FuNGI

A0A2I1C1R5

Protein Details

Accession

A0A2I1C1R5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-39	TSAHKAPPMRFRRPKVADPLVRPKKR	Basic
98-121	DESQFTRPVRLQRRDPRAKTQEMN	Hydrophilic
384-403	RILGKKVRKALKKREKNYDY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-40	PMRFRRPKVADPLVRPKKRV
376-399	EKREREARRILGKKVRKALKKREK
452-474	PSGRPKHTEPLKKGPGAASRKRL
490-493	KKAK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, mito_nucl 12, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTLPASDANSQTHTSAHKAPPMRFRRPKVADPLVRPKKRVIARPAATSASSVVNGFSGPLMSETYVDYPIVITKRSLREGLKHHIARFASKKTIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRAKTQEMNQDKGQTQKLTPQSSHQLGDAEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSMGSAPKRANAPKQKTQQVSKTDMTPEEVARARIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFMPENGRMRMIPVEKWYKFGAKSQFRALTIEEAERFMAKKIKDPRWFMEKQQEQAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPAGADGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEETKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKEYEEEELREKREREARRILGKKVRKALKKREKNYDYSSGSDVNPYSDEESSDDSEAERLREEERKAEEDKNKKDSAPSTRGNVTPSGRPKHTEPLKKGPGAASRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKAKSKHPSSQLTPQPTSRALSPTAPPGQVGKKRIRNVAGGAASGGEMSESGKIKKLKLNPPAATSQGGTPQGSRAGSPTPIGSKGLGASRASSPESLRGQNRVSTPVPSVTLSFPTPAEIHAAIPQTGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGVLKDGQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.32
3	0.34
4	0.38
5	0.43
6	0.49
7	0.57
8	0.63
9	0.69
10	0.71
11	0.74
12	0.77
13	0.78
14	0.8
15	0.8
16	0.81
17	0.79
18	0.78
19	0.82
20	0.82
21	0.8
22	0.74
23	0.69
24	0.68
25	0.67
26	0.68
27	0.66
28	0.66
29	0.65
30	0.69
31	0.68
32	0.61
33	0.54
34	0.45
35	0.37
36	0.29
37	0.25
38	0.18
39	0.14
40	0.12
41	0.11
42	0.11
43	0.09
44	0.07
45	0.06
46	0.07
47	0.08
48	0.09
49	0.09
50	0.11
51	0.13
52	0.14
53	0.13
54	0.12
55	0.11
56	0.15
57	0.17
58	0.16
59	0.16
60	0.22
61	0.28
62	0.32
63	0.37
64	0.35
65	0.41
66	0.47
67	0.54
68	0.58
69	0.57
70	0.54
71	0.55
72	0.53
73	0.53
74	0.53
75	0.5
76	0.47
77	0.44
78	0.49
79	0.51
80	0.6
81	0.56
82	0.55
83	0.55
84	0.57
85	0.59
86	0.56
87	0.52
88	0.5
89	0.47
90	0.48
91	0.47
92	0.47
93	0.54
94	0.59
95	0.64
96	0.66
97	0.76
98	0.8
99	0.82
100	0.83
101	0.81
102	0.8
103	0.73
104	0.72
105	0.71
106	0.67
107	0.67
108	0.59
109	0.56
110	0.5
111	0.53
112	0.49
113	0.41
114	0.36
115	0.39
116	0.43
117	0.43
118	0.42
119	0.42
120	0.45
121	0.46
122	0.45
123	0.38
124	0.34
125	0.29
126	0.33
127	0.28
128	0.21
129	0.17
130	0.17
131	0.17
132	0.15
133	0.17
134	0.15
135	0.14
136	0.19
137	0.23
138	0.28
139	0.35
140	0.42
141	0.45
142	0.51
143	0.57
144	0.54
145	0.52
146	0.5
147	0.44
148	0.4
149	0.35
150	0.25
151	0.19
152	0.16
153	0.14
154	0.11
155	0.1
156	0.09
157	0.11
158	0.13
159	0.15
160	0.21
161	0.26
162	0.34
163	0.43
164	0.5
165	0.57
166	0.65
167	0.7
168	0.71
169	0.74
170	0.72
171	0.68
172	0.66
173	0.58
174	0.53
175	0.48
176	0.42
177	0.39
178	0.33
179	0.27
180	0.25
181	0.24
182	0.23
183	0.22
184	0.22
185	0.2
186	0.19
187	0.19
188	0.16
189	0.18
190	0.2
191	0.21
192	0.24
193	0.24
194	0.23
195	0.23
196	0.22
197	0.19
198	0.18
199	0.19
200	0.19
201	0.2
202	0.19
203	0.19
204	0.19
205	0.19
206	0.17
207	0.13
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.08
212	0.09
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.09
222	0.1
223	0.12
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.14
228	0.15
229	0.19
230	0.19
231	0.17
232	0.21
233	0.3
234	0.29
235	0.32
236	0.32
237	0.31
238	0.3
239	0.35
240	0.38
241	0.36
242	0.39
243	0.42
244	0.44
245	0.41
246	0.41
247	0.36
248	0.3
249	0.24
250	0.24
251	0.18
252	0.15
253	0.14
254	0.13
255	0.13
256	0.11
257	0.15
258	0.13
259	0.2
260	0.29
261	0.38
262	0.44
263	0.49
264	0.51
265	0.55
266	0.57
267	0.53
268	0.54
269	0.49
270	0.45
271	0.49
272	0.53
273	0.48
274	0.49
275	0.52
276	0.43
277	0.4
278	0.41
279	0.36
280	0.31
281	0.33
282	0.38
283	0.41
284	0.46
285	0.45
286	0.43
287	0.43
288	0.46
289	0.43
290	0.45
291	0.42
292	0.38
293	0.41
294	0.4
295	0.37
296	0.31
297	0.28
298	0.18
299	0.12
300	0.09
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.03
307	0.03
308	0.04
309	0.04
310	0.03
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.09
334	0.12
335	0.14
336	0.19
337	0.27
338	0.34
339	0.35
340	0.42
341	0.48
342	0.54
343	0.55
344	0.5
345	0.43
346	0.4
347	0.37
348	0.31
349	0.26
350	0.19
351	0.17
352	0.17
353	0.16
354	0.13
355	0.14
356	0.15
357	0.15
358	0.14
359	0.16
360	0.18
361	0.19
362	0.23
363	0.23
364	0.25
365	0.31
366	0.35
367	0.38
368	0.45
369	0.49
370	0.54
371	0.58
372	0.6
373	0.61
374	0.63
375	0.62
376	0.62
377	0.64
378	0.62
379	0.67
380	0.72
381	0.74
382	0.78
383	0.79
384	0.81
385	0.78
386	0.76
387	0.73
388	0.71
389	0.62
390	0.54
391	0.49
392	0.4
393	0.36
394	0.31
395	0.25
396	0.17
397	0.15
398	0.13
399	0.13
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.13
404	0.14
405	0.13
406	0.13
407	0.11
408	0.12
409	0.12
410	0.12
411	0.09
412	0.09
413	0.11
414	0.17
415	0.18
416	0.21
417	0.24
418	0.27
419	0.3
420	0.37
421	0.42
422	0.46
423	0.52
424	0.53
425	0.51
426	0.48
427	0.48
428	0.47
429	0.48
430	0.46
431	0.42
432	0.4
433	0.42
434	0.43
435	0.41
436	0.39
437	0.33
438	0.32
439	0.37
440	0.39
441	0.37
442	0.39
443	0.4
444	0.46
445	0.52
446	0.55
447	0.54
448	0.58
449	0.64
450	0.62
451	0.6
452	0.54
453	0.54
454	0.54
455	0.54
456	0.5
457	0.48
458	0.49
459	0.49
460	0.49
461	0.45
462	0.44
463	0.41
464	0.41
465	0.39
466	0.36
467	0.34
468	0.3
469	0.31
470	0.25
471	0.21
472	0.2
473	0.21
474	0.24
475	0.3
476	0.34
477	0.34
478	0.42
479	0.52
480	0.58
481	0.64
482	0.72
483	0.76
484	0.8
485	0.79
486	0.79
487	0.76
488	0.73
489	0.66
490	0.58
491	0.52
492	0.46
493	0.43
494	0.35
495	0.31
496	0.25
497	0.25
498	0.25
499	0.28
500	0.3
501	0.28
502	0.27
503	0.28
504	0.34
505	0.37
506	0.42
507	0.44
508	0.49
509	0.54
510	0.6
511	0.59
512	0.54
513	0.51
514	0.53
515	0.44
516	0.36
517	0.3
518	0.24
519	0.2
520	0.16
521	0.13
522	0.05
523	0.04
524	0.04
525	0.08
526	0.1
527	0.11
528	0.17
529	0.2
530	0.24
531	0.3
532	0.39
533	0.44
534	0.52
535	0.61
536	0.58
537	0.6
538	0.61
539	0.56
540	0.49
541	0.41
542	0.33
543	0.29
544	0.29
545	0.25
546	0.22
547	0.21
548	0.23
549	0.22
550	0.21
551	0.17
552	0.18
553	0.18
554	0.19
555	0.2
556	0.19
557	0.2
558	0.21
559	0.19
560	0.17
561	0.19
562	0.21
563	0.21
564	0.19
565	0.2
566	0.21
567	0.23
568	0.24
569	0.23
570	0.21
571	0.25
572	0.29
573	0.34
574	0.35
575	0.37
576	0.38
577	0.41
578	0.42
579	0.41
580	0.38
581	0.34
582	0.34
583	0.31
584	0.31
585	0.27
586	0.27
587	0.23
588	0.25
589	0.23
590	0.21
591	0.18
592	0.19
593	0.18
594	0.17
595	0.19
596	0.16
597	0.16
598	0.19
599	0.21
600	0.18
601	0.18
602	0.17
603	0.13
604	0.13
605	0.13
606	0.09
607	0.08
608	0.09
609	0.14
610	0.16
611	0.16
612	0.18
613	0.22
614	0.25
615	0.26
616	0.29
617	0.28
618	0.36
619	0.43
620	0.47
621	0.47
622	0.56
623	0.64
624	0.64
625	0.63
626	0.55
627	0.49
628	0.44
629	0.47
630	0.45
631	0.38
632	0.36
633	0.35
634	0.35
635	0.34
636	0.33
637	0.25
638	0.19
639	0.18
640	0.19
641	0.21
642	0.22
643	0.23
644	0.27
645	0.29
646	0.28
647	0.32
648	0.32
649	0.34

A0A2I1C1R5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer