Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I0RHL4

Protein Details
Accession A0A2I0RHL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-299LVVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-291KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MATDKVIPADLWPHDSPAPRTHHVLSQISGLLKDLGYTKTVASLEKEAVKKGLAKPNTAECSTSLLALYSLDASAVTKLPSSDSDSDADSESSDSEEDSDRDEAEGVLVDVEAEETSDDDSDEASDSSSDSSSDNGVKPGSKRKRVVTPPSSGDSSSDISMDSDSSSSDSDETKAATKVEELKDSGSQTSSTMQGGSPAPKAGLAHEPEMSGMHPDRLKQSHFAPTTRKEGAAGAKKEQIPFSRIPADQKVDPRFSNKYVSYDYADKAYQDLVVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDLAPKGIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.36
4 0.38
5 0.43
6 0.4
7 0.44
8 0.43
9 0.45
10 0.47
11 0.46
12 0.39
13 0.35
14 0.35
15 0.31
16 0.28
17 0.24
18 0.19
19 0.15
20 0.15
21 0.14
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.18
30 0.2
31 0.22
32 0.28
33 0.29
34 0.26
35 0.26
36 0.27
37 0.29
38 0.34
39 0.4
40 0.36
41 0.37
42 0.4
43 0.47
44 0.51
45 0.46
46 0.39
47 0.31
48 0.35
49 0.32
50 0.28
51 0.19
52 0.15
53 0.14
54 0.13
55 0.12
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.11
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.19
72 0.19
73 0.2
74 0.2
75 0.18
76 0.13
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.03
98 0.04
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.12
125 0.14
126 0.24
127 0.31
128 0.37
129 0.4
130 0.43
131 0.52
132 0.59
133 0.66
134 0.61
135 0.58
136 0.54
137 0.53
138 0.5
139 0.4
140 0.33
141 0.25
142 0.21
143 0.16
144 0.12
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.16
166 0.17
167 0.18
168 0.17
169 0.18
170 0.2
171 0.21
172 0.2
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.15
198 0.12
199 0.11
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.19
204 0.22
205 0.24
206 0.24
207 0.27
208 0.32
209 0.35
210 0.37
211 0.38
212 0.4
213 0.44
214 0.43
215 0.4
216 0.31
217 0.32
218 0.37
219 0.39
220 0.38
221 0.34
222 0.39
223 0.41
224 0.42
225 0.43
226 0.38
227 0.33
228 0.32
229 0.34
230 0.35
231 0.34
232 0.37
233 0.39
234 0.41
235 0.4
236 0.47
237 0.48
238 0.46
239 0.47
240 0.47
241 0.46
242 0.44
243 0.47
244 0.41
245 0.4
246 0.39
247 0.41
248 0.4
249 0.38
250 0.37
251 0.32
252 0.31
253 0.26
254 0.23
255 0.2
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.24
264 0.25
265 0.32
266 0.35
267 0.41
268 0.48
269 0.58
270 0.67
271 0.73
272 0.81
273 0.83
274 0.89
275 0.9
276 0.89
277 0.89
278 0.87
279 0.85
280 0.83
281 0.76
282 0.66
283 0.57
284 0.52
285 0.42
286 0.37
287 0.28
288 0.2