Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I0S3Q4

Protein Details
Accession A0A2I0S3Q4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28ERQMKRESASPPPKKPREPTPDLTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MRQLERQMKRESASPPPKKPREPTPDLTDVVNVLERKRRLTQWDIKPPGYDNVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQPMDPAKLQAFMNQPGNQASSSALKPSTARQSKRVLLYNLPASATDESIVDFFNLQLNGLNVTRGVDPCISAQTAKDHSYSLVEFKTPEDATNAMALDGIVMDPNAMDTNGDANGASKGLEIKRPKDYIVPNVTDDTQHEAGLLSNIVPDTQNKISITNLPAFLGEEQIQELLMSFGELKNFILVKDQSSGESRGIAFCEYKDSSVTKTAVEALNGMELGDVAMRVKLASIGIQQVSSEMSVNAMSMMAGAKSNDSDNGRVLALMNMITPEELMDPDDADEILEDVKEECAKYGPLAEVKMPRPTGGSRQSNGVGKIYLKYETSEHAAKALAALAGRKFADRTVVVTYFGEEYFDVNAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.66
3 0.72
4 0.79
5 0.82
6 0.84
7 0.84
8 0.83
9 0.82
10 0.79
11 0.76
12 0.73
13 0.66
14 0.6
15 0.5
16 0.4
17 0.33
18 0.3
19 0.23
20 0.2
21 0.27
22 0.27
23 0.31
24 0.37
25 0.41
26 0.43
27 0.52
28 0.59
29 0.62
30 0.72
31 0.73
32 0.69
33 0.66
34 0.61
35 0.57
36 0.5
37 0.41
38 0.33
39 0.3
40 0.34
41 0.31
42 0.29
43 0.23
44 0.2
45 0.18
46 0.17
47 0.13
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.15
53 0.17
54 0.19
55 0.23
56 0.22
57 0.26
58 0.29
59 0.3
60 0.34
61 0.37
62 0.41
63 0.38
64 0.4
65 0.37
66 0.38
67 0.36
68 0.33
69 0.33
70 0.3
71 0.35
72 0.33
73 0.33
74 0.31
75 0.32
76 0.27
77 0.23
78 0.2
79 0.17
80 0.16
81 0.17
82 0.16
83 0.15
84 0.17
85 0.21
86 0.3
87 0.35
88 0.38
89 0.41
90 0.48
91 0.53
92 0.58
93 0.59
94 0.52
95 0.47
96 0.5
97 0.48
98 0.41
99 0.36
100 0.3
101 0.26
102 0.23
103 0.19
104 0.14
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.14
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.17
137 0.17
138 0.19
139 0.18
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.13
145 0.17
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.14
151 0.15
152 0.14
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.02
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.08
178 0.09
179 0.15
180 0.17
181 0.2
182 0.26
183 0.27
184 0.28
185 0.31
186 0.32
187 0.35
188 0.37
189 0.36
190 0.31
191 0.32
192 0.31
193 0.25
194 0.23
195 0.21
196 0.16
197 0.14
198 0.13
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.09
210 0.1
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.17
216 0.19
217 0.16
218 0.16
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.17
249 0.19
250 0.15
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.11
257 0.09
258 0.14
259 0.13
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.2
265 0.21
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.15
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.12
314 0.13
315 0.15
316 0.15
317 0.17
318 0.16
319 0.15
320 0.15
321 0.12
322 0.11
323 0.1
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.07
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.15
353 0.16
354 0.18
355 0.19
356 0.23
357 0.28
358 0.31
359 0.37
360 0.35
361 0.32
362 0.33
363 0.34
364 0.39
365 0.42
366 0.46
367 0.41
368 0.45
369 0.49
370 0.51
371 0.49
372 0.43
373 0.35
374 0.29
375 0.3
376 0.27
377 0.25
378 0.21
379 0.21
380 0.21
381 0.22
382 0.26
383 0.27
384 0.25
385 0.24
386 0.23
387 0.21
388 0.2
389 0.18
390 0.14
391 0.11
392 0.14
393 0.13
394 0.17
395 0.17
396 0.18
397 0.17
398 0.17
399 0.23
400 0.2
401 0.23
402 0.26
403 0.26
404 0.27
405 0.27
406 0.28
407 0.23
408 0.22
409 0.2
410 0.14
411 0.14