Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I0S578

Protein Details
Accession A0A2I0S578    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MADSRPRTRGRGRRPQHARAPLPPNSHydrophilic
423-442QRDWRWHKVLRKWLQKDTREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-16RTRGRGRRPQ
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
Amino Acid Sequences MADSRPRTRGRGRRPQHARAPLPPNSYPDRASITDSIAGDTGSHAQMRTMNMGSFGAQPNARQNSRLQNTQKTGLGNGNAGAGWAFGAPASAATGFGAPGLARPGQLSGFAQIMGGGTQTQIDMNDFPTLAGPGRSNYNNANSWNSNAVRQAQPPSQQSVQQQRVPSTAPSQVSGDHYESQRSQQQSTDRGGTDRSEFPQQSDQVSANGDSARQNGLGSSILGSPRDSIPQTNGQQSQLPMREVSGASQQAPIGSGQPTPQSHAGPPPQGFEGQTLPHASHTKRWADLTEPERYGMAGLMSQLEARRAIESNQPMDESLPVWTRNTAFLMGQETPDFGMDLNNPEPLYPTFSVFSTRTPSDSSYDFRDQYTVPSFHVPPAYTVNNVPEMASRMPAFSDETLFCIFYQMPRDIMQEMAATQLNQRDWRWHKVLRKWLQKDTREANAGAAPALVDHTNGAPIGQEPIRINERSERGVYIFFEEKDWRRERREFTLDYDSLYVTNLLPTAATAGAYGGGGRSGNFGGINGGPVGSVDQSAITTPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.86
3 0.86
4 0.86
5 0.82
6 0.8
7 0.81
8 0.77
9 0.75
10 0.68
11 0.63
12 0.59
13 0.57
14 0.49
15 0.44
16 0.43
17 0.37
18 0.39
19 0.35
20 0.32
21 0.33
22 0.32
23 0.29
24 0.23
25 0.21
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.17
34 0.19
35 0.22
36 0.21
37 0.19
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.21
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.22
46 0.29
47 0.36
48 0.36
49 0.33
50 0.37
51 0.43
52 0.48
53 0.55
54 0.53
55 0.55
56 0.59
57 0.61
58 0.59
59 0.5
60 0.47
61 0.43
62 0.38
63 0.29
64 0.25
65 0.21
66 0.17
67 0.16
68 0.13
69 0.08
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.03
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.06
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.05
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.15
122 0.16
123 0.18
124 0.2
125 0.25
126 0.27
127 0.29
128 0.33
129 0.29
130 0.3
131 0.33
132 0.31
133 0.28
134 0.27
135 0.29
136 0.26
137 0.28
138 0.31
139 0.29
140 0.35
141 0.35
142 0.38
143 0.36
144 0.37
145 0.41
146 0.46
147 0.48
148 0.46
149 0.46
150 0.43
151 0.43
152 0.4
153 0.35
154 0.28
155 0.27
156 0.24
157 0.22
158 0.21
159 0.21
160 0.22
161 0.24
162 0.23
163 0.21
164 0.21
165 0.23
166 0.23
167 0.25
168 0.27
169 0.26
170 0.25
171 0.25
172 0.29
173 0.31
174 0.33
175 0.34
176 0.29
177 0.27
178 0.28
179 0.25
180 0.24
181 0.22
182 0.21
183 0.24
184 0.23
185 0.25
186 0.3
187 0.3
188 0.27
189 0.27
190 0.25
191 0.19
192 0.2
193 0.18
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.14
217 0.21
218 0.23
219 0.27
220 0.28
221 0.26
222 0.28
223 0.28
224 0.3
225 0.24
226 0.23
227 0.18
228 0.17
229 0.17
230 0.15
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.2
251 0.22
252 0.22
253 0.22
254 0.21
255 0.2
256 0.19
257 0.19
258 0.15
259 0.14
260 0.11
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.12
265 0.15
266 0.14
267 0.17
268 0.22
269 0.23
270 0.24
271 0.24
272 0.23
273 0.22
274 0.29
275 0.27
276 0.28
277 0.26
278 0.25
279 0.24
280 0.23
281 0.2
282 0.13
283 0.1
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.15
297 0.18
298 0.19
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.17
303 0.16
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.1
315 0.11
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.14
333 0.13
334 0.17
335 0.15
336 0.16
337 0.15
338 0.16
339 0.2
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.2
346 0.22
347 0.2
348 0.22
349 0.23
350 0.24
351 0.28
352 0.27
353 0.26
354 0.26
355 0.24
356 0.26
357 0.29
358 0.23
359 0.2
360 0.24
361 0.24
362 0.24
363 0.27
364 0.23
365 0.19
366 0.23
367 0.23
368 0.21
369 0.21
370 0.21
371 0.21
372 0.2
373 0.19
374 0.15
375 0.17
376 0.16
377 0.17
378 0.15
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.14
383 0.11
384 0.14
385 0.12
386 0.15
387 0.15
388 0.16
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.17
394 0.16
395 0.17
396 0.18
397 0.19
398 0.18
399 0.18
400 0.17
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.12
405 0.1
406 0.11
407 0.15
408 0.16
409 0.19
410 0.2
411 0.27
412 0.32
413 0.4
414 0.45
415 0.48
416 0.54
417 0.6
418 0.7
419 0.7
420 0.76
421 0.75
422 0.78
423 0.81
424 0.77
425 0.78
426 0.72
427 0.69
428 0.62
429 0.56
430 0.48
431 0.4
432 0.35
433 0.26
434 0.2
435 0.13
436 0.09
437 0.1
438 0.08
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.12
448 0.11
449 0.15
450 0.15
451 0.21
452 0.26
453 0.26
454 0.28
455 0.32
456 0.35
457 0.36
458 0.36
459 0.33
460 0.3
461 0.31
462 0.3
463 0.28
464 0.28
465 0.24
466 0.25
467 0.3
468 0.32
469 0.39
470 0.44
471 0.45
472 0.49
473 0.57
474 0.6
475 0.63
476 0.67
477 0.61
478 0.61
479 0.64
480 0.57
481 0.51
482 0.46
483 0.36
484 0.28
485 0.26
486 0.21
487 0.11
488 0.12
489 0.1
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.12
511 0.12
512 0.14
513 0.11
514 0.11
515 0.09
516 0.1
517 0.11
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.08
522 0.08