Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MD08

Protein Details
Accession B8MD08    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-135VRPMGPRPPKLEKGKKPSTNTGNAHydrophilic
228-253IMLTTLRQKKDPKKSKNRNSSSSRSGHydrophilic
477-499SAATRKPKPPAPRRKPRITPPSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-127RPPKLEKGKK
233-255LRQKKDPKKSKNRNSSSSRSGTR
480-493TRKPKPPAPRRKPR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR003960  ATPase_AAA_CS  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR015415  Spast_Vps4_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF09336  Vps4_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00674  AAA  
CDD cd19509  RecA-like_VPS4-like  
Amino Acid Sequences MMRSKPSSSMQKTYDECYLMCSTAVYFEGQNNEAEALRSWRSALETIYYHNAYRVPPNYVPKTETEKALQESLRQLELQCKERVDLLEALQESRKEAAANNDESTDEKDSSVRPMGPRPPKLEKGKKPSTNTGNAARSSPQGWIGNGTIPAVDYNDLSKPPPLPTRPSASAAAVSLTPAASLELKETAPSSSSPHKLSPSPAPAAASSPGTPLTKESSRGSSPERRKIMLTTLRQKKDPKKSKNRNSSSSRSGTRPAASKAAGLAWGTIKKHHPVPQASESSDSDLRKDTDSKQRLSGEDVSRKVGQPKPATSPFSSDYIPSSSWREPTYPDQTPSSFASPYIDSAAAAATKSLTNDASSKPPPTAPKPPIKSLPPPKYPVYRKEYPSHPVPASSERNVRTPPLNRSASATHTPTVSSSTGETADQPIRRTLPKSQSTPRVFVGENRASVSSVSGDEPARPSPRRVDASFDGAAAASAATRKPKPPAPRRKPRITPPSSDQDSAEDDSSSERGDDDPKLRNIMKKLPKGIDINTARQILNDIVVRGDEVHWDDVAGLETAKKALKEAVVYPFLRPDLFMGLREPARGMLLFGPPGTGKTMLARAVATESKSTFFSVSASTLTSKWHGESEKLVRALFGLAKALAPSIIFVDEIDSLLSTRSSGSEHEASRRSKTEFLIQWSDLQRAAAGRNQSLDKNHDGSGDASRVLVLAATNLPWDIDEAARRRFVRRQYIPLPEDHVREQQIRRLLSHQTHEMSDEDIQVLVKVTEGFSGSDITALAKDAAMGPLRNLGEALLHTPMDQIRPIKFEDFEASLYTIRPSVGKEGLKRYEDWAREYGERGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.46
3 0.39
4 0.37
5 0.36
6 0.28
7 0.25
8 0.22
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.14
13 0.12
14 0.15
15 0.19
16 0.2
17 0.2
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.18
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.21
29 0.21
30 0.21
31 0.21
32 0.2
33 0.23
34 0.3
35 0.3
36 0.27
37 0.27
38 0.28
39 0.26
40 0.33
41 0.33
42 0.33
43 0.37
44 0.47
45 0.51
46 0.52
47 0.53
48 0.5
49 0.55
50 0.51
51 0.49
52 0.44
53 0.43
54 0.42
55 0.46
56 0.42
57 0.36
58 0.39
59 0.38
60 0.36
61 0.31
62 0.29
63 0.31
64 0.36
65 0.38
66 0.35
67 0.33
68 0.32
69 0.35
70 0.36
71 0.32
72 0.29
73 0.25
74 0.27
75 0.26
76 0.27
77 0.26
78 0.25
79 0.22
80 0.21
81 0.2
82 0.15
83 0.17
84 0.24
85 0.28
86 0.31
87 0.3
88 0.3
89 0.29
90 0.3
91 0.32
92 0.27
93 0.21
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.24
98 0.26
99 0.26
100 0.25
101 0.32
102 0.41
103 0.49
104 0.55
105 0.57
106 0.62
107 0.67
108 0.75
109 0.78
110 0.79
111 0.79
112 0.83
113 0.84
114 0.82
115 0.83
116 0.8
117 0.78
118 0.73
119 0.72
120 0.67
121 0.59
122 0.54
123 0.46
124 0.4
125 0.33
126 0.29
127 0.26
128 0.23
129 0.22
130 0.23
131 0.22
132 0.23
133 0.22
134 0.21
135 0.15
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.1
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.16
146 0.17
147 0.21
148 0.29
149 0.31
150 0.35
151 0.39
152 0.46
153 0.47
154 0.49
155 0.46
156 0.39
157 0.36
158 0.3
159 0.26
160 0.18
161 0.15
162 0.11
163 0.09
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.15
178 0.2
179 0.24
180 0.27
181 0.29
182 0.32
183 0.33
184 0.37
185 0.4
186 0.39
187 0.37
188 0.35
189 0.34
190 0.31
191 0.31
192 0.28
193 0.22
194 0.16
195 0.15
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.19
201 0.19
202 0.23
203 0.24
204 0.27
205 0.28
206 0.31
207 0.36
208 0.4
209 0.46
210 0.52
211 0.53
212 0.49
213 0.49
214 0.48
215 0.51
216 0.5
217 0.5
218 0.51
219 0.57
220 0.59
221 0.63
222 0.69
223 0.7
224 0.72
225 0.74
226 0.75
227 0.76
228 0.84
229 0.9
230 0.93
231 0.91
232 0.89
233 0.86
234 0.82
235 0.79
236 0.75
237 0.67
238 0.59
239 0.55
240 0.5
241 0.45
242 0.42
243 0.37
244 0.34
245 0.3
246 0.28
247 0.24
248 0.21
249 0.19
250 0.14
251 0.13
252 0.11
253 0.14
254 0.14
255 0.17
256 0.19
257 0.21
258 0.26
259 0.32
260 0.37
261 0.38
262 0.44
263 0.48
264 0.49
265 0.47
266 0.45
267 0.39
268 0.36
269 0.36
270 0.29
271 0.23
272 0.22
273 0.22
274 0.21
275 0.23
276 0.25
277 0.31
278 0.36
279 0.37
280 0.4
281 0.42
282 0.4
283 0.42
284 0.44
285 0.4
286 0.42
287 0.41
288 0.39
289 0.38
290 0.38
291 0.39
292 0.36
293 0.36
294 0.35
295 0.37
296 0.4
297 0.44
298 0.47
299 0.42
300 0.42
301 0.37
302 0.34
303 0.31
304 0.24
305 0.21
306 0.19
307 0.19
308 0.16
309 0.19
310 0.18
311 0.2
312 0.21
313 0.2
314 0.21
315 0.27
316 0.33
317 0.31
318 0.31
319 0.32
320 0.31
321 0.33
322 0.32
323 0.27
324 0.2
325 0.17
326 0.17
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.09
344 0.11
345 0.16
346 0.17
347 0.18
348 0.18
349 0.2
350 0.24
351 0.28
352 0.35
353 0.36
354 0.44
355 0.47
356 0.51
357 0.53
358 0.52
359 0.56
360 0.58
361 0.6
362 0.56
363 0.56
364 0.55
365 0.59
366 0.6
367 0.59
368 0.56
369 0.54
370 0.53
371 0.54
372 0.55
373 0.5
374 0.49
375 0.46
376 0.39
377 0.33
378 0.31
379 0.33
380 0.33
381 0.31
382 0.32
383 0.28
384 0.31
385 0.31
386 0.3
387 0.29
388 0.29
389 0.32
390 0.34
391 0.34
392 0.32
393 0.34
394 0.34
395 0.33
396 0.32
397 0.28
398 0.21
399 0.2
400 0.19
401 0.16
402 0.18
403 0.13
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.13
412 0.14
413 0.15
414 0.15
415 0.17
416 0.18
417 0.2
418 0.24
419 0.3
420 0.34
421 0.39
422 0.43
423 0.51
424 0.52
425 0.52
426 0.47
427 0.41
428 0.35
429 0.32
430 0.35
431 0.28
432 0.25
433 0.24
434 0.23
435 0.2
436 0.2
437 0.18
438 0.1
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.11
445 0.13
446 0.17
447 0.18
448 0.19
449 0.21
450 0.28
451 0.32
452 0.31
453 0.34
454 0.31
455 0.35
456 0.34
457 0.29
458 0.23
459 0.18
460 0.17
461 0.11
462 0.09
463 0.03
464 0.04
465 0.05
466 0.08
467 0.1
468 0.12
469 0.16
470 0.22
471 0.32
472 0.42
473 0.53
474 0.61
475 0.71
476 0.77
477 0.84
478 0.85
479 0.85
480 0.85
481 0.79
482 0.74
483 0.68
484 0.68
485 0.62
486 0.55
487 0.45
488 0.36
489 0.34
490 0.29
491 0.25
492 0.15
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.1
497 0.07
498 0.06
499 0.07
500 0.09
501 0.12
502 0.15
503 0.2
504 0.21
505 0.25
506 0.26
507 0.3
508 0.31
509 0.38
510 0.43
511 0.43
512 0.48
513 0.46
514 0.49
515 0.48
516 0.46
517 0.46
518 0.41
519 0.39
520 0.38
521 0.38
522 0.32
523 0.3
524 0.29
525 0.2
526 0.19
527 0.16
528 0.12
529 0.09
530 0.09
531 0.1
532 0.09
533 0.08
534 0.08
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.08
541 0.09
542 0.07
543 0.06
544 0.05
545 0.06
546 0.07
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.09
551 0.11
552 0.12
553 0.15
554 0.19
555 0.23
556 0.24
557 0.24
558 0.24
559 0.23
560 0.21
561 0.18
562 0.14
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.14
567 0.18
568 0.18
569 0.18
570 0.17
571 0.12
572 0.12
573 0.12
574 0.11
575 0.1
576 0.11
577 0.11
578 0.11
579 0.11
580 0.1
581 0.11
582 0.12
583 0.1
584 0.09
585 0.11
586 0.14
587 0.14
588 0.14
589 0.14
590 0.12
591 0.15
592 0.16
593 0.15
594 0.15
595 0.14
596 0.15
597 0.16
598 0.16
599 0.14
600 0.12
601 0.12
602 0.11
603 0.12
604 0.11
605 0.11
606 0.12
607 0.12
608 0.13
609 0.14
610 0.14
611 0.14
612 0.18
613 0.18
614 0.18
615 0.25
616 0.29
617 0.33
618 0.34
619 0.32
620 0.28
621 0.27
622 0.27
623 0.22
624 0.16
625 0.11
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.08
631 0.07
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.07
638 0.07
639 0.08
640 0.07
641 0.07
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.05
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.08
650 0.14
651 0.19
652 0.21
653 0.27
654 0.33
655 0.35
656 0.39
657 0.42
658 0.39
659 0.38
660 0.38
661 0.41
662 0.39
663 0.43
664 0.45
665 0.41
666 0.44
667 0.43
668 0.42
669 0.33
670 0.28
671 0.23
672 0.18
673 0.2
674 0.17
675 0.18
676 0.18
677 0.21
678 0.23
679 0.25
680 0.28
681 0.3
682 0.32
683 0.32
684 0.31
685 0.29
686 0.28
687 0.26
688 0.27
689 0.24
690 0.19
691 0.16
692 0.15
693 0.14
694 0.12
695 0.1
696 0.06
697 0.06
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.08
705 0.08
706 0.1
707 0.15
708 0.19
709 0.23
710 0.29
711 0.31
712 0.35
713 0.4
714 0.47
715 0.52
716 0.55
717 0.6
718 0.62
719 0.71
720 0.68
721 0.64
722 0.62
723 0.55
724 0.52
725 0.46
726 0.44
727 0.39
728 0.43
729 0.43
730 0.43
731 0.45
732 0.43
733 0.42
734 0.4
735 0.44
736 0.43
737 0.46
738 0.46
739 0.42
740 0.4
741 0.4
742 0.37
743 0.32
744 0.27
745 0.23
746 0.17
747 0.14
748 0.14
749 0.12
750 0.12
751 0.09
752 0.09
753 0.08
754 0.08
755 0.09
756 0.1
757 0.1
758 0.1
759 0.12
760 0.11
761 0.11
762 0.11
763 0.1
764 0.09
765 0.1
766 0.1
767 0.08
768 0.08
769 0.09
770 0.12
771 0.14
772 0.14
773 0.14
774 0.2
775 0.2
776 0.2
777 0.19
778 0.15
779 0.14
780 0.15
781 0.17
782 0.13
783 0.13
784 0.13
785 0.15
786 0.17
787 0.17
788 0.2
789 0.22
790 0.23
791 0.25
792 0.29
793 0.3
794 0.29
795 0.3
796 0.3
797 0.29
798 0.27
799 0.27
800 0.26
801 0.23
802 0.23
803 0.21
804 0.17
805 0.15
806 0.15
807 0.15
808 0.19
809 0.26
810 0.31
811 0.36
812 0.44
813 0.52
814 0.53
815 0.52
816 0.52
817 0.53
818 0.51
819 0.5
820 0.45
821 0.42
822 0.42