Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1CMD2

Protein Details
Accession A0A2I1CMD2    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30DAIIQADRKKRKNEELASKIHydrophilic
84-106VRAAHSQPKRASKRRPDEERLLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-54RKKRKNEELASKILGKNKKTVAAGAGAGIKAQKAKPG
90-98QPKRASKRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MAASQGAVSFDAIIQADRKKRKNEELASKILGKNKKTVAAGAGAGIKAQKAKPGSLASRIGVVKPYASATSKTTKNHRTQPAPVRAAHSQPKRASKRRPDEERLLSALNPASGQSTVRDNPVGITIRGAGSGSFVVIGSNFAPGTTAADIQSAIEPLSGQILSCWITSQHPTVTAEITFADKWAAEKAIANFHNQRADGRILSMRFKHSTAEPTPSQHVQSPQSSFSNLREQADRERRLNRKAEPAVQDGRHGFAEGNAQVLSQDDSRGNGRYNRRNARGNRAYGRAGRQTNQNTQETGLYSDQMMVDAPTQNSSHRGGRHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.19
3 0.28
4 0.36
5 0.44
6 0.51
7 0.59
8 0.68
9 0.75
10 0.78
11 0.81
12 0.79
13 0.78
14 0.73
15 0.7
16 0.63
17 0.6
18 0.56
19 0.48
20 0.48
21 0.46
22 0.47
23 0.43
24 0.42
25 0.37
26 0.33
27 0.31
28 0.26
29 0.24
30 0.18
31 0.17
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.18
37 0.18
38 0.19
39 0.24
40 0.31
41 0.33
42 0.35
43 0.38
44 0.33
45 0.37
46 0.36
47 0.32
48 0.28
49 0.25
50 0.19
51 0.17
52 0.18
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.19
57 0.25
58 0.3
59 0.34
60 0.41
61 0.47
62 0.53
63 0.61
64 0.66
65 0.65
66 0.7
67 0.75
68 0.76
69 0.71
70 0.65
71 0.6
72 0.54
73 0.54
74 0.53
75 0.49
76 0.47
77 0.49
78 0.58
79 0.63
80 0.69
81 0.73
82 0.75
83 0.79
84 0.82
85 0.85
86 0.82
87 0.81
88 0.79
89 0.72
90 0.64
91 0.54
92 0.44
93 0.37
94 0.3
95 0.21
96 0.15
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.13
107 0.14
108 0.17
109 0.18
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.09
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.09
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.06
173 0.09
174 0.1
175 0.17
176 0.18
177 0.21
178 0.22
179 0.24
180 0.27
181 0.25
182 0.24
183 0.2
184 0.22
185 0.18
186 0.17
187 0.19
188 0.17
189 0.21
190 0.22
191 0.23
192 0.23
193 0.23
194 0.23
195 0.22
196 0.27
197 0.26
198 0.3
199 0.27
200 0.29
201 0.32
202 0.32
203 0.31
204 0.28
205 0.29
206 0.27
207 0.3
208 0.3
209 0.29
210 0.28
211 0.29
212 0.28
213 0.27
214 0.32
215 0.29
216 0.29
217 0.28
218 0.3
219 0.38
220 0.46
221 0.47
222 0.43
223 0.5
224 0.55
225 0.59
226 0.64
227 0.58
228 0.58
229 0.59
230 0.61
231 0.57
232 0.56
233 0.56
234 0.5
235 0.5
236 0.4
237 0.38
238 0.31
239 0.26
240 0.2
241 0.14
242 0.19
243 0.15
244 0.16
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.09
251 0.11
252 0.1
253 0.12
254 0.15
255 0.18
256 0.2
257 0.26
258 0.35
259 0.42
260 0.52
261 0.6
262 0.64
263 0.71
264 0.73
265 0.77
266 0.77
267 0.75
268 0.71
269 0.67
270 0.65
271 0.61
272 0.62
273 0.6
274 0.56
275 0.5
276 0.54
277 0.56
278 0.6
279 0.61
280 0.57
281 0.49
282 0.47
283 0.46
284 0.38
285 0.36
286 0.27
287 0.21
288 0.19
289 0.19
290 0.17
291 0.15
292 0.14
293 0.1
294 0.11
295 0.15
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.19
300 0.22
301 0.25
302 0.29