Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CU52

Protein Details
Accession A0A0D1CU52    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-308AESALKERTKRHKARSKKERDRTKPRYRPKPSTNRSPTPSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-298KERTKRHKARSKKERDRTKPRYRPKP
364-372KSRSKKRHR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0090575  C:RNA polymerase II transcription regulator complex  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG uma:UMAG_05080  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
CDD cd11388  bHLH_ScINO2_like  
Amino Acid Sequences MSCDDERPANMFDLMAPQLASTSCNEHYFSTADLGASTLYATTTDAPATIAGILTPQPATLAPMYSTCPVRFDDQRSAPASTSVSGKRKHSDVEKDRRRSISNGFAVLQNVLHNESNAKPISKSILLQQACDEIRELRKKLDASTTIISRFGLENLFVPTPSSTHASPPNASSRIYSPINQASDVLADTRRASISTSATPILYSEEKRKANAKRRHSYDGSWQASDRGSIDDEASASASASSSASCSSSSHTHSDDTDCDDTDTDIPAESALKERTKRHKARSKKERDRTKPRYRPKPSTNRSPTPSSCASSTPNSPPTSSNRNRDLQQAILSLLLELPSHLEDVKNKRRASQPTELADPSSVKSRSKKRHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.14
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.14
8 0.11
9 0.15
10 0.17
11 0.19
12 0.21
13 0.21
14 0.23
15 0.23
16 0.22
17 0.2
18 0.18
19 0.16
20 0.14
21 0.14
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.06
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.05
39 0.06
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.15
52 0.18
53 0.21
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.25
58 0.29
59 0.32
60 0.38
61 0.39
62 0.44
63 0.46
64 0.46
65 0.41
66 0.38
67 0.33
68 0.24
69 0.26
70 0.27
71 0.3
72 0.32
73 0.36
74 0.37
75 0.39
76 0.43
77 0.45
78 0.5
79 0.54
80 0.61
81 0.67
82 0.71
83 0.74
84 0.73
85 0.68
86 0.61
87 0.56
88 0.55
89 0.48
90 0.43
91 0.38
92 0.35
93 0.33
94 0.29
95 0.24
96 0.15
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.15
107 0.16
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.26
113 0.26
114 0.26
115 0.26
116 0.27
117 0.25
118 0.25
119 0.21
120 0.15
121 0.22
122 0.27
123 0.28
124 0.25
125 0.29
126 0.29
127 0.3
128 0.34
129 0.29
130 0.28
131 0.3
132 0.3
133 0.26
134 0.26
135 0.24
136 0.18
137 0.16
138 0.12
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.11
143 0.11
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.12
150 0.1
151 0.13
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.22
156 0.25
157 0.24
158 0.24
159 0.22
160 0.19
161 0.22
162 0.23
163 0.22
164 0.2
165 0.23
166 0.23
167 0.22
168 0.21
169 0.16
170 0.15
171 0.13
172 0.11
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.17
192 0.24
193 0.25
194 0.26
195 0.33
196 0.4
197 0.48
198 0.55
199 0.6
200 0.62
201 0.67
202 0.73
203 0.68
204 0.62
205 0.61
206 0.63
207 0.55
208 0.47
209 0.41
210 0.35
211 0.32
212 0.3
213 0.21
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.1
235 0.14
236 0.17
237 0.19
238 0.2
239 0.21
240 0.22
241 0.24
242 0.22
243 0.24
244 0.22
245 0.19
246 0.19
247 0.18
248 0.17
249 0.16
250 0.15
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.11
258 0.13
259 0.18
260 0.23
261 0.31
262 0.41
263 0.52
264 0.6
265 0.67
266 0.73
267 0.79
268 0.86
269 0.89
270 0.9
271 0.9
272 0.92
273 0.92
274 0.93
275 0.94
276 0.93
277 0.94
278 0.93
279 0.92
280 0.93
281 0.92
282 0.92
283 0.91
284 0.92
285 0.88
286 0.89
287 0.88
288 0.85
289 0.81
290 0.79
291 0.7
292 0.66
293 0.63
294 0.54
295 0.46
296 0.4
297 0.39
298 0.35
299 0.38
300 0.38
301 0.4
302 0.39
303 0.39
304 0.39
305 0.42
306 0.48
307 0.51
308 0.53
309 0.53
310 0.57
311 0.57
312 0.6
313 0.57
314 0.5
315 0.45
316 0.38
317 0.32
318 0.27
319 0.25
320 0.19
321 0.15
322 0.12
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.11
330 0.18
331 0.29
332 0.39
333 0.45
334 0.45
335 0.51
336 0.59
337 0.66
338 0.67
339 0.67
340 0.66
341 0.64
342 0.69
343 0.63
344 0.56
345 0.5
346 0.43
347 0.34
348 0.34
349 0.31
350 0.31
351 0.39
352 0.48