Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1C394

Protein Details
Accession A0A2I1C394    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-219AYIKGKEEKAKREKQRKEKNVLEVDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-212KGKEEKAKREKQRKEK
225-252PRGGSAGRGRGGRGGRGGRGGRGNGAPR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKVCNDPELDPNREPEPPTRAVDRPVPRHGKRDAPKEPATQPNLHENNARRGGRFTGNEAAFRDRQAGSRSNREKPLDEGKEPQRRAFHARGDRGERYRNDRQSRTGQVDTRKQVNQGWGAQTGDKAGDKAWDDERAAENLAQNESEPQTPANEEPAEPAEKTKTYADNLDKKWANAKELKRTPEEEEAYIKGKEEKAKREKQRKEKNVLEVDMRFVESPRGGSAGRGRGGRGGRGGRGGRGNGAPRGGEQQQRGAAPVTVDEKNFPTLGAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.46
3 0.46
4 0.43
5 0.43
6 0.41
7 0.38
8 0.37
9 0.36
10 0.38
11 0.4
12 0.4
13 0.41
14 0.48
15 0.51
16 0.52
17 0.57
18 0.63
19 0.61
20 0.65
21 0.66
22 0.67
23 0.66
24 0.7
25 0.68
26 0.66
27 0.68
28 0.68
29 0.69
30 0.68
31 0.65
32 0.58
33 0.52
34 0.55
35 0.52
36 0.48
37 0.47
38 0.43
39 0.47
40 0.52
41 0.5
42 0.41
43 0.41
44 0.43
45 0.43
46 0.41
47 0.36
48 0.36
49 0.36
50 0.37
51 0.36
52 0.37
53 0.31
54 0.3
55 0.29
56 0.21
57 0.23
58 0.25
59 0.3
60 0.3
61 0.4
62 0.46
63 0.49
64 0.55
65 0.54
66 0.52
67 0.5
68 0.55
69 0.5
70 0.47
71 0.48
72 0.5
73 0.57
74 0.56
75 0.55
76 0.48
77 0.46
78 0.5
79 0.48
80 0.47
81 0.47
82 0.51
83 0.53
84 0.55
85 0.57
86 0.54
87 0.56
88 0.5
89 0.5
90 0.53
91 0.57
92 0.58
93 0.55
94 0.57
95 0.57
96 0.59
97 0.57
98 0.53
99 0.48
100 0.47
101 0.52
102 0.5
103 0.48
104 0.43
105 0.39
106 0.37
107 0.36
108 0.33
109 0.28
110 0.26
111 0.23
112 0.22
113 0.21
114 0.18
115 0.15
116 0.12
117 0.09
118 0.08
119 0.06
120 0.08
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.16
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.1
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.22
159 0.28
160 0.35
161 0.36
162 0.42
163 0.4
164 0.38
165 0.45
166 0.4
167 0.38
168 0.37
169 0.41
170 0.43
171 0.48
172 0.52
173 0.48
174 0.49
175 0.49
176 0.49
177 0.46
178 0.38
179 0.34
180 0.33
181 0.32
182 0.29
183 0.25
184 0.2
185 0.21
186 0.27
187 0.3
188 0.38
189 0.45
190 0.55
191 0.65
192 0.73
193 0.8
194 0.84
195 0.89
196 0.88
197 0.88
198 0.85
199 0.85
200 0.81
201 0.73
202 0.67
203 0.57
204 0.5
205 0.42
206 0.35
207 0.26
208 0.19
209 0.19
210 0.15
211 0.15
212 0.13
213 0.14
214 0.13
215 0.16
216 0.22
217 0.25
218 0.28
219 0.28
220 0.28
221 0.31
222 0.33
223 0.33
224 0.34
225 0.31
226 0.29
227 0.36
228 0.37
229 0.35
230 0.39
231 0.37
232 0.34
233 0.35
234 0.38
235 0.33
236 0.34
237 0.3
238 0.26
239 0.31
240 0.32
241 0.33
242 0.31
243 0.34
244 0.37
245 0.37
246 0.37
247 0.32
248 0.29
249 0.23
250 0.24
251 0.23
252 0.21
253 0.22
254 0.23
255 0.23
256 0.25
257 0.24