Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I0RIT6

Protein Details
Accession A0A2I0RIT6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
420-446VKAAQRQKQREDRERRQSNKRPRYSNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-440RRRETEVKAAQRQKQREDRERRQSNKR
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 9, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIISPVVEEHAQKVQNADGSETVIPIDARGPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPANEEEMMIAIFEYTERVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDAEAAEFHARMVANGERSADGEGADKPKKTWDSNSITPGTPFMDLLAQSLRYWISYKLSTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPDHDPNTRHVMYGLDADLIMLGLATHEPHFRILREDVFANDTKPGHCRKCNQPGHIAVNCQGLTAKNDRSAEEKVEKPLKPFIWLHVGILREYLAIEMSVPNQGFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREDGIDTLIAIWRDNLPVMGGYVTKDGHVDLARAQLILEGLAKQENAIFKRRRETEVKAAQRQKQREDRERRQSNKRPRYSNNGEPTGFDETVIRRGARGGIIRGEAAPDPNALATFAPSLAQTMHDPRYQKSLTHADIVGGASGHENKSAAAALKEKLMGNKRGSDSQRSDIDALMASATGGQDLTPKLGKRTRDMIDDAAADDASSDPSTPGRNTPDKEIANPTDRGTSGQLGGNKDASDGMPEDTVKLWEDGYEERYYEQKFHVSPDDAEFRHKVARHYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAANFKDMDKQVVHFEKGKPFHPYEQLMGVMPAASNHTLPAVFHPLMTDDDSPIKEFYPEEFEVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKKLLEAMRTKYPLLTEDEKRRNGFGEEVLIFSTKHPLYNEVVSNFYGKKADKDKFKINSKVSEGLAGKASKDTSYIPNSELTYPLPPGGQDQFTSLDVDESVKVSYHMPVFNQVHKSMLLPGVKFNDTVLDYQDVEQTRQKAERSGRSHGGVQLSQNGDRSDGRRINYAARDNGNSGYDNRNGGGYGNGGHGYGANGGYGRNGPPAAADPYASQAAAAFQNLPPHLAAQAAQHGYAPPPGAGPPRGYPPPQSQYGYPPAQHGYGGGGGRGGGGGGGGYGGGRGGYDNRGRGGYGYDNRSGGGYNSGGGYQGYQGGGGRGNGRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.66
4 0.68
5 0.65
6 0.62
7 0.59
8 0.54
9 0.51
10 0.47
11 0.42
12 0.41
13 0.38
14 0.31
15 0.28
16 0.28
17 0.26
18 0.27
19 0.26
20 0.2
21 0.21
22 0.21
23 0.2
24 0.17
25 0.14
26 0.13
27 0.11
28 0.15
29 0.15
30 0.17
31 0.23
32 0.25
33 0.27
34 0.3
35 0.32
36 0.3
37 0.27
38 0.27
39 0.25
40 0.26
41 0.22
42 0.2
43 0.18
44 0.15
45 0.14
46 0.12
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.31
58 0.39
59 0.45
60 0.53
61 0.53
62 0.53
63 0.53
64 0.53
65 0.44
66 0.38
67 0.32
68 0.24
69 0.21
70 0.15
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.1
81 0.16
82 0.26
83 0.33
84 0.36
85 0.37
86 0.39
87 0.41
88 0.41
89 0.39
90 0.32
91 0.29
92 0.27
93 0.25
94 0.24
95 0.21
96 0.2
97 0.18
98 0.15
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.37
104 0.45
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.82
110 0.79
111 0.76
112 0.76
113 0.73
114 0.7
115 0.71
116 0.63
117 0.59
118 0.56
119 0.48
120 0.39
121 0.31
122 0.24
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.11
127 0.11
128 0.14
129 0.12
130 0.12
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.18
135 0.2
136 0.17
137 0.18
138 0.2
139 0.16
140 0.13
141 0.12
142 0.15
143 0.21
144 0.24
145 0.24
146 0.23
147 0.3
148 0.36
149 0.38
150 0.41
151 0.44
152 0.49
153 0.54
154 0.6
155 0.55
156 0.51
157 0.47
158 0.41
159 0.33
160 0.25
161 0.19
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.16
175 0.18
176 0.2
177 0.23
178 0.27
179 0.26
180 0.3
181 0.32
182 0.34
183 0.36
184 0.34
185 0.31
186 0.31
187 0.36
188 0.3
189 0.29
190 0.25
191 0.21
192 0.24
193 0.24
194 0.21
195 0.16
196 0.15
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.18
207 0.22
208 0.3
209 0.31
210 0.33
211 0.35
212 0.39
213 0.45
214 0.48
215 0.53
216 0.52
217 0.56
218 0.58
219 0.57
220 0.61
221 0.53
222 0.47
223 0.37
224 0.31
225 0.26
226 0.24
227 0.19
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.06
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.05
240 0.07
241 0.08
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.18
246 0.2
247 0.21
248 0.23
249 0.23
250 0.21
251 0.23
252 0.23
253 0.2
254 0.2
255 0.19
256 0.18
257 0.22
258 0.29
259 0.32
260 0.37
261 0.44
262 0.5
263 0.6
264 0.67
265 0.66
266 0.66
267 0.66
268 0.68
269 0.63
270 0.55
271 0.46
272 0.44
273 0.39
274 0.31
275 0.25
276 0.19
277 0.2
278 0.23
279 0.23
280 0.23
281 0.24
282 0.25
283 0.28
284 0.29
285 0.31
286 0.32
287 0.32
288 0.34
289 0.41
290 0.41
291 0.4
292 0.45
293 0.4
294 0.39
295 0.38
296 0.34
297 0.34
298 0.33
299 0.31
300 0.27
301 0.28
302 0.22
303 0.22
304 0.18
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.14
321 0.12
322 0.15
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.2
327 0.18
328 0.14
329 0.13
330 0.11
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.08
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.07
356 0.05
357 0.05
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.08
395 0.11
396 0.13
397 0.21
398 0.25
399 0.27
400 0.35
401 0.38
402 0.42
403 0.43
404 0.47
405 0.49
406 0.55
407 0.6
408 0.61
409 0.65
410 0.66
411 0.68
412 0.67
413 0.65
414 0.64
415 0.66
416 0.68
417 0.71
418 0.74
419 0.78
420 0.83
421 0.82
422 0.84
423 0.85
424 0.85
425 0.85
426 0.83
427 0.8
428 0.75
429 0.78
430 0.75
431 0.74
432 0.71
433 0.65
434 0.57
435 0.5
436 0.48
437 0.43
438 0.35
439 0.26
440 0.2
441 0.15
442 0.19
443 0.2
444 0.17
445 0.11
446 0.12
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.13
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.14
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.07
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.07
474 0.11
475 0.14
476 0.16
477 0.17
478 0.18
479 0.25
480 0.24
481 0.23
482 0.25
483 0.29
484 0.28
485 0.29
486 0.28
487 0.21
488 0.21
489 0.21
490 0.15
491 0.09
492 0.07
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.11
507 0.11
508 0.15
509 0.19
510 0.23
511 0.23
512 0.27
513 0.28
514 0.33
515 0.35
516 0.36
517 0.35
518 0.35
519 0.35
520 0.32
521 0.31
522 0.24
523 0.23
524 0.16
525 0.13
526 0.08
527 0.06
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.09
538 0.09
539 0.13
540 0.17
541 0.19
542 0.2
543 0.27
544 0.28
545 0.29
546 0.31
547 0.28
548 0.26
549 0.24
550 0.21
551 0.15
552 0.12
553 0.09
554 0.07
555 0.06
556 0.05
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.11
564 0.15
565 0.2
566 0.22
567 0.26
568 0.33
569 0.32
570 0.33
571 0.36
572 0.33
573 0.32
574 0.32
575 0.28
576 0.23
577 0.22
578 0.22
579 0.18
580 0.16
581 0.13
582 0.15
583 0.17
584 0.16
585 0.17
586 0.16
587 0.15
588 0.14
589 0.13
590 0.1
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.09
599 0.08
600 0.08
601 0.07
602 0.06
603 0.08
604 0.09
605 0.12
606 0.12
607 0.11
608 0.11
609 0.15
610 0.15
611 0.15
612 0.15
613 0.16
614 0.16
615 0.18
616 0.21
617 0.19
618 0.2
619 0.22
620 0.26
621 0.23
622 0.25
623 0.23
624 0.21
625 0.23
626 0.24
627 0.22
628 0.25
629 0.28
630 0.28
631 0.31
632 0.31
633 0.27
634 0.27
635 0.25
636 0.18
637 0.13
638 0.11
639 0.07
640 0.06
641 0.07
642 0.06
643 0.06
644 0.07
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.14
649 0.17
650 0.16
651 0.19
652 0.2
653 0.25
654 0.28
655 0.3
656 0.28
657 0.24
658 0.24
659 0.21
660 0.23
661 0.21
662 0.19
663 0.17
664 0.16
665 0.16
666 0.19
667 0.19
668 0.18
669 0.16
670 0.16
671 0.21
672 0.24
673 0.24
674 0.25
675 0.28
676 0.32
677 0.34
678 0.35
679 0.34
680 0.34
681 0.36
682 0.37
683 0.36
684 0.31
685 0.3
686 0.28
687 0.23
688 0.2
689 0.16
690 0.11
691 0.08
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.06
696 0.06
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.1
701 0.14
702 0.13
703 0.13
704 0.14
705 0.14
706 0.16
707 0.18
708 0.16
709 0.11
710 0.14
711 0.15
712 0.16
713 0.15
714 0.14
715 0.12
716 0.12
717 0.12
718 0.17
719 0.16
720 0.17
721 0.17
722 0.17
723 0.17
724 0.19
725 0.2
726 0.13
727 0.13
728 0.11
729 0.12
730 0.13
731 0.12
732 0.12
733 0.11
734 0.11
735 0.14
736 0.16
737 0.15
738 0.14
739 0.13
740 0.12
741 0.12
742 0.12
743 0.08
744 0.07
745 0.09
746 0.13
747 0.13
748 0.15
749 0.21
750 0.24
751 0.31
752 0.33
753 0.31
754 0.28
755 0.29
756 0.28
757 0.28
758 0.3
759 0.3
760 0.39
761 0.46
762 0.5
763 0.5
764 0.49
765 0.44
766 0.4
767 0.35
768 0.26
769 0.24
770 0.19
771 0.19
772 0.19
773 0.17
774 0.16
775 0.14
776 0.2
777 0.14
778 0.16
779 0.16
780 0.19
781 0.21
782 0.26
783 0.29
784 0.24
785 0.25
786 0.24
787 0.26
788 0.23
789 0.21
790 0.2
791 0.17
792 0.22
793 0.28
794 0.34
795 0.4
796 0.46
797 0.54
798 0.59
799 0.68
800 0.7
801 0.66
802 0.67
803 0.63
804 0.61
805 0.52
806 0.5
807 0.42
808 0.34
809 0.34
810 0.28
811 0.24
812 0.21
813 0.22
814 0.15
815 0.16
816 0.17
817 0.18
818 0.22
819 0.24
820 0.23
821 0.25
822 0.27
823 0.26
824 0.25
825 0.21
826 0.19
827 0.18
828 0.17
829 0.14
830 0.13
831 0.15
832 0.17
833 0.17
834 0.15
835 0.16
836 0.18
837 0.18
838 0.2
839 0.16
840 0.13
841 0.12
842 0.13
843 0.11
844 0.1
845 0.1
846 0.09
847 0.09
848 0.1
849 0.13
850 0.14
851 0.15
852 0.15
853 0.24
854 0.27
855 0.32
856 0.36
857 0.33
858 0.31
859 0.3
860 0.3
861 0.24
862 0.27
863 0.24
864 0.21
865 0.24
866 0.27
867 0.27
868 0.26
869 0.23
870 0.22
871 0.2
872 0.2
873 0.19
874 0.17
875 0.17
876 0.18
877 0.23
878 0.2
879 0.21
880 0.25
881 0.25
882 0.26
883 0.29
884 0.3
885 0.32
886 0.39
887 0.46
888 0.48
889 0.52
890 0.53
891 0.52
892 0.54
893 0.51
894 0.48
895 0.4
896 0.36
897 0.35
898 0.33
899 0.31
900 0.31
901 0.28
902 0.25
903 0.26
904 0.27
905 0.3
906 0.31
907 0.32
908 0.34
909 0.36
910 0.41
911 0.45
912 0.49
913 0.45
914 0.45
915 0.46
916 0.42
917 0.42
918 0.37
919 0.31
920 0.28
921 0.27
922 0.25
923 0.24
924 0.23
925 0.21
926 0.19
927 0.18
928 0.16
929 0.13
930 0.11
931 0.12
932 0.12
933 0.11
934 0.11
935 0.1
936 0.1
937 0.11
938 0.1
939 0.08
940 0.08
941 0.08
942 0.1
943 0.11
944 0.11
945 0.13
946 0.13
947 0.12
948 0.13
949 0.17
950 0.19
951 0.18
952 0.18
953 0.16
954 0.19
955 0.2
956 0.19
957 0.15
958 0.11
959 0.13
960 0.13
961 0.13
962 0.11
963 0.12
964 0.18
965 0.18
966 0.19
967 0.17
968 0.17
969 0.17
970 0.16
971 0.15
972 0.12
973 0.19
974 0.19
975 0.19
976 0.19
977 0.19
978 0.2
979 0.21
980 0.2
981 0.13
982 0.13
983 0.16
984 0.2
985 0.22
986 0.24
987 0.25
988 0.31
989 0.36
990 0.37
991 0.4
992 0.45
993 0.48
994 0.51
995 0.51
996 0.46
997 0.48
998 0.54
999 0.53
1000 0.45
1001 0.42
1002 0.39
1003 0.37
1004 0.34
1005 0.27
1006 0.22
1007 0.21
1008 0.21
1009 0.17
1010 0.14
1011 0.13
1012 0.13
1013 0.12
1014 0.09
1015 0.04
1016 0.04
1017 0.03
1018 0.03
1019 0.03
1020 0.03
1021 0.03
1022 0.03
1023 0.03
1024 0.03
1025 0.03
1026 0.05
1027 0.07
1028 0.14
1029 0.19
1030 0.22
1031 0.24
1032 0.25
1033 0.26
1034 0.25
1035 0.28
1036 0.3
1037 0.33
1038 0.36
1039 0.37
1040 0.37
1041 0.37
1042 0.36
1043 0.33
1044 0.25
1045 0.21
1046 0.17
1047 0.14
1048 0.14
1049 0.14
1050 0.14
1051 0.13
1052 0.13
1053 0.1
1054 0.12
1055 0.11
1056 0.11
1057 0.11
1058 0.13
1059 0.15
1060 0.16
1061 0.21