Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I2FDK6

Protein Details
Accession A0A2I2FDK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-276KSSNIKGQSPRTPRKRRRRIPQPTRQASTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-267SPRTPRKRRRRIP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRSHQSHTRPSSPQEQQGTRVLSSLHASVSPPRKRSTPAKHPHLAAIEAGQVQVTDHPAIISSRLTQCIRSFLPGSPRLDVAAWLDLYRRNLHPKGRHFVVHQHDHPIAGVHYDLRLQFSETSSVSWSIMYGLPGDPNTRRLNRNATETRVHCLWNHLIETASARTGSMLIWDTGEYEILPYKMDLVGPETDDSGTDDSSVPASSPVDDRGESEKLFQAFQDRKIRLRLHGTRLPLNYTVTLRLDKSSNIKGQSPRTPRKRRRRIPQPTRQASTPPPESSSLDSNTEGTQKLPDHSDDENDEVDTKIRAENAYPGSVNTIGSIHQRRWFLTLDRTNSGFKDEPGSGPAGKRWTRQLDANHQQMLGFEPFYVRGPEVERSIVTGRLGKEILEDEGVQGFLPRRGWRPILE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.69
3 0.63
4 0.59
5 0.61
6 0.59
7 0.49
8 0.44
9 0.36
10 0.28
11 0.28
12 0.24
13 0.18
14 0.15
15 0.16
16 0.23
17 0.33
18 0.38
19 0.4
20 0.42
21 0.45
22 0.51
23 0.6
24 0.63
25 0.64
26 0.67
27 0.72
28 0.75
29 0.73
30 0.72
31 0.65
32 0.55
33 0.45
34 0.35
35 0.29
36 0.23
37 0.21
38 0.15
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.12
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.14
51 0.17
52 0.22
53 0.23
54 0.26
55 0.27
56 0.31
57 0.31
58 0.31
59 0.3
60 0.28
61 0.37
62 0.39
63 0.41
64 0.36
65 0.36
66 0.32
67 0.3
68 0.28
69 0.21
70 0.18
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.19
76 0.22
77 0.23
78 0.28
79 0.33
80 0.42
81 0.49
82 0.54
83 0.59
84 0.59
85 0.59
86 0.53
87 0.57
88 0.57
89 0.57
90 0.5
91 0.48
92 0.45
93 0.41
94 0.39
95 0.31
96 0.23
97 0.15
98 0.13
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.17
109 0.15
110 0.16
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.13
124 0.12
125 0.17
126 0.22
127 0.26
128 0.28
129 0.31
130 0.4
131 0.4
132 0.48
133 0.47
134 0.46
135 0.48
136 0.46
137 0.46
138 0.39
139 0.37
140 0.28
141 0.28
142 0.27
143 0.22
144 0.22
145 0.18
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.14
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.08
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.14
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.18
207 0.19
208 0.26
209 0.33
210 0.32
211 0.34
212 0.4
213 0.42
214 0.38
215 0.45
216 0.45
217 0.43
218 0.46
219 0.47
220 0.45
221 0.45
222 0.44
223 0.35
224 0.3
225 0.25
226 0.21
227 0.21
228 0.17
229 0.18
230 0.15
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.19
235 0.23
236 0.25
237 0.26
238 0.3
239 0.34
240 0.39
241 0.46
242 0.51
243 0.55
244 0.62
245 0.71
246 0.77
247 0.84
248 0.89
249 0.9
250 0.91
251 0.92
252 0.93
253 0.93
254 0.93
255 0.93
256 0.89
257 0.84
258 0.74
259 0.67
260 0.61
261 0.57
262 0.52
263 0.42
264 0.36
265 0.35
266 0.35
267 0.33
268 0.32
269 0.27
270 0.24
271 0.23
272 0.22
273 0.21
274 0.21
275 0.18
276 0.15
277 0.16
278 0.15
279 0.16
280 0.18
281 0.18
282 0.2
283 0.2
284 0.23
285 0.21
286 0.22
287 0.21
288 0.19
289 0.18
290 0.14
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.17
299 0.19
300 0.21
301 0.2
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.2
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.18
310 0.22
311 0.22
312 0.26
313 0.28
314 0.29
315 0.31
316 0.34
317 0.3
318 0.37
319 0.41
320 0.41
321 0.43
322 0.44
323 0.43
324 0.4
325 0.42
326 0.34
327 0.27
328 0.27
329 0.24
330 0.23
331 0.24
332 0.26
333 0.22
334 0.22
335 0.25
336 0.29
337 0.31
338 0.33
339 0.39
340 0.43
341 0.45
342 0.5
343 0.55
344 0.57
345 0.63
346 0.66
347 0.59
348 0.52
349 0.49
350 0.42
351 0.38
352 0.29
353 0.21
354 0.14
355 0.14
356 0.15
357 0.16
358 0.18
359 0.14
360 0.14
361 0.18
362 0.21
363 0.23
364 0.24
365 0.22
366 0.24
367 0.26
368 0.26
369 0.24
370 0.25
371 0.24
372 0.26
373 0.26
374 0.22
375 0.23
376 0.22
377 0.22
378 0.19
379 0.18
380 0.15
381 0.16
382 0.16
383 0.13
384 0.14
385 0.15
386 0.16
387 0.2
388 0.23
389 0.27
390 0.34