Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I0RRN6

Protein Details
Accession A0A2I0RRN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-368KRKNSASGGKRKKDRKKGTSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-366KNEDKRKNSASGGKRKKDRKKG
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 8.5, mito 5, cyto 4.5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
IPR018108  Mitochondrial_sb/sol_carrier  
IPR023395  Mt_carrier_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
PF00153  Mito_carr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50920  SOLCAR  
Amino Acid Sequences MAKRPPTPADERIYHHPGLVGWWVGEMGGKAMDENMIHRYMSESPFFEWSSKNGLLFEQGKADWATYHMCNNRKALEDNLRGRVGLEYMIVQDPQPVADKELAAQGVTTGIYVIRKQDRQRAPSGPRVRPPGVILEDNWELTVLGTYFIVGEQAFQAPSMFDVVENRLLSAASSLNKLIDATSILPRYAPASGYTYLPPSQATKRTGTASIAGSPAGSREGSIAPGTDSQSLRSGSQLPESNVPTSKSLSDHDQTRLLASSLAMSIKYAHDYTDENPLMGEPGNFKFAMTEAAVKKRRAEEEAAAAEARAKKESASNISPRPQVAFPKADKAAAPAAFSTETKLKNEDKRKNSASGGKRKKDRKKGTSSAGPSPTTPGPTSRFSSLPPSQSSSINSLNYREQTFAMSPSLPSPKAGAGQVEKESGVARVLGAGSAGIAELAVFHPVDTIAKRLMSNQGKIVGSTQLNEVIFRKHAAEPFARRFFTLFPGLGYAAAYKVLQRVYKYGGQPFVRDYLSKNHGATFDNAFGKGNGKAIMHATAGSLIGIGEIVLLPLDVLKIKRQTNPEAFRGRGVLRIVADEGFALYRGWGWTAARNAPGSFALFGGSAAAKQYLYKLEDYNKATWLQNFVASIAGSSASLIVSAPLDVVKTRIQNQNFEVKKSGLKIVSDMARHEGPSSFFKGLVPKLLMTGPKLTFSFWLAQTLIPLINNKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.47
3 0.41
4 0.33
5 0.31
6 0.29
7 0.21
8 0.15
9 0.15
10 0.14
11 0.12
12 0.13
13 0.1
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.08
19 0.1
20 0.09
21 0.11
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.17
27 0.2
28 0.24
29 0.26
30 0.24
31 0.24
32 0.29
33 0.3
34 0.29
35 0.25
36 0.24
37 0.28
38 0.28
39 0.27
40 0.24
41 0.23
42 0.28
43 0.28
44 0.27
45 0.23
46 0.22
47 0.23
48 0.23
49 0.23
50 0.16
51 0.16
52 0.19
53 0.17
54 0.25
55 0.29
56 0.34
57 0.38
58 0.41
59 0.43
60 0.43
61 0.44
62 0.44
63 0.48
64 0.52
65 0.54
66 0.56
67 0.52
68 0.48
69 0.46
70 0.39
71 0.29
72 0.21
73 0.15
74 0.1
75 0.12
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.17
83 0.15
84 0.16
85 0.18
86 0.18
87 0.16
88 0.2
89 0.19
90 0.15
91 0.14
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.05
97 0.06
98 0.08
99 0.09
100 0.16
101 0.22
102 0.28
103 0.33
104 0.43
105 0.51
106 0.55
107 0.61
108 0.64
109 0.63
110 0.67
111 0.72
112 0.69
113 0.67
114 0.7
115 0.65
116 0.57
117 0.53
118 0.5
119 0.45
120 0.39
121 0.33
122 0.31
123 0.3
124 0.28
125 0.26
126 0.18
127 0.14
128 0.12
129 0.13
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.09
150 0.11
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.1
178 0.13
179 0.14
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.22
188 0.27
189 0.29
190 0.29
191 0.31
192 0.33
193 0.34
194 0.31
195 0.29
196 0.24
197 0.22
198 0.2
199 0.17
200 0.14
201 0.12
202 0.12
203 0.1
204 0.08
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.18
218 0.19
219 0.18
220 0.18
221 0.2
222 0.16
223 0.21
224 0.24
225 0.22
226 0.26
227 0.27
228 0.28
229 0.27
230 0.27
231 0.23
232 0.21
233 0.21
234 0.18
235 0.18
236 0.21
237 0.22
238 0.24
239 0.25
240 0.27
241 0.25
242 0.25
243 0.24
244 0.19
245 0.15
246 0.12
247 0.1
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.21
261 0.2
262 0.18
263 0.18
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.15
268 0.08
269 0.09
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.1
277 0.14
278 0.15
279 0.24
280 0.29
281 0.29
282 0.32
283 0.33
284 0.35
285 0.32
286 0.33
287 0.27
288 0.28
289 0.28
290 0.26
291 0.22
292 0.2
293 0.2
294 0.18
295 0.17
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.14
300 0.17
301 0.2
302 0.23
303 0.27
304 0.3
305 0.34
306 0.35
307 0.32
308 0.31
309 0.28
310 0.27
311 0.26
312 0.28
313 0.25
314 0.29
315 0.29
316 0.27
317 0.25
318 0.24
319 0.24
320 0.19
321 0.18
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.18
331 0.22
332 0.3
333 0.4
334 0.47
335 0.47
336 0.54
337 0.56
338 0.55
339 0.54
340 0.54
341 0.53
342 0.54
343 0.59
344 0.58
345 0.63
346 0.7
347 0.76
348 0.78
349 0.8
350 0.79
351 0.79
352 0.79
353 0.78
354 0.76
355 0.71
356 0.67
357 0.6
358 0.51
359 0.41
360 0.38
361 0.32
362 0.26
363 0.22
364 0.18
365 0.18
366 0.21
367 0.23
368 0.22
369 0.22
370 0.2
371 0.28
372 0.28
373 0.28
374 0.27
375 0.28
376 0.27
377 0.28
378 0.29
379 0.25
380 0.25
381 0.24
382 0.23
383 0.21
384 0.23
385 0.23
386 0.22
387 0.19
388 0.16
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.14
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.16
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.13
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.15
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.13
410 0.13
411 0.11
412 0.1
413 0.07
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.02
424 0.02
425 0.02
426 0.02
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.06
434 0.06
435 0.08
436 0.08
437 0.1
438 0.1
439 0.12
440 0.21
441 0.24
442 0.25
443 0.25
444 0.29
445 0.28
446 0.28
447 0.28
448 0.23
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.16
453 0.16
454 0.16
455 0.16
456 0.14
457 0.14
458 0.14
459 0.16
460 0.15
461 0.18
462 0.2
463 0.25
464 0.3
465 0.38
466 0.42
467 0.4
468 0.37
469 0.36
470 0.34
471 0.32
472 0.29
473 0.21
474 0.16
475 0.17
476 0.17
477 0.16
478 0.15
479 0.11
480 0.07
481 0.08
482 0.07
483 0.06
484 0.09
485 0.11
486 0.13
487 0.14
488 0.16
489 0.2
490 0.26
491 0.29
492 0.31
493 0.35
494 0.35
495 0.35
496 0.34
497 0.33
498 0.28
499 0.26
500 0.24
501 0.25
502 0.28
503 0.3
504 0.29
505 0.28
506 0.29
507 0.3
508 0.3
509 0.25
510 0.26
511 0.24
512 0.24
513 0.22
514 0.2
515 0.2
516 0.19
517 0.17
518 0.14
519 0.13
520 0.14
521 0.15
522 0.16
523 0.14
524 0.13
525 0.12
526 0.1
527 0.1
528 0.08
529 0.07
530 0.05
531 0.04
532 0.04
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.02
540 0.03
541 0.04
542 0.06
543 0.07
544 0.12
545 0.19
546 0.22
547 0.28
548 0.34
549 0.42
550 0.5
551 0.56
552 0.59
553 0.59
554 0.56
555 0.52
556 0.51
557 0.43
558 0.37
559 0.32
560 0.27
561 0.21
562 0.22
563 0.21
564 0.18
565 0.17
566 0.12
567 0.11
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.06
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.09
576 0.1
577 0.15
578 0.19
579 0.22
580 0.24
581 0.25
582 0.25
583 0.25
584 0.25
585 0.21
586 0.17
587 0.14
588 0.12
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.09
593 0.07
594 0.08
595 0.09
596 0.08
597 0.08
598 0.11
599 0.14
600 0.17
601 0.19
602 0.22
603 0.27
604 0.35
605 0.39
606 0.39
607 0.37
608 0.37
609 0.37
610 0.35
611 0.35
612 0.28
613 0.26
614 0.24
615 0.22
616 0.21
617 0.18
618 0.16
619 0.11
620 0.1
621 0.08
622 0.07
623 0.07
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.06
631 0.06
632 0.07
633 0.07
634 0.1
635 0.14
636 0.18
637 0.25
638 0.33
639 0.36
640 0.41
641 0.45
642 0.53
643 0.51
644 0.5
645 0.48
646 0.42
647 0.43
648 0.4
649 0.43
650 0.36
651 0.34
652 0.33
653 0.35
654 0.38
655 0.35
656 0.34
657 0.32
658 0.31
659 0.3
660 0.3
661 0.26
662 0.24
663 0.27
664 0.3
665 0.26
666 0.25
667 0.26
668 0.32
669 0.31
670 0.35
671 0.32
672 0.27
673 0.28
674 0.32
675 0.32
676 0.28
677 0.33
678 0.28
679 0.3
680 0.3
681 0.29
682 0.27
683 0.28
684 0.31
685 0.24
686 0.27
687 0.24
688 0.24
689 0.24
690 0.24
691 0.23
692 0.18