FuNGI

A0A2I0S216

Protein Details

Accession

A0A2I0S216

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-56	VNIFNNSSKKKPVRKPAPTAPKAA	Hydrophilic
200-223	GGDSNKPQKKKPQKKVEEGRDESN	Basic
409-438	EQLARLAEKKKQKKLRKQLRKREHQGQYTD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
41-50	KKKPVRKPAP
205-214	KPQKKKPQKK
415-430	AEKKKQKKLRKQLRKR

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSNSPAQPPSGPNSVTPNTGGPAASIVRKRPAVNIFNNSSKKKPVRKPAPTAPKAAAATTTTQARNGPPSSSYHQPMNGIVRTGQPTAAANDEPDPSTYAEYPITVTKSQLTQGLRHHAMKLQSKLGANGQPIEVNPYDESQFPRPARLHRRFARDKMESFEQSEVGSGVDDKEREMMSIRRAERQAEREENQKLIAPTGGDSNKPQKKKPQKKVEEGRDESNPVRQKRAQLRYEEARPWHLEDYEGKNVWVGTYEKALSERSIMLVVSNDGTFEMVPVEKWYRFQQANKVNAMDSEQVEKFMTAKHVPSRWALGTQAAAEQLKKQTLEKRVAAIRAAGGEFDADRDMLDMDYKDEFQDDDEGMLFQADDGEDAGEIERRIYLEMRDAGLGGTGVKNEDMDVEAQQHREQLARLAEKKKQKKLRKQLRKREHQGQYTDDSDSDPYASSSDSMDTEEEAEEEKRKADEAKKAAMNGDKSGASTKGTNTPTGRPEKRDPTRLGANLKRPGSPDNSDLSGNESSRKKVKSINGRAVSAAPSAARTSSADRSKVKAHRAGGSGSGSDTDTSRTGRVKLKLKNSPPGSPSAATPNGSRAGSPTASGTATPNGGVPFPTLEEVRASIPTTGIAMKALVAKFKSRVGTRTADFIQLVKKAGQLSKDPTKAGLIELKPGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.37
3	0.35
4	0.31
5	0.26
6	0.27
7	0.24
8	0.16
9	0.18
10	0.18
11	0.22
12	0.25
13	0.27
14	0.33
15	0.37
16	0.38
17	0.42
18	0.49
19	0.51
20	0.55
21	0.59
22	0.59
23	0.64
24	0.71
25	0.68
26	0.63
27	0.64
28	0.65
29	0.68
30	0.71
31	0.73
32	0.77
33	0.82
34	0.88
35	0.89
36	0.9
37	0.84
38	0.8
39	0.71
40	0.67
41	0.58
42	0.49
43	0.4
44	0.31
45	0.3
46	0.28
47	0.32
48	0.25
49	0.25
50	0.27
51	0.28
52	0.33
53	0.31
54	0.3
55	0.25
56	0.31
57	0.34
58	0.39
59	0.4
60	0.37
61	0.38
62	0.37
63	0.4
64	0.41
65	0.37
66	0.32
67	0.29
68	0.3
69	0.31
70	0.3
71	0.26
72	0.2
73	0.2
74	0.21
75	0.23
76	0.18
77	0.16
78	0.17
79	0.19
80	0.18
81	0.18
82	0.17
83	0.15
84	0.18
85	0.17
86	0.17
87	0.16
88	0.15
89	0.16
90	0.18
91	0.2
92	0.18
93	0.18
94	0.19
95	0.2
96	0.21
97	0.25
98	0.24
99	0.25
100	0.3
101	0.38
102	0.4
103	0.4
104	0.41
105	0.39
106	0.44
107	0.47
108	0.45
109	0.4
110	0.4
111	0.39
112	0.4
113	0.41
114	0.38
115	0.32
116	0.29
117	0.26
118	0.23
119	0.22
120	0.25
121	0.2
122	0.18
123	0.17
124	0.17
125	0.18
126	0.18
127	0.23
128	0.22
129	0.3
130	0.28
131	0.34
132	0.35
133	0.44
134	0.53
135	0.57
136	0.63
137	0.62
138	0.72
139	0.73
140	0.77
141	0.77
142	0.72
143	0.66
144	0.62
145	0.62
146	0.54
147	0.48
148	0.43
149	0.33
150	0.27
151	0.25
152	0.19
153	0.12
154	0.1
155	0.07
156	0.07
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.12
161	0.11
162	0.12
163	0.15
164	0.16
165	0.19
166	0.27
167	0.28
168	0.32
169	0.33
170	0.37
171	0.41
172	0.43
173	0.46
174	0.45
175	0.46
176	0.46
177	0.47
178	0.44
179	0.39
180	0.36
181	0.29
182	0.22
183	0.21
184	0.15
185	0.13
186	0.18
187	0.18
188	0.16
189	0.19
190	0.28
191	0.34
192	0.37
193	0.41
194	0.46
195	0.56
196	0.66
197	0.74
198	0.75
199	0.78
200	0.85
201	0.92
202	0.91
203	0.9
204	0.83
205	0.76
206	0.68
207	0.62
208	0.52
209	0.48
210	0.45
211	0.36
212	0.38
213	0.37
214	0.43
215	0.49
216	0.58
217	0.56
218	0.54
219	0.59
220	0.59
221	0.62
222	0.58
223	0.5
224	0.44
225	0.41
226	0.38
227	0.33
228	0.27
229	0.23
230	0.23
231	0.28
232	0.29
233	0.28
234	0.25
235	0.24
236	0.23
237	0.22
238	0.19
239	0.14
240	0.09
241	0.11
242	0.12
243	0.11
244	0.13
245	0.14
246	0.11
247	0.12
248	0.11
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.05
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.05
265	0.07
266	0.1
267	0.1
268	0.12
269	0.15
270	0.2
271	0.23
272	0.26
273	0.33
274	0.38
275	0.43
276	0.42
277	0.4
278	0.34
279	0.31
280	0.31
281	0.24
282	0.17
283	0.16
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.11
290	0.13
291	0.11
292	0.13
293	0.17
294	0.18
295	0.2
296	0.21
297	0.23
298	0.2
299	0.2
300	0.18
301	0.15
302	0.13
303	0.12
304	0.11
305	0.09
306	0.09
307	0.08
308	0.1
309	0.1
310	0.11
311	0.11
312	0.13
313	0.18
314	0.24
315	0.29
316	0.28
317	0.31
318	0.32
319	0.32
320	0.3
321	0.24
322	0.19
323	0.14
324	0.13
325	0.09
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.03
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.06
379	0.05
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.04
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.1
390	0.11
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.13
397	0.14
398	0.17
399	0.22
400	0.27
401	0.3
402	0.36
403	0.45
404	0.53
405	0.59
406	0.64
407	0.69
408	0.74
409	0.81
410	0.87
411	0.89
412	0.91
413	0.93
414	0.93
415	0.94
416	0.91
417	0.91
418	0.88
419	0.83
420	0.76
421	0.69
422	0.62
423	0.53
424	0.46
425	0.35
426	0.27
427	0.21
428	0.17
429	0.14
430	0.1
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.11
450	0.12
451	0.17
452	0.22
453	0.29
454	0.31
455	0.37
456	0.38
457	0.39
458	0.41
459	0.4
460	0.36
461	0.29
462	0.27
463	0.21
464	0.19
465	0.21
466	0.18
467	0.15
468	0.15
469	0.15
470	0.21
471	0.22
472	0.27
473	0.27
474	0.31
475	0.37
476	0.45
477	0.47
478	0.46
479	0.52
480	0.58
481	0.63
482	0.67
483	0.64
484	0.61
485	0.64
486	0.63
487	0.64
488	0.6
489	0.61
490	0.6
491	0.58
492	0.53
493	0.47
494	0.46
495	0.43
496	0.4
497	0.35
498	0.31
499	0.31
500	0.29
501	0.28
502	0.28
503	0.25
504	0.22
505	0.26
506	0.24
507	0.26
508	0.32
509	0.34
510	0.32
511	0.36
512	0.44
513	0.49
514	0.57
515	0.64
516	0.62
517	0.61
518	0.59
519	0.54
520	0.47
521	0.36
522	0.26
523	0.16
524	0.13
525	0.13
526	0.12
527	0.11
528	0.11
529	0.16
530	0.23
531	0.28
532	0.33
533	0.35
534	0.38
535	0.46
536	0.51
537	0.54
538	0.52
539	0.51
540	0.51
541	0.51
542	0.49
543	0.44
544	0.39
545	0.32
546	0.26
547	0.23
548	0.17
549	0.15
550	0.14
551	0.13
552	0.13
553	0.14
554	0.17
555	0.19
556	0.23
557	0.3
558	0.37
559	0.43
560	0.49
561	0.58
562	0.64
563	0.69
564	0.74
565	0.72
566	0.71
567	0.64
568	0.62
569	0.57
570	0.48
571	0.43
572	0.4
573	0.39
574	0.34
575	0.32
576	0.31
577	0.3
578	0.29
579	0.27
580	0.22
581	0.24
582	0.22
583	0.22
584	0.2
585	0.18
586	0.18
587	0.19
588	0.19
589	0.16
590	0.16
591	0.16
592	0.16
593	0.14
594	0.14
595	0.14
596	0.13
597	0.12
598	0.13
599	0.15
600	0.14
601	0.14
602	0.15
603	0.16
604	0.16
605	0.17
606	0.17
607	0.15
608	0.15
609	0.14
610	0.14
611	0.13
612	0.12
613	0.11
614	0.09
615	0.1
616	0.16
617	0.16
618	0.19
619	0.2
620	0.24
621	0.26
622	0.3
623	0.36
624	0.35
625	0.37
626	0.39
627	0.44
628	0.42
629	0.46
630	0.44
631	0.4
632	0.37
633	0.36
634	0.36
635	0.31
636	0.32
637	0.26
638	0.27
639	0.28
640	0.31
641	0.33
642	0.34
643	0.39
644	0.47
645	0.5
646	0.48
647	0.44
648	0.44
649	0.41
650	0.38
651	0.39
652	0.3

A0A2I0S216

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer