FuNGI

B8LZJ7

Protein Details

Accession

B8LZJ7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-34	FDTLRREKLFRNPPKDRSAYP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 14, nucl 5, pero 3, mito 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007121 RNA_pol_bsu_CS IPR007644 RNA_pol_bsu_protrusion IPR007642 RNA_pol_Rpb2_2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7 IPR014724 RNA_pol_RPB2_OB-fold IPR009674 Rpa2_dom_4
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06883 RNA_pol_Rpa2_4 PF04563 RNA_pol_Rpb2_1 PF04561 RNA_pol_Rpb2_2 PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA
CDD	cd00653 RNA_pol_B_RPB2

Amino Acid Sequences

MAPEPTNTDWTVGFDTLRREKLFRNPPKDRSAYPMLQAAIRPHIDSFNALFGESKIMEHALEDMGIKVFLDGDAETPEQRSARKARGEAPPVRNRLSLRITELFLDKAVLPPTNKFVPRQTTANADYRNIYPAECRERHATYRGRLRARLQYQVNNGEWHESVRELGQVPLMLRSNRCHLESFSPQQLVDHKEESEELGGYFIVNGNEKLIRMLIMPKRNFPMAINRPSFQKRGAGFTTFGVQIRSARPDQTTQTNVLHYLSDGNVTFRFSWRKQEYLVPVMMILKALVETNDREIFEGIVGNASTKGPANTFVTDRVELLLRTFKGYKIYSRSDARAYLGKKFRPVLFAPATWTHEECGAEFLRKIVLPHLGNQNVTTTQDYDKFKLMLFMIRKLYAFVAGDCAADNPDAISNQEVMLGGYVYGMLLKERLEEWLLSFGRLVRDWSYRGGNLKFTDPSFEKDFIGKVIKRTNENIGGALEYFLSTGNLVSPTGLDMQQASGFTVVAEKINFYRFIAHFRMVHRGTFFAQLKTTAVRKLLPESWGFMCPVHTPDGSPCGLLNHLAHKCLIATSDLDVSHIPRVLAQLGIKSEASAEVTESVCVQLNGRVVGYCSPKQAKMIHDTLRFWKVEGSHDIPKELEIGYVPTSNGGQYPGIYMSSQPARMYRPVKYLALDKLDYVGPFEQPFMEIACLEEDIRSGLSTHIEFTPTNILSIIANMTPFSDNNQSPRNMYQCQMSKQTMGTPGTSFAYRTDNKLYRLQTGQTPIVRPPLYNAYGLDNFPNGANAVVAILAYTGYDMDDAMVINKSSHERGFGHGTIYKTKFYNLDDKDSRRNKSKREISKLFGFAPGSEIKAEYRATLDEDGLPHPGAKIKEGSYVAAWYTVRYDAGSDSYINVDGITHFLKYKDAEEGYIDTVRLVGNENGNEPLQAISVKFRVPRRPIIGDKFSSRHGQKGVCSQLWPQIDMPFSESGIQPDLIINPHAFPSRMTIAQIIESMAGKAGALHGHPQDSTPFQFSEENTAADYFGHQLRKAGYNYHGNEPMYSGITGKEFAADIYLGVVHYQRLRHMVNDKFQVRTTGPVNSVTGQPVKGRSKGGGIRVGEMERDSLLAHGCAFLLQDRLMNCSDSQRAWICRDCGSFLSTQVAVSSNSSSGTQATGASEVSKAALAAAAKATPNNQTITANLSRISAVNALGGTNGIVRCRRCAREAVFDDSRAMIWEDGDGNRFVGGDNVTVVVVPGVLRYLDVELAAMGIRLKFKVDH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.27
3	0.33
4	0.39
5	0.38
6	0.37
7	0.41
8	0.51
9	0.59
10	0.62
11	0.65
12	0.69
13	0.74
14	0.8
15	0.8
16	0.72
17	0.69
18	0.67
19	0.61
20	0.54
21	0.52
22	0.44
23	0.41
24	0.41
25	0.36
26	0.34
27	0.31
28	0.29
29	0.26
30	0.27
31	0.25
32	0.26
33	0.24
34	0.22
35	0.21
36	0.2
37	0.19
38	0.18
39	0.21
40	0.19
41	0.17
42	0.13
43	0.14
44	0.14
45	0.13
46	0.14
47	0.1
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.09
54	0.08
55	0.07
56	0.07
57	0.08
58	0.07
59	0.07
60	0.11
61	0.12
62	0.13
63	0.14
64	0.17
65	0.18
66	0.19
67	0.25
68	0.29
69	0.36
70	0.43
71	0.45
72	0.49
73	0.58
74	0.65
75	0.68
76	0.71
77	0.72
78	0.7
79	0.7
80	0.67
81	0.59
82	0.58
83	0.54
84	0.47
85	0.45
86	0.43
87	0.41
88	0.39
89	0.39
90	0.32
91	0.26
92	0.25
93	0.18
94	0.18
95	0.19
96	0.2
97	0.2
98	0.22
99	0.27
100	0.33
101	0.35
102	0.35
103	0.4
104	0.44
105	0.47
106	0.49
107	0.46
108	0.46
109	0.49
110	0.53
111	0.48
112	0.42
113	0.4
114	0.37
115	0.38
116	0.31
117	0.26
118	0.22
119	0.28
120	0.36
121	0.34
122	0.37
123	0.4
124	0.45
125	0.48
126	0.53
127	0.53
128	0.52
129	0.61
130	0.65
131	0.65
132	0.65
133	0.67
134	0.69
135	0.65
136	0.66
137	0.62
138	0.61
139	0.62
140	0.64
141	0.6
142	0.52
143	0.48
144	0.42
145	0.36
146	0.3
147	0.24
148	0.17
149	0.16
150	0.14
151	0.16
152	0.14
153	0.14
154	0.14
155	0.15
156	0.15
157	0.18
158	0.21
159	0.21
160	0.23
161	0.26
162	0.31
163	0.33
164	0.35
165	0.33
166	0.32
167	0.37
168	0.43
169	0.46
170	0.45
171	0.43
172	0.4
173	0.4
174	0.42
175	0.4
176	0.36
177	0.32
178	0.26
179	0.25
180	0.26
181	0.25
182	0.21
183	0.16
184	0.12
185	0.1
186	0.1
187	0.09
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.12
198	0.11
199	0.11
200	0.19
201	0.24
202	0.32
203	0.34
204	0.38
205	0.41
206	0.42
207	0.42
208	0.35
209	0.39
210	0.39
211	0.47
212	0.46
213	0.44
214	0.49
215	0.53
216	0.53
217	0.44
218	0.42
219	0.35
220	0.38
221	0.4
222	0.36
223	0.33
224	0.31
225	0.33
226	0.27
227	0.26
228	0.2
229	0.18
230	0.18
231	0.2
232	0.24
233	0.22
234	0.23
235	0.25
236	0.28
237	0.31
238	0.35
239	0.35
240	0.34
241	0.35
242	0.33
243	0.32
244	0.29
245	0.25
246	0.18
247	0.16
248	0.13
249	0.13
250	0.12
251	0.13
252	0.13
253	0.15
254	0.15
255	0.18
256	0.25
257	0.24
258	0.34
259	0.36
260	0.38
261	0.38
262	0.45
263	0.46
264	0.44
265	0.43
266	0.33
267	0.29
268	0.27
269	0.25
270	0.18
271	0.12
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.09
278	0.13
279	0.16
280	0.16
281	0.17
282	0.17
283	0.16
284	0.15
285	0.15
286	0.1
287	0.09
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.12
297	0.14
298	0.16
299	0.17
300	0.2
301	0.23
302	0.22
303	0.22
304	0.2
305	0.18
306	0.16
307	0.16
308	0.19
309	0.16
310	0.19
311	0.2
312	0.2
313	0.24
314	0.26
315	0.3
316	0.31
317	0.36
318	0.39
319	0.43
320	0.45
321	0.41
322	0.41
323	0.38
324	0.37
325	0.34
326	0.36
327	0.39
328	0.38
329	0.4
330	0.43
331	0.42
332	0.41
333	0.4
334	0.4
335	0.36
336	0.34
337	0.34
338	0.34
339	0.35
340	0.32
341	0.3
342	0.23
343	0.22
344	0.21
345	0.17
346	0.17
347	0.15
348	0.15
349	0.14
350	0.14
351	0.13
352	0.14
353	0.14
354	0.12
355	0.18
356	0.18
357	0.22
358	0.3
359	0.3
360	0.3
361	0.3
362	0.29
363	0.23
364	0.24
365	0.21
366	0.15
367	0.15
368	0.21
369	0.24
370	0.24
371	0.25
372	0.24
373	0.23
374	0.24
375	0.23
376	0.22
377	0.22
378	0.25
379	0.25
380	0.25
381	0.25
382	0.23
383	0.23
384	0.19
385	0.17
386	0.12
387	0.13
388	0.12
389	0.12
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.09
394	0.09
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.04
415	0.04
416	0.05
417	0.06
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.16
423	0.16
424	0.15
425	0.15
426	0.16
427	0.16
428	0.17
429	0.18
430	0.13
431	0.16
432	0.17
433	0.2
434	0.21
435	0.21
436	0.26
437	0.25
438	0.26
439	0.25
440	0.26
441	0.25
442	0.23
443	0.26
444	0.23
445	0.26
446	0.26
447	0.25
448	0.23
449	0.23
450	0.23
451	0.2
452	0.25
453	0.22
454	0.22
455	0.27
456	0.29
457	0.31
458	0.33
459	0.36
460	0.34
461	0.33
462	0.29
463	0.24
464	0.21
465	0.19
466	0.16
467	0.11
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.04
473	0.04
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.09
498	0.1
499	0.09
500	0.14
501	0.14
502	0.19
503	0.21
504	0.23
505	0.24
506	0.25
507	0.33
508	0.28
509	0.29
510	0.24
511	0.23
512	0.22
513	0.27
514	0.27
515	0.2
516	0.2
517	0.19
518	0.19
519	0.2
520	0.21
521	0.15
522	0.14
523	0.15
524	0.16
525	0.19
526	0.21
527	0.2
528	0.19
529	0.2
530	0.21
531	0.2
532	0.2
533	0.15
534	0.14
535	0.13
536	0.14
537	0.14
538	0.12
539	0.11
540	0.12
541	0.15
542	0.14
543	0.13
544	0.12
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.11
549	0.14
550	0.15
551	0.15
552	0.15
553	0.14
554	0.14
555	0.13
556	0.13
557	0.07
558	0.06
559	0.07
560	0.09
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.08
569	0.09
570	0.08
571	0.09
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.1
576	0.09
577	0.09
578	0.08
579	0.07
580	0.08
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.11
598	0.15
599	0.14
600	0.17
601	0.19
602	0.19
603	0.22
604	0.25
605	0.24
606	0.25
607	0.3
608	0.32
609	0.33
610	0.34
611	0.35
612	0.35
613	0.33
614	0.27
615	0.24
616	0.19
617	0.2
618	0.22
619	0.23
620	0.24
621	0.24
622	0.25
623	0.23
624	0.22
625	0.2
626	0.15
627	0.11
628	0.06
629	0.07
630	0.07
631	0.08
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.06
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.07
643	0.07
644	0.06
645	0.08
646	0.1
647	0.11
648	0.1
649	0.11
650	0.13
651	0.19
652	0.21
653	0.21
654	0.24
655	0.26
656	0.26
657	0.26
658	0.28
659	0.25
660	0.26
661	0.24
662	0.19
663	0.18
664	0.18
665	0.16
666	0.14
667	0.12
668	0.09
669	0.09
670	0.09
671	0.08
672	0.07
673	0.08
674	0.07
675	0.06
676	0.05
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.06
689	0.07
690	0.08
691	0.08
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.15
696	0.14
697	0.14
698	0.12
699	0.12
700	0.1
701	0.11
702	0.11
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.09
710	0.13
711	0.14
712	0.18
713	0.22
714	0.22
715	0.23
716	0.26
717	0.28
718	0.24
719	0.24
720	0.27
721	0.28
722	0.31
723	0.34
724	0.32
725	0.29
726	0.28
727	0.3
728	0.28
729	0.25
730	0.22
731	0.17
732	0.18
733	0.18
734	0.17
735	0.15
736	0.11
737	0.17
738	0.16
739	0.19
740	0.25
741	0.28
742	0.31
743	0.37
744	0.37
745	0.34
746	0.35
747	0.34
748	0.29
749	0.3
750	0.31
751	0.27
752	0.27
753	0.25
754	0.29
755	0.28
756	0.24
757	0.23
758	0.25
759	0.24
760	0.23
761	0.23
762	0.21
763	0.22
764	0.22
765	0.2
766	0.14
767	0.13
768	0.12
769	0.12
770	0.07
771	0.06
772	0.05
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.03
777	0.03
778	0.03
779	0.03
780	0.03
781	0.03
782	0.02
783	0.03
784	0.03
785	0.03
786	0.03
787	0.03
788	0.04
789	0.04
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.07
794	0.09
795	0.1
796	0.11
797	0.13
798	0.13
799	0.17
800	0.22
801	0.21
802	0.22
803	0.23
804	0.25
805	0.29
806	0.3
807	0.29
808	0.24
809	0.25
810	0.25
811	0.24
812	0.32
813	0.28
814	0.35
815	0.38
816	0.42
817	0.5
818	0.54
819	0.56
820	0.57
821	0.6
822	0.58
823	0.63
824	0.69
825	0.69
826	0.73
827	0.74
828	0.69
829	0.7
830	0.66
831	0.57
832	0.5
833	0.4
834	0.3
835	0.27
836	0.23
837	0.17
838	0.14
839	0.13
840	0.11
841	0.13
842	0.13
843	0.1
844	0.11
845	0.11
846	0.13
847	0.13
848	0.13
849	0.12
850	0.13
851	0.14
852	0.14
853	0.13
854	0.11
855	0.1
856	0.14
857	0.13
858	0.13
859	0.15
860	0.15
861	0.2
862	0.2
863	0.21
864	0.18
865	0.18
866	0.16
867	0.17
868	0.16
869	0.11
870	0.12
871	0.11
872	0.11
873	0.1
874	0.1
875	0.08
876	0.1
877	0.11
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.11
882	0.1
883	0.09
884	0.07
885	0.06
886	0.08
887	0.08
888	0.08
889	0.08
890	0.09
891	0.11
892	0.12
893	0.13
894	0.16
895	0.16
896	0.16
897	0.17
898	0.19
899	0.19
900	0.19
901	0.17
902	0.12
903	0.12
904	0.11
905	0.1
906	0.11
907	0.1
908	0.12
909	0.13
910	0.14
911	0.16
912	0.16
913	0.15
914	0.13
915	0.11
916	0.09
917	0.09
918	0.08
919	0.1
920	0.11
921	0.14
922	0.18
923	0.24
924	0.32
925	0.37
926	0.44
927	0.48
928	0.54
929	0.58
930	0.61
931	0.63
932	0.58
933	0.58
934	0.52
935	0.48
936	0.48
937	0.42
938	0.39
939	0.37
940	0.36
941	0.34
942	0.41
943	0.45
944	0.38
945	0.38
946	0.35
947	0.38
948	0.36
949	0.35
950	0.28
951	0.24
952	0.24
953	0.22
954	0.24
955	0.17
956	0.16
957	0.16
958	0.15
959	0.14
960	0.15
961	0.14
962	0.11
963	0.11
964	0.12
965	0.12
966	0.13
967	0.11
968	0.1
969	0.12
970	0.13
971	0.13
972	0.12
973	0.16
974	0.19
975	0.19
976	0.19
977	0.19
978	0.18
979	0.19
980	0.19
981	0.14
982	0.12
983	0.11
984	0.1
985	0.08
986	0.07
987	0.06
988	0.06
989	0.06
990	0.07
991	0.07
992	0.11
993	0.12
994	0.14
995	0.14
996	0.15
997	0.17
998	0.19
999	0.21
1000	0.2
1001	0.18
1002	0.2
1003	0.22
1004	0.22
1005	0.27
1006	0.25
1007	0.23
1008	0.21
1009	0.21
1010	0.19
1011	0.16
1012	0.17
1013	0.11
1014	0.14
1015	0.17
1016	0.16
1017	0.18
1018	0.21
1019	0.27
1020	0.27
1021	0.29
1022	0.3
1023	0.36
1024	0.39
1025	0.43
1026	0.45
1027	0.4
1028	0.39
1029	0.36
1030	0.32
1031	0.25
1032	0.21
1033	0.16
1034	0.12
1035	0.12
1036	0.13
1037	0.11
1038	0.11
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.1
1042	0.08
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.06
1047	0.07
1048	0.08
1049	0.08
1050	0.11
1051	0.12
1052	0.14
1053	0.19
1054	0.21
1055	0.25
1056	0.33
1057	0.38
1058	0.42
1059	0.5
1060	0.5
1061	0.48
1062	0.47
1063	0.47
1064	0.4
1065	0.38
1066	0.34
1067	0.3
1068	0.29
1069	0.29
1070	0.3
1071	0.27
1072	0.27
1073	0.26
1074	0.26
1075	0.22
1076	0.23
1077	0.29
1078	0.32
1079	0.33
1080	0.34
1081	0.32
1082	0.37
1083	0.41
1084	0.44
1085	0.43
1086	0.39
1087	0.39
1088	0.4
1089	0.39
1090	0.32
1091	0.27
1092	0.22
1093	0.15
1094	0.15
1095	0.12
1096	0.1
1097	0.1
1098	0.09
1099	0.09
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.08
1104	0.09
1105	0.1
1106	0.1
1107	0.12
1108	0.13
1109	0.16
1110	0.17
1111	0.18
1112	0.17
1113	0.2
1114	0.23
1115	0.21
1116	0.26
1117	0.28
1118	0.32
1119	0.35
1120	0.4
1121	0.37
1122	0.39
1123	0.41
1124	0.39
1125	0.34
1126	0.33
1127	0.29
1128	0.25
1129	0.27
1130	0.21
1131	0.19
1132	0.17
1133	0.17
1134	0.15
1135	0.16
1136	0.16
1137	0.12
1138	0.13
1139	0.14
1140	0.13
1141	0.12
1142	0.13
1143	0.11
1144	0.1
1145	0.11
1146	0.11
1147	0.11
1148	0.11
1149	0.11
1150	0.1
1151	0.1
1152	0.09
1153	0.08
1154	0.07
1155	0.09
1156	0.08
1157	0.09
1158	0.1
1159	0.11
1160	0.12
1161	0.13
1162	0.15
1163	0.18
1164	0.2
1165	0.21
1166	0.22
1167	0.21
1168	0.21
1169	0.27
1170	0.28
1171	0.25
1172	0.23
1173	0.22
1174	0.21
1175	0.2
1176	0.22
1177	0.16
1178	0.13
1179	0.14
1180	0.13
1181	0.12
1182	0.11
1183	0.11
1184	0.09
1185	0.11
1186	0.12
1187	0.14
1188	0.19
1189	0.2
1190	0.28
1191	0.36
1192	0.4
1193	0.4
1194	0.48
1195	0.5
1196	0.56
1197	0.59
1198	0.6
1199	0.56
1200	0.53
1201	0.51
1202	0.42
1203	0.37
1204	0.28
1205	0.25
1206	0.17
1207	0.13
1208	0.14
1209	0.15
1210	0.16
1211	0.18
1212	0.17
1213	0.15
1214	0.15
1215	0.15
1216	0.13
1217	0.13
1218	0.13
1219	0.11
1220	0.11
1221	0.11
1222	0.11
1223	0.11
1224	0.11
1225	0.08
1226	0.07
1227	0.06
1228	0.05
1229	0.06
1230	0.06
1231	0.06
1232	0.07
1233	0.09
1234	0.09
1235	0.09
1236	0.09
1237	0.08
1238	0.08
1239	0.08
1240	0.08
1241	0.07
1242	0.09
1243	0.11
1244	0.11

B8LZJ7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer