Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CMH6

Protein Details
Accession A0A0D1CMH6    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-430ALMLTKREQRKLRRQRRAAEQQDKRDRIKHydrophilic
478-505RQNAERKLTPEQRRDKQQRSKQIDETKGHydrophilic
511-530YKVKHLISPRHKFKLRRNALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-426KREQRKLRRQRRAAEQQDKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 3, cyto 2.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG uma:UMAG_03964  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MPPKRPIRNVFGNDDDDGFGADAPNGTPPKKPRADASRTTMERLGGPPSTTPGPASRNAVGGSGENTIQAQVAAAKARAHALMSAMQNKRSTSSLTAASSSRPASVPVATSWSSSRSAPVGSAAAGPSTSISAAPETSTTTRPSAAVNIQAQLEAARAKVQAQIAALNKKPRLPAETSTSRPSSSLPPTNSNVGAPPTSSLASASKAPTGIHPLLLSNHLPYQPKESTSTSSAVSTSYVKGKSSVASDFNPYLQASRELAAESSSEKPKHRSMHKGFQFHKPGRHVREAEELRREQQMEQVRKRIEESAHNARLKQEGSNETRLLKPAPPEIEWWDSKLVCQPCYDDVPDVGSQTIESMLEAASEGNGAILLFGDKSPIDHYVQHPIPLRAPWDHIAVRPRALMLTKREQRKLRRQRRAAEQQDKRDRIKMGLLPPEPPKVKLSNLMRVLTSEAVSDPTKIEARVRREIAARKDAHERQNAERKLTPEQRRDKQQRSKQIDETKGIYCHVYKVKHLISPRHKFKLRRNALDHALTGVVIFHPTMALIVVEGSGKALKQYKRLMTVRIDWTDPADPTAPESADKQDPDLATATASAPVAFKHLTTSQENVDWSTNTCQLIFEGPIRQRYWSAFRAHAAPTDQAARDALGDAMQGYWDLATRADQSLVDPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.42
3 0.31
4 0.26
5 0.19
6 0.14
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.14
12 0.17
13 0.18
14 0.24
15 0.29
16 0.39
17 0.45
18 0.47
19 0.51
20 0.58
21 0.66
22 0.67
23 0.69
24 0.69
25 0.65
26 0.67
27 0.59
28 0.5
29 0.44
30 0.38
31 0.35
32 0.27
33 0.26
34 0.23
35 0.25
36 0.26
37 0.23
38 0.24
39 0.24
40 0.26
41 0.29
42 0.33
43 0.3
44 0.31
45 0.3
46 0.29
47 0.25
48 0.22
49 0.2
50 0.17
51 0.15
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.09
57 0.08
58 0.07
59 0.09
60 0.1
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.13
68 0.13
69 0.17
70 0.21
71 0.29
72 0.3
73 0.33
74 0.35
75 0.35
76 0.35
77 0.31
78 0.3
79 0.25
80 0.27
81 0.28
82 0.28
83 0.29
84 0.28
85 0.28
86 0.28
87 0.25
88 0.22
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.16
95 0.2
96 0.19
97 0.2
98 0.2
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.2
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.14
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.12
124 0.14
125 0.16
126 0.18
127 0.18
128 0.19
129 0.19
130 0.2
131 0.2
132 0.2
133 0.24
134 0.23
135 0.23
136 0.23
137 0.22
138 0.21
139 0.17
140 0.15
141 0.1
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.19
151 0.22
152 0.27
153 0.3
154 0.33
155 0.33
156 0.35
157 0.37
158 0.35
159 0.35
160 0.35
161 0.36
162 0.38
163 0.44
164 0.45
165 0.47
166 0.46
167 0.41
168 0.37
169 0.34
170 0.32
171 0.32
172 0.36
173 0.34
174 0.38
175 0.4
176 0.43
177 0.41
178 0.35
179 0.29
180 0.24
181 0.2
182 0.16
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.12
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.19
197 0.18
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.19
203 0.18
204 0.13
205 0.15
206 0.18
207 0.19
208 0.19
209 0.25
210 0.24
211 0.25
212 0.28
213 0.27
214 0.28
215 0.28
216 0.29
217 0.23
218 0.22
219 0.2
220 0.16
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.17
233 0.18
234 0.21
235 0.2
236 0.2
237 0.2
238 0.17
239 0.15
240 0.13
241 0.14
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.13
251 0.17
252 0.19
253 0.2
254 0.24
255 0.3
256 0.37
257 0.41
258 0.48
259 0.51
260 0.59
261 0.64
262 0.69
263 0.66
264 0.68
265 0.71
266 0.64
267 0.62
268 0.59
269 0.6
270 0.56
271 0.61
272 0.53
273 0.46
274 0.53
275 0.51
276 0.48
277 0.47
278 0.42
279 0.36
280 0.37
281 0.36
282 0.26
283 0.27
284 0.32
285 0.34
286 0.37
287 0.41
288 0.4
289 0.39
290 0.4
291 0.38
292 0.31
293 0.29
294 0.32
295 0.35
296 0.41
297 0.41
298 0.4
299 0.38
300 0.38
301 0.33
302 0.28
303 0.22
304 0.22
305 0.25
306 0.29
307 0.28
308 0.27
309 0.27
310 0.27
311 0.24
312 0.2
313 0.17
314 0.17
315 0.18
316 0.18
317 0.19
318 0.22
319 0.24
320 0.23
321 0.22
322 0.21
323 0.18
324 0.18
325 0.22
326 0.2
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.19
332 0.19
333 0.14
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.02
356 0.02
357 0.02
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.08
366 0.1
367 0.12
368 0.13
369 0.21
370 0.22
371 0.25
372 0.27
373 0.26
374 0.26
375 0.24
376 0.25
377 0.18
378 0.21
379 0.18
380 0.2
381 0.2
382 0.21
383 0.25
384 0.24
385 0.24
386 0.21
387 0.2
388 0.17
389 0.18
390 0.19
391 0.2
392 0.29
393 0.34
394 0.4
395 0.47
396 0.53
397 0.61
398 0.68
399 0.74
400 0.75
401 0.79
402 0.81
403 0.82
404 0.85
405 0.87
406 0.86
407 0.85
408 0.82
409 0.82
410 0.84
411 0.81
412 0.72
413 0.66
414 0.57
415 0.48
416 0.46
417 0.4
418 0.36
419 0.39
420 0.38
421 0.37
422 0.38
423 0.43
424 0.39
425 0.35
426 0.33
427 0.27
428 0.28
429 0.33
430 0.35
431 0.37
432 0.4
433 0.39
434 0.36
435 0.34
436 0.35
437 0.27
438 0.22
439 0.14
440 0.1
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.1
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.19
449 0.23
450 0.29
451 0.36
452 0.37
453 0.37
454 0.42
455 0.49
456 0.49
457 0.52
458 0.47
459 0.42
460 0.49
461 0.53
462 0.54
463 0.54
464 0.51
465 0.51
466 0.59
467 0.58
468 0.54
469 0.51
470 0.47
471 0.5
472 0.55
473 0.56
474 0.56
475 0.63
476 0.66
477 0.74
478 0.81
479 0.82
480 0.83
481 0.83
482 0.84
483 0.84
484 0.83
485 0.81
486 0.81
487 0.76
488 0.69
489 0.63
490 0.56
491 0.48
492 0.42
493 0.35
494 0.26
495 0.26
496 0.28
497 0.27
498 0.25
499 0.32
500 0.34
501 0.36
502 0.41
503 0.45
504 0.5
505 0.58
506 0.65
507 0.67
508 0.71
509 0.74
510 0.79
511 0.8
512 0.79
513 0.79
514 0.76
515 0.73
516 0.73
517 0.68
518 0.58
519 0.48
520 0.39
521 0.28
522 0.22
523 0.16
524 0.1
525 0.07
526 0.07
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.06
541 0.09
542 0.17
543 0.19
544 0.26
545 0.34
546 0.39
547 0.48
548 0.51
549 0.53
550 0.52
551 0.56
552 0.57
553 0.52
554 0.48
555 0.39
556 0.4
557 0.38
558 0.33
559 0.28
560 0.22
561 0.19
562 0.2
563 0.22
564 0.19
565 0.17
566 0.19
567 0.21
568 0.24
569 0.25
570 0.24
571 0.26
572 0.25
573 0.26
574 0.26
575 0.21
576 0.16
577 0.16
578 0.15
579 0.12
580 0.12
581 0.1
582 0.09
583 0.09
584 0.12
585 0.12
586 0.11
587 0.14
588 0.17
589 0.22
590 0.25
591 0.28
592 0.27
593 0.3
594 0.31
595 0.29
596 0.28
597 0.25
598 0.25
599 0.26
600 0.27
601 0.25
602 0.24
603 0.22
604 0.2
605 0.22
606 0.21
607 0.2
608 0.24
609 0.27
610 0.33
611 0.34
612 0.35
613 0.35
614 0.38
615 0.42
616 0.4
617 0.42
618 0.4
619 0.41
620 0.44
621 0.43
622 0.42
623 0.38
624 0.33
625 0.31
626 0.32
627 0.3
628 0.27
629 0.26
630 0.22
631 0.19
632 0.18
633 0.15
634 0.1
635 0.1
636 0.09
637 0.08
638 0.08
639 0.07
640 0.06
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.1
646 0.13
647 0.14
648 0.15
649 0.15