FuNGI

B8MSW2

Protein Details

Accession

B8MSW2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-56	GNDFKDYCKRKRKILVTTVPD	Hydrophilic
379-398	SESSKNVRKKQRAAFARMKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MKSVNFDLERLIEDIEHTFKCVIKTIHVDGESSINGNDFKDYCKRKRKILVTTVPDTPEQNGLSEKAGDIIATRARSMIIEANLSEGLWLEAARAAVHIMNQTLTKSLNYKTPYESVYRKKSYVGNLFLFGSKTYVRIDIKKSHKVAPRAQIRYLVGYKAHNIWLIWTTGPRGTKVIRARDVVFDETKRYDLEHPFAREIIRDGVTTITESLEISNLEDIDEDNQVFDSVDDDIRLQRWQPASIRFSPARGSNEFQIEAPITGIGNIEAQNDEHIYNPDMQMEDAQEIFQDICTENRGDSNIVESGGVKEDEVVSAPNTPLRNVTGSEKEITLPSTPLNNNNAPKAAEISADLLERNIVTGPRVRIASKRARSLATDNSESSKNVRKKQRAAFARMKLFQESSLAKSFMAAMEKTDNLHESELPPEPKNWTGVLRHKYKKEFIEAAKTKFDTLKKKGTFKFVQKLYNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.19
3	0.18
4	0.18
5	0.18
6	0.2
7	0.21
8	0.26
9	0.24
10	0.26
11	0.32
12	0.35
13	0.4
14	0.39
15	0.38
16	0.33
17	0.35
18	0.29
19	0.24
20	0.2
21	0.14
22	0.14
23	0.14
24	0.17
25	0.13
26	0.17
27	0.26
28	0.35
29	0.44
30	0.54
31	0.58
32	0.64
33	0.74
34	0.79
35	0.8
36	0.82
37	0.82
38	0.78
39	0.78
40	0.73
41	0.65
42	0.57
43	0.48
44	0.38
45	0.33
46	0.26
47	0.23
48	0.2
49	0.2
50	0.2
51	0.19
52	0.17
53	0.13
54	0.13
55	0.11
56	0.1
57	0.12
58	0.14
59	0.15
60	0.15
61	0.14
62	0.14
63	0.14
64	0.16
65	0.17
66	0.15
67	0.16
68	0.15
69	0.17
70	0.17
71	0.17
72	0.14
73	0.09
74	0.08
75	0.07
76	0.07
77	0.05
78	0.06
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.09
85	0.1
86	0.09
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.11
91	0.12
92	0.12
93	0.14
94	0.15
95	0.2
96	0.23
97	0.25
98	0.27
99	0.29
100	0.3
101	0.33
102	0.4
103	0.42
104	0.49
105	0.5
106	0.48
107	0.48
108	0.51
109	0.53
110	0.54
111	0.51
112	0.43
113	0.41
114	0.41
115	0.38
116	0.34
117	0.25
118	0.2
119	0.13
120	0.13
121	0.12
122	0.17
123	0.19
124	0.23
125	0.28
126	0.35
127	0.42
128	0.49
129	0.51
130	0.54
131	0.57
132	0.6
133	0.62
134	0.62
135	0.64
136	0.6
137	0.59
138	0.56
139	0.5
140	0.49
141	0.43
142	0.35
143	0.27
144	0.24
145	0.25
146	0.22
147	0.22
148	0.18
149	0.16
150	0.16
151	0.15
152	0.15
153	0.13
154	0.12
155	0.12
156	0.14
157	0.15
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.22
162	0.28
163	0.34
164	0.34
165	0.36
166	0.37
167	0.38
168	0.4
169	0.36
170	0.32
171	0.25
172	0.24
173	0.22
174	0.22
175	0.18
176	0.17
177	0.19
178	0.19
179	0.23
180	0.26
181	0.27
182	0.27
183	0.28
184	0.26
185	0.22
186	0.21
187	0.19
188	0.15
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.09
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.1
225	0.11
226	0.14
227	0.17
228	0.22
229	0.26
230	0.27
231	0.32
232	0.28
233	0.28
234	0.28
235	0.29
236	0.27
237	0.25
238	0.25
239	0.22
240	0.24
241	0.24
242	0.22
243	0.19
244	0.15
245	0.12
246	0.11
247	0.08
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.1
264	0.1
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.08
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.08
281	0.09
282	0.08
283	0.09
284	0.11
285	0.1
286	0.1
287	0.12
288	0.11
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.08
300	0.07
301	0.06
302	0.08
303	0.08
304	0.11
305	0.11
306	0.12
307	0.13
308	0.14
309	0.15
310	0.15
311	0.2
312	0.21
313	0.23
314	0.24
315	0.23
316	0.22
317	0.21
318	0.2
319	0.17
320	0.13
321	0.12
322	0.17
323	0.18
324	0.22
325	0.27
326	0.31
327	0.32
328	0.33
329	0.34
330	0.29
331	0.28
332	0.27
333	0.22
334	0.16
335	0.15
336	0.15
337	0.14
338	0.14
339	0.13
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.08
347	0.14
348	0.15
349	0.18
350	0.2
351	0.21
352	0.24
353	0.32
354	0.41
355	0.42
356	0.48
357	0.48
358	0.48
359	0.51
360	0.52
361	0.52
362	0.48
363	0.45
364	0.39
365	0.39
366	0.38
367	0.35
368	0.34
369	0.35
370	0.37
371	0.42
372	0.52
373	0.57
374	0.65
375	0.73
376	0.8
377	0.78
378	0.8
379	0.8
380	0.79
381	0.78
382	0.74
383	0.67
384	0.6
385	0.53
386	0.44
387	0.4
388	0.34
389	0.3
390	0.3
391	0.28
392	0.24
393	0.24
394	0.24
395	0.2
396	0.21
397	0.17
398	0.15
399	0.18
400	0.19
401	0.2
402	0.21
403	0.2
404	0.18
405	0.2
406	0.19
407	0.16
408	0.2
409	0.26
410	0.28
411	0.28
412	0.28
413	0.31
414	0.31
415	0.33
416	0.31
417	0.29
418	0.34
419	0.42
420	0.49
421	0.54
422	0.61
423	0.66
424	0.71
425	0.74
426	0.72
427	0.71
428	0.71
429	0.66
430	0.69
431	0.68
432	0.65
433	0.65
434	0.59
435	0.53
436	0.51
437	0.53
438	0.52
439	0.52
440	0.59
441	0.59
442	0.67
443	0.7
444	0.74
445	0.76
446	0.76
447	0.78
448	0.74

B8MSW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer