
730	0.28
731	0.25
732	0.24
733	0.23
734	0.16
735	0.16
736	0.16
737	0.13
738	0.11
739	0.15
740	0.18
741	0.18
742	0.19
743	0.18
744	0.17
745	0.18
746	0.18
747	0.14
748	0.13
749	0.12
750	0.13
751	0.14
752	0.14
753	0.14
754	0.16
755	0.16
756	0.14
757	0.15
758	0.14
759	0.13
760	0.13
761	0.13
762	0.09
763	0.07
764	0.07
765	0.06
766	0.06
767	0.06
768	0.05
769	0.05
770	0.05
771	0.05
772	0.06
773	0.07
774	0.06
775	0.07
776	0.09
777	0.1
778	0.11
779	0.12
780	0.11
781	0.12
782	0.15
783	0.15
784	0.13
785	0.12
786	0.12
787	0.11
788	0.11
789	0.09
790	0.06
791	0.06
792	0.05
793	0.05
794	0.05
795	0.04
796	0.04
797	0.03
798	0.03
799	0.03
800	0.03
801	0.03
802	0.03
803	0.04
804	0.05
805	0.06
806	0.06
807	0.07
808	0.09
809	0.09
810	0.12
811	0.12
812	0.11
813	0.12
814	0.14
815	0.13
816	0.12
817	0.15
818	0.12
819	0.13
820	0.14
821	0.13
822	0.11
823	0.12
824	0.13
825	0.13
826	0.17
827	0.2
828	0.2
829	0.28
830	0.32
831	0.36
832	0.38
833	0.36
834	0.36
835	0.34
836	0.36
837	0.31
838	0.29
839	0.24
840	0.22
841	0.22
842	0.19
843	0.19
844	0.17
845	0.21
846	0.2
847	0.22
848	0.27
849	0.28
850	0.28
851	0.27
852	0.26
853	0.23
854	0.21
855	0.26
856	0.21
857	0.2
858	0.19
859	0.2
860	0.22
861	0.2
862	0.2
863	0.13
864	0.14
865	0.13
866	0.18
867	0.17
868	0.15
869	0.15
870	0.14
871	0.14
872	0.16
873	0.15
874	0.11
875	0.13
876	0.13
877	0.14
878	0.19
879	0.24
880	0.25
881	0.28
882	0.35
883	0.39
884	0.43
885	0.43
886	0.41
887	0.4
888	0.36
889	0.35
890	0.27
891	0.23
892	0.22
893	0.22
894	0.23
895	0.21
896	0.22
897	0.22
898	0.25
899	0.26
900	0.29
901	0.35
902	0.36
903	0.37
904	0.39
905	0.38
906	0.36
907	0.4
908	0.35
909	0.33
910	0.28
911	0.26
912	0.24
913	0.23
914	0.25
915	0.21
916	0.22
917	0.19
918	0.2
919	0.25
920	0.29
921	0.3
922	0.34
923	0.32
924	0.4
925	0.46
926	0.52
927	0.52
928	0.55
929	0.6
930	0.6
931	0.66
932	0.59
933	0.56
934	0.52
935	0.51
936	0.44
937	0.41
938	0.42
939	0.37
940	0.36
941	0.34
942	0.36
943	0.38
944	0.42
945	0.43
946	0.41
947	0.44
948	0.53
949	0.58
950	0.56
951	0.55
952	0.53
953	0.53
954	0.53
955	0.51
956	0.46
957	0.36
958	0.33
959	0.28
960	0.32
961	0.28
962	0.24
963	0.22
964	0.23
965	0.28
966	0.29
967	0.32
968	0.33
969	0.39
970	0.43
971	0.45
972	0.49
973	0.52
974	0.53
975	0.53
976	0.54
977	0.5
978	0.5
979	0.52
980	0.48
981	0.47
982	0.52
983	0.51
984	0.5
985	0.52
986	0.51
987	0.46
988	0.43
989	0.42
990	0.43
991	0.45
992	0.44
993	0.45
994	0.46
995	0.54
996	0.58
997	0.63
998	0.63
999	0.66
1000	0.67
1001	0.7
1002	0.76
1003	0.76
1004	0.75
1005	0.7
1006	0.64
1007	0.56
1008	0.57
1009	0.51
1010	0.44
1011	0.38
1012	0.33
1013	0.31
1014	0.29
1015	0.31
1016	0.24
1017	0.22
1018	0.2
1019	0.19
1020	0.19
1021	0.16
1022	0.15
1023	0.13
1024	0.16
1025	0.15
1026	0.16
1027	0.23
1028	0.2
1029	0.23
1030	0.28
1031	0.28
1032	0.27
1033	0.28
1034	0.31
1035	0.23
1036	0.23
1037	0.2
1038	0.15
1039	0.16
1040	0.15
1041	0.13
1042	0.09
1043	0.15
1044	0.15
1045	0.16
1046	0.18
1047	0.17
1048	0.21
1049	0.23
1050	0.27
1051	0.24
1052	0.26
1053	0.29
1054	0.3
1055	0.32
1056	0.31
1057	0.32
1058	0.28
1059	0.25
1060	0.24
1061	0.2
1062	0.18
1063	0.15
1064	0.14
1065	0.1
1066	0.1
1067	0.09
1068	0.08
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.06

B8LTM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer