Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MSW1

Protein Details
Accession B8MSW1    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MDKKKTTRKWIEQLRTKATKEHydrophilic
259-279NALKQVKKGLEKKKKERDSDTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-275KKGLEKKKKER
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF13976  gag_pre-integrs  
Amino Acid Sequences MDKKKTTRKWIEQLRTKATKERVWEYIYEHNKAQYEKHIEQMTNVKNYILDTIELGHQSEIQQMEDIKEIIRTLKRRFALTEQRENDLLLNQERSLLNLKRTQRPKEWAEKWRTLVLDMKLANFYELLDTRLARDFIQSTVEIAPKFHDIWSTRILKYDMGLDTSGLTEIPDINEIIGTFDKRDIAMATLNGKSDQPEDNKKSQMRSKLKDKTCLCGQKHQFEDCPYVNPAKRPKDWESDISIEEKFKNLEKKDTPYANALKQVKKGLEKKKKERDSDTSKKTDKDLERSNFMYDSDKITCAVRLDTVLLASNDNLTNKVIMDNVYPTQPISEKVKRKGIIVRDACQELCHIRREGNLYLIEWDENKPARSSLSVDFAFNSMEKNILKDLMNVWHKRFGHVSSRAIEKLQEAIEGAIVMSVPSRNNEGFKIKCETCELTTAKRQISRVAMPLPTRPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.85
3 0.78
4 0.77
5 0.73
6 0.67
7 0.64
8 0.6
9 0.56
10 0.52
11 0.51
12 0.47
13 0.5
14 0.51
15 0.47
16 0.43
17 0.41
18 0.42
19 0.41
20 0.4
21 0.39
22 0.42
23 0.4
24 0.46
25 0.47
26 0.44
27 0.46
28 0.52
29 0.49
30 0.45
31 0.44
32 0.37
33 0.32
34 0.32
35 0.31
36 0.22
37 0.16
38 0.12
39 0.13
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.17
47 0.16
48 0.14
49 0.15
50 0.15
51 0.16
52 0.17
53 0.17
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.17
58 0.23
59 0.28
60 0.31
61 0.39
62 0.41
63 0.43
64 0.46
65 0.5
66 0.54
67 0.56
68 0.62
69 0.56
70 0.57
71 0.55
72 0.51
73 0.43
74 0.34
75 0.29
76 0.22
77 0.21
78 0.18
79 0.21
80 0.21
81 0.22
82 0.27
83 0.26
84 0.28
85 0.33
86 0.39
87 0.44
88 0.53
89 0.57
90 0.58
91 0.63
92 0.66
93 0.7
94 0.73
95 0.73
96 0.73
97 0.73
98 0.68
99 0.65
100 0.57
101 0.49
102 0.46
103 0.38
104 0.35
105 0.29
106 0.28
107 0.24
108 0.24
109 0.22
110 0.16
111 0.14
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.14
118 0.16
119 0.17
120 0.13
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.16
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.14
135 0.17
136 0.16
137 0.2
138 0.27
139 0.3
140 0.28
141 0.3
142 0.31
143 0.26
144 0.24
145 0.25
146 0.19
147 0.16
148 0.16
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.16
183 0.18
184 0.26
185 0.31
186 0.34
187 0.41
188 0.42
189 0.45
190 0.45
191 0.51
192 0.51
193 0.52
194 0.58
195 0.62
196 0.64
197 0.68
198 0.64
199 0.6
200 0.59
201 0.62
202 0.54
203 0.54
204 0.54
205 0.52
206 0.54
207 0.5
208 0.44
209 0.37
210 0.4
211 0.32
212 0.3
213 0.24
214 0.25
215 0.24
216 0.27
217 0.33
218 0.33
219 0.35
220 0.39
221 0.42
222 0.45
223 0.47
224 0.45
225 0.41
226 0.38
227 0.36
228 0.32
229 0.28
230 0.22
231 0.19
232 0.16
233 0.13
234 0.14
235 0.2
236 0.19
237 0.26
238 0.28
239 0.33
240 0.39
241 0.41
242 0.39
243 0.38
244 0.41
245 0.35
246 0.4
247 0.39
248 0.35
249 0.36
250 0.38
251 0.35
252 0.39
253 0.46
254 0.49
255 0.55
256 0.62
257 0.69
258 0.76
259 0.82
260 0.8
261 0.79
262 0.78
263 0.77
264 0.78
265 0.75
266 0.72
267 0.67
268 0.62
269 0.57
270 0.56
271 0.51
272 0.48
273 0.51
274 0.46
275 0.47
276 0.47
277 0.47
278 0.38
279 0.34
280 0.3
281 0.21
282 0.22
283 0.19
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.18
288 0.15
289 0.15
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.15
318 0.2
319 0.28
320 0.35
321 0.41
322 0.5
323 0.49
324 0.52
325 0.56
326 0.55
327 0.57
328 0.54
329 0.51
330 0.47
331 0.49
332 0.45
333 0.38
334 0.33
335 0.28
336 0.26
337 0.27
338 0.23
339 0.23
340 0.26
341 0.31
342 0.3
343 0.3
344 0.28
345 0.24
346 0.24
347 0.24
348 0.21
349 0.18
350 0.18
351 0.19
352 0.2
353 0.21
354 0.2
355 0.2
356 0.21
357 0.21
358 0.24
359 0.2
360 0.25
361 0.25
362 0.24
363 0.24
364 0.23
365 0.22
366 0.19
367 0.17
368 0.1
369 0.14
370 0.13
371 0.15
372 0.15
373 0.17
374 0.18
375 0.18
376 0.2
377 0.26
378 0.34
379 0.36
380 0.38
381 0.43
382 0.43
383 0.44
384 0.45
385 0.41
386 0.42
387 0.45
388 0.47
389 0.42
390 0.48
391 0.46
392 0.43
393 0.39
394 0.31
395 0.28
396 0.24
397 0.21
398 0.16
399 0.15
400 0.14
401 0.13
402 0.11
403 0.07
404 0.06
405 0.05
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.15
411 0.17
412 0.2
413 0.24
414 0.32
415 0.32
416 0.36
417 0.43
418 0.39
419 0.4
420 0.43
421 0.43
422 0.37
423 0.43
424 0.41
425 0.4
426 0.48
427 0.51
428 0.51
429 0.52
430 0.51
431 0.49
432 0.53
433 0.51
434 0.49
435 0.48
436 0.48
437 0.46