Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MDQ3

Protein Details
Accession B8MDQ3    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-146EEVSPVKKRRGRPRESESNRKQTHBasic
167-188EESSKPTKPRGRQRKSVTEEPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-46KKARGRPK
129-136KKRRGRPR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
Amino Acid Sequences MPKRKAATQISGLVDSDDDTGDIIAVASHSESPDERPVKKARGRPKSTGVKVEEQTAASKSTRSSSAAPVKQNVPAKKVSNRGRPRAATAEPETTGQDSDDGLDFHDVAKEASAYEEEIAAQEEVSPVKKRRGRPRESESNRKQTHVTEDGEFEYTPTASRQFKPTEESSKPTKPRGRQRKSVTEEPVIPDSQNPADEIESSDKRSSIGSPLKSLTNGERPGRKRATVTFADTVEKASSDPDLRRKLGDMTKKYETLELKYRNLREIGIVEANANFEKIRKQCESATNVSNKLVESLKEELAAQKVLGKESRTLQKQLRQRDIEVNTLQSQVGDLSTQLSTAQTEIKALQTKLAAARNSSVPNDSLNNKGPGSAVKSVANRNAAAGVAAEAAQAAHLAQLKEDLYSDLTGLIIRNVKKRDADYLYDCIQTGANGTLHFKLAVAHDGNGNMASNFDTTEFHYMPLLDSNRDADLVEILPDYLTVDITFSRQNASKFYTRVMDSLTKRRIDPDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.25
3 0.2
4 0.13
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.06
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.1
19 0.15
20 0.24
21 0.3
22 0.3
23 0.37
24 0.44
25 0.52
26 0.58
27 0.63
28 0.64
29 0.69
30 0.75
31 0.76
32 0.79
33 0.8
34 0.79
35 0.79
36 0.74
37 0.71
38 0.65
39 0.62
40 0.54
41 0.45
42 0.41
43 0.33
44 0.31
45 0.23
46 0.23
47 0.2
48 0.21
49 0.22
50 0.23
51 0.25
52 0.31
53 0.4
54 0.45
55 0.48
56 0.49
57 0.48
58 0.52
59 0.56
60 0.51
61 0.45
62 0.46
63 0.48
64 0.5
65 0.58
66 0.61
67 0.64
68 0.69
69 0.74
70 0.76
71 0.72
72 0.71
73 0.68
74 0.61
75 0.57
76 0.52
77 0.48
78 0.4
79 0.39
80 0.34
81 0.28
82 0.26
83 0.19
84 0.15
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.11
113 0.16
114 0.18
115 0.27
116 0.33
117 0.41
118 0.52
119 0.61
120 0.67
121 0.71
122 0.78
123 0.8
124 0.83
125 0.86
126 0.84
127 0.84
128 0.77
129 0.69
130 0.62
131 0.53
132 0.53
133 0.47
134 0.4
135 0.31
136 0.31
137 0.3
138 0.3
139 0.27
140 0.19
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.13
146 0.15
147 0.17
148 0.23
149 0.25
150 0.27
151 0.32
152 0.36
153 0.4
154 0.39
155 0.42
156 0.43
157 0.49
158 0.51
159 0.55
160 0.57
161 0.58
162 0.66
163 0.73
164 0.74
165 0.75
166 0.79
167 0.81
168 0.81
169 0.8
170 0.75
171 0.67
172 0.62
173 0.55
174 0.49
175 0.39
176 0.31
177 0.23
178 0.21
179 0.17
180 0.15
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.15
187 0.16
188 0.18
189 0.18
190 0.17
191 0.17
192 0.18
193 0.16
194 0.19
195 0.24
196 0.22
197 0.24
198 0.25
199 0.26
200 0.25
201 0.26
202 0.22
203 0.23
204 0.26
205 0.27
206 0.34
207 0.35
208 0.44
209 0.45
210 0.43
211 0.38
212 0.37
213 0.4
214 0.35
215 0.37
216 0.31
217 0.29
218 0.29
219 0.26
220 0.24
221 0.17
222 0.15
223 0.1
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.12
228 0.18
229 0.23
230 0.23
231 0.23
232 0.24
233 0.28
234 0.32
235 0.37
236 0.34
237 0.36
238 0.38
239 0.39
240 0.38
241 0.37
242 0.32
243 0.28
244 0.32
245 0.3
246 0.32
247 0.35
248 0.36
249 0.34
250 0.33
251 0.29
252 0.22
253 0.19
254 0.17
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.06
263 0.06
264 0.12
265 0.13
266 0.18
267 0.19
268 0.22
269 0.26
270 0.32
271 0.37
272 0.35
273 0.39
274 0.37
275 0.36
276 0.34
277 0.31
278 0.24
279 0.21
280 0.18
281 0.13
282 0.13
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.15
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.19
298 0.27
299 0.28
300 0.32
301 0.35
302 0.4
303 0.46
304 0.52
305 0.56
306 0.51
307 0.51
308 0.54
309 0.52
310 0.51
311 0.45
312 0.39
313 0.32
314 0.3
315 0.27
316 0.18
317 0.16
318 0.1
319 0.09
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.09
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.13
334 0.17
335 0.17
336 0.18
337 0.17
338 0.18
339 0.22
340 0.26
341 0.23
342 0.2
343 0.22
344 0.24
345 0.26
346 0.25
347 0.22
348 0.17
349 0.19
350 0.21
351 0.21
352 0.22
353 0.24
354 0.26
355 0.24
356 0.24
357 0.23
358 0.22
359 0.25
360 0.23
361 0.22
362 0.23
363 0.27
364 0.3
365 0.34
366 0.34
367 0.28
368 0.26
369 0.24
370 0.2
371 0.16
372 0.13
373 0.09
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.03
382 0.05
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.08
398 0.1
399 0.14
400 0.17
401 0.24
402 0.26
403 0.3
404 0.33
405 0.35
406 0.41
407 0.41
408 0.44
409 0.42
410 0.44
411 0.43
412 0.4
413 0.38
414 0.3
415 0.25
416 0.19
417 0.16
418 0.14
419 0.12
420 0.12
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.16
425 0.14
426 0.13
427 0.13
428 0.19
429 0.18
430 0.18
431 0.18
432 0.19
433 0.19
434 0.18
435 0.17
436 0.11
437 0.09
438 0.1
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.18
445 0.18
446 0.18
447 0.19
448 0.18
449 0.19
450 0.25
451 0.25
452 0.19
453 0.2
454 0.22
455 0.21
456 0.21
457 0.2
458 0.14
459 0.13
460 0.12
461 0.12
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.07
471 0.08
472 0.1
473 0.13
474 0.12
475 0.17
476 0.2
477 0.22
478 0.26
479 0.32
480 0.37
481 0.36
482 0.39
483 0.41
484 0.39
485 0.39
486 0.4
487 0.42
488 0.42
489 0.51
490 0.54
491 0.51
492 0.5