FuNGI

A0A2I2FGI3

Protein Details

Accession

A0A2I2FGI3

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-51	APPMRIRRPKAADPLVRPKKRVTKPPGPTSARS	Hydrophilic
132-152	ESQFTRPVRLQRRDPRARFQA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-47	MRIRRPKAADPLVRPKKRVTKPPGPT
411-432	EKKEKEARRVLGKGVRKALQKR
471-482	EKNKKEPAASSK
498-499	KK
524-530	RKKGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSTSTPDANVRTPTGSNGAPPMRIRRPKAADPLVRPKKRVTKPPGPTSARSGLAMKSLPPRPAAINHSSGSQLEKGRQTPSGDLYTNGFSGPLLSESYVDYPLVTTKRALREGLKHHIAKFASKKTIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARFQATNDEKAQGLQQTPDDSSNQVDEAERDDLEVRKAAREKERADNLAQIAPSAGSAPKKSNAPKQKTQQVSKTDFTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNVWVGNYEAALSETHAVFILENTGKMRMIPIEKWYRFNAKNQFKALTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQEVAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGAASGVEGLEGDEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKEYEEEEVREKKEKEARRVLGKGVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYTDEESSEDSETEKLKEEERKAEEEKNKKEPAASSKGNSTPSSRHKHTDSFKKSAAAASRKRFGSPNMSDASGTDTSRKKGKGKPATSQQPISRPMSPTVSSPGAVGKKRVRNVPTGGAGSGSEADAGAGSGGEMSESGKTKKIKLNPPSTTPRTATPQGSRAGSPAPLAGRSFSGSRASSPESNRGPARLSTPGPSGQAFPTPAEIHAAIPQSGIMSSDLLKIFRPRIGDSKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGSLKEG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.28
3	0.26
4	0.3
5	0.3
6	0.31
7	0.34
8	0.4
9	0.46
10	0.54
11	0.58
12	0.61
13	0.66
14	0.7
15	0.76
16	0.77
17	0.76
18	0.76
19	0.81
20	0.82
21	0.8
22	0.74
23	0.73
24	0.74
25	0.74
26	0.76
27	0.75
28	0.74
29	0.79
30	0.86
31	0.87
32	0.83
33	0.78
34	0.75
35	0.71
36	0.62
37	0.54
38	0.46
39	0.36
40	0.34
41	0.32
42	0.28
43	0.3
44	0.33
45	0.33
46	0.33
47	0.34
48	0.33
49	0.38
50	0.41
51	0.38
52	0.38
53	0.37
54	0.36
55	0.35
56	0.32
57	0.3
58	0.28
59	0.26
60	0.26
61	0.32
62	0.33
63	0.34
64	0.38
65	0.38
66	0.37
67	0.39
68	0.39
69	0.34
70	0.32
71	0.32
72	0.3
73	0.27
74	0.23
75	0.18
76	0.12
77	0.12
78	0.12
79	0.1
80	0.09
81	0.09
82	0.1
83	0.12
84	0.14
85	0.14
86	0.13
87	0.11
88	0.11
89	0.15
90	0.16
91	0.16
92	0.17
93	0.22
94	0.28
95	0.32
96	0.34
97	0.35
98	0.42
99	0.48
100	0.55
101	0.57
102	0.54
103	0.52
104	0.55
105	0.5
106	0.5
107	0.51
108	0.49
109	0.48
110	0.46
111	0.5
112	0.53
113	0.62
114	0.58
115	0.55
116	0.53
117	0.55
118	0.58
119	0.55
120	0.51
121	0.49
122	0.46
123	0.47
124	0.45
125	0.46
126	0.52
127	0.57
128	0.62
129	0.65
130	0.75
131	0.79
132	0.8
133	0.8
134	0.8
135	0.78
136	0.71
137	0.65
138	0.66
139	0.61
140	0.62
141	0.54
142	0.46
143	0.39
144	0.37
145	0.34
146	0.26
147	0.22
148	0.17
149	0.17
150	0.18
151	0.2
152	0.21
153	0.19
154	0.17
155	0.17
156	0.16
157	0.15
158	0.13
159	0.12
160	0.11
161	0.13
162	0.14
163	0.12
164	0.12
165	0.14
166	0.14
167	0.15
168	0.18
169	0.15
170	0.19
171	0.23
172	0.28
173	0.34
174	0.4
175	0.43
176	0.49
177	0.55
178	0.52
179	0.5
180	0.49
181	0.42
182	0.38
183	0.33
184	0.24
185	0.18
186	0.15
187	0.13
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.12
192	0.14
193	0.17
194	0.23
195	0.28
196	0.37
197	0.45
198	0.51
199	0.58
200	0.64
201	0.71
202	0.73
203	0.75
204	0.73
205	0.71
206	0.69
207	0.62
208	0.56
209	0.51
210	0.43
211	0.38
212	0.35
213	0.26
214	0.25
215	0.25
216	0.26
217	0.25
218	0.26
219	0.25
220	0.21
221	0.23
222	0.19
223	0.2
224	0.24
225	0.25
226	0.28
227	0.27
228	0.26
229	0.25
230	0.24
231	0.21
232	0.17
233	0.18
234	0.18
235	0.19
236	0.18
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.16
241	0.13
242	0.09
243	0.08
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.09
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.1
265	0.12
266	0.13
267	0.19
268	0.29
269	0.3
270	0.33
271	0.35
272	0.41
273	0.4
274	0.46
275	0.5
276	0.48
277	0.52
278	0.52
279	0.5
280	0.43
281	0.44
282	0.37
283	0.3
284	0.23
285	0.2
286	0.17
287	0.17
288	0.16
289	0.14
290	0.13
291	0.13
292	0.16
293	0.14
294	0.2
295	0.29
296	0.38
297	0.44
298	0.49
299	0.5
300	0.54
301	0.56
302	0.52
303	0.53
304	0.46
305	0.41
306	0.43
307	0.46
308	0.41
309	0.41
310	0.43
311	0.35
312	0.33
313	0.35
314	0.31
315	0.26
316	0.27
317	0.34
318	0.37
319	0.43
320	0.42
321	0.4
322	0.41
323	0.44
324	0.42
325	0.43
326	0.4
327	0.35
328	0.35
329	0.34
330	0.31
331	0.25
332	0.22
333	0.12
334	0.07
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.07
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.06
362	0.05
363	0.04
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.08
369	0.11
370	0.14
371	0.17
372	0.24
373	0.31
374	0.32
375	0.4
376	0.46
377	0.51
378	0.52
379	0.5
380	0.44
381	0.4
382	0.38
383	0.32
384	0.26
385	0.19
386	0.17
387	0.17
388	0.17
389	0.14
390	0.15
391	0.15
392	0.16
393	0.14
394	0.16
395	0.19
396	0.2
397	0.25
398	0.25
399	0.29
400	0.34
401	0.4
402	0.45
403	0.51
404	0.54
405	0.55
406	0.57
407	0.55
408	0.54
409	0.53
410	0.49
411	0.45
412	0.45
413	0.43
414	0.48
415	0.54
416	0.57
417	0.58
418	0.59
419	0.64
420	0.63
421	0.62
422	0.59
423	0.55
424	0.48
425	0.43
426	0.4
427	0.32
428	0.28
429	0.26
430	0.23
431	0.17
432	0.15
433	0.13
434	0.13
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.12
443	0.14
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.17
449	0.23
450	0.26
451	0.32
452	0.34
453	0.39
454	0.39
455	0.47
456	0.51
457	0.53
458	0.57
459	0.57
460	0.56
461	0.51
462	0.5
463	0.47
464	0.46
465	0.45
466	0.42
467	0.35
468	0.38
469	0.41
470	0.42
471	0.39
472	0.34
473	0.34
474	0.39
475	0.46
476	0.44
477	0.45
478	0.46
479	0.53
480	0.58
481	0.62
482	0.61
483	0.58
484	0.57
485	0.55
486	0.51
487	0.47
488	0.46
489	0.44
490	0.45
491	0.45
492	0.5
493	0.48
494	0.49
495	0.48
496	0.43
497	0.44
498	0.39
499	0.38
500	0.34
501	0.34
502	0.32
503	0.3
504	0.32
505	0.24
506	0.21
507	0.21
508	0.22
509	0.24
510	0.3
511	0.34
512	0.35
513	0.4
514	0.51
515	0.56
516	0.59
517	0.65
518	0.7
519	0.76
520	0.74
521	0.74
522	0.68
523	0.64
524	0.63
525	0.58
526	0.51
527	0.44
528	0.41
529	0.4
530	0.36
531	0.31
532	0.32
533	0.29
534	0.25
535	0.23
536	0.26
537	0.27
538	0.27
539	0.32
540	0.35
541	0.41
542	0.46
543	0.53
544	0.5
545	0.51
546	0.54
547	0.54
548	0.5
549	0.44
550	0.4
551	0.33
552	0.29
553	0.24
554	0.19
555	0.13
556	0.08
557	0.06
558	0.06
559	0.05
560	0.05
561	0.04
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.07
570	0.1
571	0.12
572	0.18
573	0.2
574	0.26
575	0.34
576	0.42
577	0.49
578	0.57
579	0.66
580	0.66
581	0.72
582	0.75
583	0.74
584	0.7
585	0.63
586	0.57
587	0.54
588	0.54
589	0.52
590	0.48
591	0.48
592	0.46
593	0.46
594	0.42
595	0.37
596	0.34
597	0.28
598	0.23
599	0.21
600	0.18
601	0.18
602	0.18
603	0.17
604	0.17
605	0.18
606	0.18
607	0.17
608	0.21
609	0.2
610	0.21
611	0.25
612	0.28
613	0.32
614	0.35
615	0.42
616	0.4
617	0.45
618	0.45
619	0.42
620	0.4
621	0.36
622	0.37
623	0.34
624	0.33
625	0.31
626	0.33
627	0.34
628	0.33
629	0.32
630	0.3
631	0.26
632	0.28
633	0.26
634	0.23
635	0.25
636	0.23
637	0.23
638	0.24
639	0.23
640	0.2
641	0.22
642	0.23
643	0.18
644	0.17
645	0.17
646	0.14
647	0.13
648	0.13
649	0.09
650	0.09
651	0.1
652	0.14
653	0.16
654	0.16
655	0.19
656	0.23
657	0.25
658	0.26
659	0.29
660	0.28
661	0.36
662	0.43
663	0.48
664	0.48
665	0.56
666	0.64
667	0.65
668	0.64
669	0.56
670	0.5
671	0.45
672	0.49
673	0.45
674	0.39
675	0.37
676	0.35
677	0.35
678	0.33
679	0.32
680	0.25
681	0.19
682	0.17
683	0.18
684	0.21
685	0.22
686	0.23
687	0.29
688	0.31
689	0.3
690	0.34

A0A2I2FGI3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer