Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1BY73

Protein Details
Accession A0A2I1BY73    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-48PAPAAVSEPERKRKHKHKDQSSKKKRKHDANLIADETBasic
50-74VHETTSKKSSKSKGKSKQKSSEDAPHydrophilic
340-371TLEESPSKKKERKTEKEKKSKSSRSKKKKEEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-39ERKRKHKHKDQSSKKKRKH
57-66KSSKSKGKSK
346-371SKKKERKTEKEKKSKSSRSKKKKEEK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAVDAMDVDSSPAPAAVSEPERKRKHKHKDQSSKKKRKHDANLIADETTVHETTSKKSSKSKGKSKQKSSEDAPSPSDSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYYPLYRRGQILEGWINVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSNWKWVPPGEEEEENGFNSGEKPKKKVFSSTEDEDDSEPSSHFDPEKEHFKPISLASDANPFSETMDLDNGSAEDEDSAAEGYFQSLSGHRVRGTVRFRVVDIDVIPGSDRERGFLSIEGTMLSPEEEARVLEDERNGNYSSMTPRPQGQWESSSAMSGALAGSSSAAPETQISSADADTGTLEESPSKKKERKTEKEKKSKSSRSKKKKEEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.09
3 0.12
4 0.17
5 0.26
6 0.34
7 0.44
8 0.52
9 0.59
10 0.69
11 0.75
12 0.8
13 0.83
14 0.86
15 0.87
16 0.9
17 0.95
18 0.96
19 0.97
20 0.97
21 0.94
22 0.94
23 0.93
24 0.92
25 0.91
26 0.91
27 0.9
28 0.89
29 0.87
30 0.78
31 0.69
32 0.57
33 0.47
34 0.38
35 0.31
36 0.21
37 0.14
38 0.14
39 0.15
40 0.19
41 0.28
42 0.3
43 0.29
44 0.37
45 0.47
46 0.55
47 0.64
48 0.72
49 0.73
50 0.8
51 0.87
52 0.9
53 0.91
54 0.87
55 0.85
56 0.79
57 0.78
58 0.73
59 0.66
60 0.59
61 0.53
62 0.46
63 0.39
64 0.35
65 0.25
66 0.2
67 0.18
68 0.15
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.06
105 0.11
106 0.13
107 0.17
108 0.18
109 0.19
110 0.2
111 0.22
112 0.22
113 0.19
114 0.23
115 0.22
116 0.21
117 0.2
118 0.19
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.09
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.05
138 0.06
139 0.09
140 0.1
141 0.13
142 0.17
143 0.19
144 0.26
145 0.3
146 0.39
147 0.44
148 0.48
149 0.48
150 0.46
151 0.47
152 0.42
153 0.4
154 0.33
155 0.26
156 0.22
157 0.22
158 0.21
159 0.18
160 0.16
161 0.12
162 0.09
163 0.1
164 0.14
165 0.18
166 0.18
167 0.23
168 0.26
169 0.32
170 0.33
171 0.39
172 0.38
173 0.4
174 0.45
175 0.44
176 0.42
177 0.38
178 0.37
179 0.3
180 0.26
181 0.2
182 0.14
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.15
191 0.22
192 0.22
193 0.25
194 0.24
195 0.24
196 0.26
197 0.24
198 0.23
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.2
203 0.19
204 0.18
205 0.17
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.09
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.16
237 0.17
238 0.25
239 0.29
240 0.31
241 0.33
242 0.32
243 0.32
244 0.32
245 0.32
246 0.26
247 0.22
248 0.19
249 0.15
250 0.14
251 0.14
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.07
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.1
276 0.1
277 0.12
278 0.15
279 0.17
280 0.18
281 0.21
282 0.2
283 0.18
284 0.18
285 0.19
286 0.21
287 0.23
288 0.25
289 0.25
290 0.27
291 0.3
292 0.35
293 0.37
294 0.36
295 0.34
296 0.34
297 0.36
298 0.33
299 0.3
300 0.24
301 0.2
302 0.16
303 0.13
304 0.09
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.07
328 0.08
329 0.11
330 0.14
331 0.21
332 0.27
333 0.35
334 0.41
335 0.49
336 0.59
337 0.66
338 0.75
339 0.8
340 0.85
341 0.87
342 0.92
343 0.93
344 0.93
345 0.93
346 0.93
347 0.92
348 0.93
349 0.93
350 0.93
351 0.95