Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MCQ5

Protein Details
Accession B8MCQ5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
406-425GCKPIPSKWVFKRKLSPDEGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, mito 4, pero 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR013103  RVT_2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003887  F:DNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003964  F:RNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0032196  P:transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF07727  RVT_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MKADSHPPVLERCSKSFNRVHADLIPLDGISLGGSKYMLLLVDDYTHYAWCYFASSKNVPAITPLLQGFINLVLTQFNAVIKSWRTNGGTGEFINSMVKEINHQYGILHQISTSGVKQQNGVLERRVQTIKNMERSMRAGAGVLDDYRLQAESLATSEHCSSSSDPRYRPAMIVGYIQDSKSIYKCLDLHTLQTSNHSEIKFDEDLFPGPWLKRPAGFKLSIAHKKNPPGSAVDTVLGQSVLGALPNISSVPFSSMNPFWLQQSQPPADPVNPEDPAKPVDPMELADVAQRALDSPQSLALRMDSQPIYNPRGSVVFGTCIKIHEHDTTRELMEAALIVQGMESLSCPPWQTAERIQTDHNGDPLSYSDALLQDPIRWPPAVQEELKSHEENRTWIVQEISQMPKGCKPIPSKWVFKRKLSPDEGIRYKARLVIKEFLQHFGVDFMETYTPTASLAAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.56
4 0.58
5 0.58
6 0.54
7 0.53
8 0.48
9 0.5
10 0.42
11 0.38
12 0.3
13 0.21
14 0.19
15 0.15
16 0.11
17 0.07
18 0.08
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.07
28 0.08
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.11
37 0.09
38 0.13
39 0.13
40 0.17
41 0.25
42 0.26
43 0.3
44 0.35
45 0.35
46 0.31
47 0.31
48 0.3
49 0.24
50 0.26
51 0.22
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.13
57 0.12
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.13
68 0.15
69 0.19
70 0.2
71 0.25
72 0.26
73 0.27
74 0.29
75 0.28
76 0.28
77 0.25
78 0.25
79 0.2
80 0.18
81 0.18
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.15
88 0.18
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.18
93 0.24
94 0.21
95 0.18
96 0.14
97 0.14
98 0.15
99 0.17
100 0.15
101 0.17
102 0.19
103 0.2
104 0.21
105 0.22
106 0.27
107 0.28
108 0.29
109 0.25
110 0.28
111 0.29
112 0.32
113 0.33
114 0.28
115 0.29
116 0.37
117 0.41
118 0.42
119 0.44
120 0.4
121 0.41
122 0.42
123 0.4
124 0.31
125 0.24
126 0.17
127 0.14
128 0.14
129 0.12
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.2
150 0.28
151 0.32
152 0.32
153 0.35
154 0.38
155 0.38
156 0.36
157 0.3
158 0.24
159 0.2
160 0.21
161 0.18
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.15
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.17
174 0.22
175 0.21
176 0.23
177 0.25
178 0.26
179 0.23
180 0.26
181 0.25
182 0.21
183 0.25
184 0.22
185 0.19
186 0.18
187 0.23
188 0.2
189 0.19
190 0.18
191 0.14
192 0.16
193 0.16
194 0.16
195 0.12
196 0.12
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.18
201 0.21
202 0.25
203 0.27
204 0.28
205 0.25
206 0.28
207 0.35
208 0.4
209 0.41
210 0.41
211 0.4
212 0.45
213 0.48
214 0.44
215 0.37
216 0.31
217 0.3
218 0.28
219 0.25
220 0.2
221 0.16
222 0.15
223 0.13
224 0.1
225 0.07
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.12
242 0.12
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.13
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.21
251 0.21
252 0.2
253 0.22
254 0.22
255 0.2
256 0.21
257 0.21
258 0.18
259 0.18
260 0.19
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.17
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.14
289 0.13
290 0.17
291 0.13
292 0.14
293 0.18
294 0.22
295 0.25
296 0.24
297 0.23
298 0.2
299 0.21
300 0.21
301 0.18
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.17
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.19
311 0.22
312 0.24
313 0.25
314 0.27
315 0.28
316 0.27
317 0.26
318 0.23
319 0.16
320 0.12
321 0.1
322 0.08
323 0.06
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.12
337 0.14
338 0.18
339 0.23
340 0.31
341 0.33
342 0.35
343 0.36
344 0.38
345 0.42
346 0.39
347 0.34
348 0.26
349 0.22
350 0.21
351 0.21
352 0.2
353 0.15
354 0.14
355 0.13
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.14
360 0.13
361 0.15
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.2
367 0.26
368 0.29
369 0.28
370 0.3
371 0.31
372 0.37
373 0.41
374 0.37
375 0.32
376 0.33
377 0.33
378 0.31
379 0.32
380 0.3
381 0.28
382 0.28
383 0.29
384 0.24
385 0.26
386 0.29
387 0.3
388 0.3
389 0.31
390 0.31
391 0.34
392 0.39
393 0.38
394 0.39
395 0.42
396 0.46
397 0.53
398 0.59
399 0.64
400 0.69
401 0.77
402 0.76
403 0.78
404 0.79
405 0.78
406 0.81
407 0.76
408 0.74
409 0.71
410 0.75
411 0.72
412 0.68
413 0.61
414 0.54
415 0.49
416 0.47
417 0.44
418 0.4
419 0.4
420 0.41
421 0.43
422 0.49
423 0.49
424 0.47
425 0.42
426 0.36
427 0.31
428 0.26
429 0.23
430 0.15
431 0.13
432 0.12
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.12
438 0.12