Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MJ76

Protein Details
Accession B8MJ76    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-47RELTIPKRGTKPKELAKKWRELLHydrophilic
196-223EKDKTHPKAKKLRWVKKRIERKMKDDTSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-43LAPKENREKALLIKRERELTIPKRGTKPKELAKKW
199-218KTHPKAKKLRWVKKRIERKM
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF13976  gag_pre-integrs  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MIKLLKEKLAPKENREKALLIKRERELTIPKRGTKPKELAKKWRELLMDMNLANFKALTSEQLARDFIDSTEGVLPKFHELWSTTLLQYDLNSKMSTLSEPPTIEGILNEFDSWTDAYAKKELNPKPDITMATFSNKSDQPEKNNERSATPKSNRKITCLDGEEHGFENCPYVNPEKRTSEWKPDPNIQKKFDVLEKDKTHPKAKKLRWVKKRIERKMKDDTSTDSNKNSDQQEQSNLVYDSDEFCGTVLDTVLSASGNKRDMKDEWILDSGSERKDEDLCNIKWHGRLILLEWKNNKTPKSSLQYELAMSSFEKVTLKDPALAWHKRFGHISQKAVQKLEEATEGAVVTTSEILNRNPDGFQEKCEVCEMSKARRKISRVSMTKPTKPFQVLFVDIIVMNLAMNGHTYALHAVDPYTKFHVITTTKTKSVNFTLETMIEEIEHTFKAHIDEVHLDGESSLNGISFTKYCRENKKRLLVTVPGTPERNNYRFKLIRFAANYKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.67
3 0.6
4 0.59
5 0.63
6 0.64
7 0.6
8 0.6
9 0.59
10 0.62
11 0.6
12 0.57
13 0.57
14 0.54
15 0.58
16 0.58
17 0.61
18 0.65
19 0.73
20 0.75
21 0.74
22 0.76
23 0.75
24 0.79
25 0.81
26 0.82
27 0.82
28 0.84
29 0.78
30 0.75
31 0.67
32 0.58
33 0.55
34 0.5
35 0.48
36 0.38
37 0.37
38 0.31
39 0.29
40 0.27
41 0.2
42 0.14
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.14
47 0.19
48 0.21
49 0.24
50 0.25
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.18
55 0.17
56 0.15
57 0.14
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.18
62 0.19
63 0.19
64 0.2
65 0.18
66 0.16
67 0.17
68 0.2
69 0.23
70 0.25
71 0.21
72 0.21
73 0.22
74 0.19
75 0.18
76 0.19
77 0.18
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.19
84 0.17
85 0.17
86 0.19
87 0.19
88 0.2
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.15
93 0.14
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.11
103 0.12
104 0.15
105 0.19
106 0.2
107 0.23
108 0.32
109 0.35
110 0.38
111 0.41
112 0.4
113 0.39
114 0.42
115 0.39
116 0.33
117 0.32
118 0.27
119 0.28
120 0.28
121 0.25
122 0.26
123 0.27
124 0.27
125 0.31
126 0.34
127 0.36
128 0.45
129 0.52
130 0.54
131 0.59
132 0.57
133 0.52
134 0.53
135 0.54
136 0.53
137 0.52
138 0.54
139 0.52
140 0.61
141 0.59
142 0.58
143 0.56
144 0.49
145 0.5
146 0.44
147 0.41
148 0.34
149 0.34
150 0.31
151 0.27
152 0.23
153 0.16
154 0.13
155 0.13
156 0.1
157 0.09
158 0.1
159 0.15
160 0.21
161 0.24
162 0.29
163 0.32
164 0.33
165 0.41
166 0.43
167 0.48
168 0.5
169 0.54
170 0.54
171 0.58
172 0.66
173 0.68
174 0.71
175 0.63
176 0.57
177 0.52
178 0.49
179 0.45
180 0.43
181 0.37
182 0.39
183 0.4
184 0.42
185 0.48
186 0.5
187 0.54
188 0.51
189 0.56
190 0.57
191 0.59
192 0.64
193 0.69
194 0.74
195 0.76
196 0.81
197 0.82
198 0.82
199 0.87
200 0.87
201 0.88
202 0.83
203 0.8
204 0.8
205 0.75
206 0.68
207 0.59
208 0.52
209 0.47
210 0.47
211 0.42
212 0.33
213 0.29
214 0.27
215 0.3
216 0.28
217 0.26
218 0.23
219 0.23
220 0.25
221 0.26
222 0.26
223 0.24
224 0.22
225 0.18
226 0.15
227 0.14
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.07
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.15
249 0.16
250 0.2
251 0.23
252 0.22
253 0.2
254 0.2
255 0.19
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.13
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.13
265 0.16
266 0.2
267 0.2
268 0.23
269 0.24
270 0.25
271 0.25
272 0.25
273 0.22
274 0.16
275 0.15
276 0.15
277 0.23
278 0.23
279 0.26
280 0.28
281 0.3
282 0.34
283 0.37
284 0.36
285 0.3
286 0.31
287 0.35
288 0.39
289 0.41
290 0.38
291 0.38
292 0.38
293 0.35
294 0.32
295 0.24
296 0.18
297 0.14
298 0.12
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.1
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.16
308 0.21
309 0.28
310 0.32
311 0.31
312 0.35
313 0.36
314 0.35
315 0.37
316 0.34
317 0.37
318 0.38
319 0.4
320 0.4
321 0.45
322 0.45
323 0.44
324 0.41
325 0.32
326 0.28
327 0.26
328 0.2
329 0.14
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.09
334 0.08
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.08
341 0.09
342 0.12
343 0.13
344 0.14
345 0.13
346 0.15
347 0.19
348 0.18
349 0.2
350 0.23
351 0.23
352 0.23
353 0.25
354 0.24
355 0.19
356 0.26
357 0.27
358 0.3
359 0.37
360 0.39
361 0.43
362 0.49
363 0.52
364 0.52
365 0.59
366 0.6
367 0.59
368 0.62
369 0.67
370 0.68
371 0.73
372 0.7
373 0.62
374 0.58
375 0.55
376 0.5
377 0.44
378 0.43
379 0.38
380 0.33
381 0.3
382 0.25
383 0.21
384 0.2
385 0.15
386 0.09
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.07
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.08
401 0.13
402 0.14
403 0.17
404 0.21
405 0.21
406 0.21
407 0.21
408 0.28
409 0.25
410 0.31
411 0.37
412 0.38
413 0.4
414 0.43
415 0.44
416 0.42
417 0.44
418 0.44
419 0.36
420 0.33
421 0.32
422 0.3
423 0.3
424 0.25
425 0.2
426 0.14
427 0.13
428 0.12
429 0.11
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.13
435 0.16
436 0.15
437 0.17
438 0.19
439 0.2
440 0.21
441 0.2
442 0.18
443 0.15
444 0.15
445 0.11
446 0.09
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.09
452 0.1
453 0.13
454 0.18
455 0.25
456 0.33
457 0.44
458 0.53
459 0.61
460 0.69
461 0.77
462 0.78
463 0.77
464 0.75
465 0.71
466 0.66
467 0.63
468 0.6
469 0.55
470 0.51
471 0.46
472 0.48
473 0.5
474 0.52
475 0.51
476 0.47
477 0.52
478 0.56
479 0.57
480 0.59
481 0.54
482 0.56
483 0.57