Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MDY7

Protein Details
Accession B8MDY7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-261TVVTRGKRGVKKGKRKGRKARDFDEDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-255RGKRGVKKGKRKGRKAR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MDVAESTEPVAQPGVELAGAIGDADISLDHLVDDGRSSSLSEIDDVSENEPSDDELPPPPRPAPEEADSEAETERLEESPNNHLIKRDIRLRGENRFESSPSKLAQSTTYDEMEEDEENELNETPTKTRRSSKPNGASESLEIPVIGDASSPPSPAAVAGKKRKHPQADGDVDTEMGEDDEPLRKRRGSVGGDEVPEETGADASTTREETEEVPQQDTSGKATPVDETRDSAVPTVVTRGKRGVKKGKRKGRKARDFDEDLENGDAATENTEDQLQEDEEAGDVADDANDADAATKSEEELARKIAAIDALAVLEKEFATLREKIYDEKIAKLDYELEQLTSPEPSHLELQRQLKCLERHRDKKINYEQTLFQYRMQSLMSRSLADRAALHSTYFQRIRDTREKHSTAVSKQFYAIQHDRFKTEEVGTHHYIPFPTRRSQQISQQAAYNQEVSVMAGVAKYVGFPAAPTLSEARATEVDEDFEKMGISIEHRPVVAPQSGIRGNVSSDLPRYTTAEESLHEQQAVWTNPQYVHANRPAHLSNMTSYTTPAAQKRVIDINAPNGSASTIPDNASAANSSTANTPYGVEQDHRQHGAGHIGNVDFDALDRKSGFRSQSSSPLDVRKGPSSNPNHLFEGRHESTTRNPGYSPPRFGLFGTSKREPSPPLSTSNKALGGLHSSRLMTGSGPSRMIAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.07
3 0.07
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.05
8 0.04
9 0.03
10 0.03
11 0.03
12 0.03
13 0.04
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.06
19 0.06
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.14
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.17
36 0.16
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.19
43 0.24
44 0.26
45 0.29
46 0.3
47 0.31
48 0.34
49 0.37
50 0.37
51 0.36
52 0.39
53 0.38
54 0.4
55 0.37
56 0.35
57 0.3
58 0.23
59 0.19
60 0.14
61 0.13
62 0.09
63 0.11
64 0.12
65 0.15
66 0.21
67 0.28
68 0.3
69 0.3
70 0.32
71 0.35
72 0.39
73 0.43
74 0.45
75 0.45
76 0.48
77 0.57
78 0.6
79 0.65
80 0.67
81 0.64
82 0.6
83 0.56
84 0.52
85 0.47
86 0.45
87 0.4
88 0.33
89 0.32
90 0.29
91 0.27
92 0.28
93 0.29
94 0.29
95 0.28
96 0.28
97 0.25
98 0.24
99 0.24
100 0.22
101 0.18
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.21
113 0.26
114 0.3
115 0.38
116 0.46
117 0.53
118 0.61
119 0.69
120 0.72
121 0.75
122 0.76
123 0.7
124 0.63
125 0.56
126 0.49
127 0.38
128 0.28
129 0.2
130 0.14
131 0.12
132 0.1
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.16
144 0.18
145 0.27
146 0.36
147 0.44
148 0.51
149 0.59
150 0.66
151 0.67
152 0.67
153 0.67
154 0.67
155 0.67
156 0.63
157 0.57
158 0.49
159 0.42
160 0.36
161 0.27
162 0.17
163 0.09
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.12
168 0.15
169 0.18
170 0.21
171 0.22
172 0.23
173 0.29
174 0.36
175 0.33
176 0.36
177 0.41
178 0.42
179 0.42
180 0.41
181 0.35
182 0.27
183 0.23
184 0.18
185 0.1
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.15
198 0.21
199 0.21
200 0.22
201 0.22
202 0.22
203 0.22
204 0.21
205 0.2
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.14
210 0.16
211 0.18
212 0.22
213 0.19
214 0.18
215 0.2
216 0.21
217 0.21
218 0.19
219 0.17
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.23
227 0.29
228 0.33
229 0.42
230 0.48
231 0.54
232 0.64
233 0.74
234 0.79
235 0.82
236 0.88
237 0.91
238 0.91
239 0.92
240 0.88
241 0.84
242 0.81
243 0.75
244 0.67
245 0.61
246 0.5
247 0.41
248 0.33
249 0.27
250 0.19
251 0.14
252 0.11
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.17
313 0.22
314 0.2
315 0.21
316 0.22
317 0.2
318 0.19
319 0.18
320 0.17
321 0.12
322 0.13
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.11
334 0.11
335 0.14
336 0.18
337 0.25
338 0.28
339 0.3
340 0.29
341 0.32
342 0.35
343 0.41
344 0.46
345 0.49
346 0.53
347 0.6
348 0.68
349 0.63
350 0.69
351 0.71
352 0.7
353 0.63
354 0.58
355 0.51
356 0.48
357 0.51
358 0.42
359 0.34
360 0.27
361 0.24
362 0.23
363 0.21
364 0.18
365 0.15
366 0.19
367 0.17
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.11
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.15
380 0.19
381 0.21
382 0.2
383 0.22
384 0.24
385 0.32
386 0.38
387 0.41
388 0.43
389 0.5
390 0.52
391 0.48
392 0.51
393 0.49
394 0.43
395 0.47
396 0.42
397 0.33
398 0.32
399 0.34
400 0.3
401 0.33
402 0.33
403 0.31
404 0.36
405 0.36
406 0.37
407 0.34
408 0.35
409 0.29
410 0.26
411 0.24
412 0.22
413 0.27
414 0.28
415 0.3
416 0.28
417 0.27
418 0.26
419 0.24
420 0.25
421 0.22
422 0.25
423 0.26
424 0.31
425 0.38
426 0.4
427 0.46
428 0.51
429 0.52
430 0.48
431 0.47
432 0.43
433 0.39
434 0.37
435 0.29
436 0.19
437 0.15
438 0.14
439 0.11
440 0.09
441 0.06
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.03
451 0.04
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.1
457 0.1
458 0.12
459 0.12
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.14
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.14
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.08
472 0.08
473 0.07
474 0.09
475 0.12
476 0.15
477 0.15
478 0.16
479 0.16
480 0.17
481 0.2
482 0.19
483 0.15
484 0.13
485 0.18
486 0.19
487 0.2
488 0.19
489 0.16
490 0.15
491 0.17
492 0.17
493 0.13
494 0.14
495 0.15
496 0.15
497 0.16
498 0.17
499 0.17
500 0.17
501 0.17
502 0.17
503 0.16
504 0.2
505 0.23
506 0.22
507 0.2
508 0.19
509 0.19
510 0.24
511 0.26
512 0.22
513 0.2
514 0.21
515 0.21
516 0.25
517 0.28
518 0.23
519 0.28
520 0.34
521 0.35
522 0.34
523 0.38
524 0.36
525 0.33
526 0.33
527 0.28
528 0.21
529 0.22
530 0.22
531 0.18
532 0.17
533 0.17
534 0.18
535 0.21
536 0.22
537 0.23
538 0.24
539 0.25
540 0.28
541 0.33
542 0.31
543 0.31
544 0.3
545 0.34
546 0.34
547 0.33
548 0.29
549 0.23
550 0.22
551 0.18
552 0.18
553 0.13
554 0.12
555 0.13
556 0.13
557 0.14
558 0.13
559 0.14
560 0.13
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.11
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.13
569 0.13
570 0.12
571 0.14
572 0.15
573 0.15
574 0.2
575 0.26
576 0.31
577 0.32
578 0.32
579 0.3
580 0.3
581 0.37
582 0.33
583 0.27
584 0.24
585 0.22
586 0.22
587 0.2
588 0.19
589 0.1
590 0.09
591 0.12
592 0.1
593 0.12
594 0.13
595 0.14
596 0.17
597 0.23
598 0.26
599 0.25
600 0.29
601 0.31
602 0.4
603 0.44
604 0.45
605 0.44
606 0.47
607 0.47
608 0.48
609 0.49
610 0.46
611 0.43
612 0.42
613 0.48
614 0.49
615 0.56
616 0.56
617 0.55
618 0.53
619 0.53
620 0.52
621 0.47
622 0.49
623 0.42
624 0.39
625 0.36
626 0.34
627 0.38
628 0.46
629 0.45
630 0.37
631 0.35
632 0.39
633 0.48
634 0.52
635 0.52
636 0.45
637 0.45
638 0.44
639 0.44
640 0.45
641 0.43
642 0.43
643 0.44
644 0.47
645 0.47
646 0.48
647 0.51
648 0.46
649 0.46
650 0.47
651 0.42
652 0.44
653 0.48
654 0.49
655 0.5
656 0.51
657 0.46
658 0.39
659 0.37
660 0.32
661 0.33
662 0.31
663 0.29
664 0.26
665 0.24
666 0.23
667 0.23
668 0.22
669 0.15
670 0.18
671 0.22
672 0.22
673 0.23