Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1CKU0

Protein Details
Accession A0A2I1CKU0    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-110AASRRKTATRGGRQKRMKEQLTNHydrophilic
125-151KHNGCTPKKGPGSKKKRTDAANKRTKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-103SRRKTATRGGRQKR
132-150KKGPGSKKKRTDAANKRTK
299-315SSKAPAAEGKPKKRSRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MYTATDIVVLSSSPDQIPSRSLAEPKCDPEKVFVLSPVFSSPSPLPSPSELFQPPTRSRFFKTGDGNDGSSRTAKEVSETGTKPKDLAASRRKTATRGGRQKRMKEQLTNESQTLFDYSEPPIPKHNGCTPKKGPGSKKKRTDAANKRTKSENKTITGKVAKSGITETTQSEDKIKELVTSDVSPGKSPANKLELEKDGLQLEVAMKRRLDWTPTKDTGKQAVALDDTGDNKSRFGDLLSEYGFLEAATDSQGDLKLSDDGAPTKRRRLELVDTRNPSNSKRTSPDADSNRSNVRSTRSSKAPAAEGKPKKRSRKITTLTGRVTALYTNDCTDHSDAANTMIRASEDVSNKLFSKSLDIDSCVLPPEDAVDYLKDQDLMFGTCSQLEREDSPTMLRDMQKAILASENSMLENRKPSSTTRAGSGLYSHTAVSRFQTPRDLWSVAARDVDGSLAEIEVLDMVDITDLSELPPKPNGELPDRSGKKDEDTVPQGEPFRPVEITDEVEATVDVHTENLATSETKPGETGCGASEIRPMPRFADWKDSDLSKEIRLYGFKTMKSRRKMIEVLERCWKAQHVSTRTGVQDVPGKPDDGSTGEACTIQSQTNKQASKTDAAEKTRKQSACLKEEAKSSTALEDKPSHAADGSSQVLTKSSFADVEEIEDSEDEVIPSPSRLQSRYKRHISESRSSQPLPVAATPSTPSSPTRTNADSGAKPSPSGLAGESSLPDLASQITKAVRLQPRSFSVDCKRPSWHEKILMYDPIILEDFATWLNIEGLGLIHEDREVSAEFVRQWCESNGICCGFRKNSRRSER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.18
4 0.2
5 0.21
6 0.24
7 0.26
8 0.32
9 0.32
10 0.38
11 0.42
12 0.46
13 0.5
14 0.49
15 0.46
16 0.45
17 0.46
18 0.43
19 0.4
20 0.38
21 0.34
22 0.31
23 0.31
24 0.28
25 0.26
26 0.21
27 0.24
28 0.21
29 0.24
30 0.26
31 0.27
32 0.28
33 0.29
34 0.34
35 0.3
36 0.36
37 0.32
38 0.35
39 0.39
40 0.43
41 0.46
42 0.47
43 0.52
44 0.49
45 0.52
46 0.55
47 0.55
48 0.55
49 0.58
50 0.58
51 0.6
52 0.59
53 0.56
54 0.5
55 0.46
56 0.4
57 0.33
58 0.28
59 0.23
60 0.21
61 0.19
62 0.2
63 0.21
64 0.24
65 0.29
66 0.3
67 0.35
68 0.38
69 0.38
70 0.35
71 0.35
72 0.37
73 0.34
74 0.43
75 0.46
76 0.49
77 0.53
78 0.6
79 0.6
80 0.55
81 0.59
82 0.6
83 0.61
84 0.64
85 0.69
86 0.72
87 0.79
88 0.86
89 0.87
90 0.86
91 0.82
92 0.8
93 0.78
94 0.77
95 0.78
96 0.73
97 0.63
98 0.54
99 0.46
100 0.38
101 0.33
102 0.23
103 0.15
104 0.13
105 0.15
106 0.2
107 0.22
108 0.23
109 0.27
110 0.31
111 0.32
112 0.37
113 0.43
114 0.47
115 0.49
116 0.57
117 0.56
118 0.61
119 0.67
120 0.7
121 0.71
122 0.72
123 0.79
124 0.79
125 0.85
126 0.82
127 0.81
128 0.81
129 0.82
130 0.82
131 0.82
132 0.82
133 0.75
134 0.71
135 0.73
136 0.72
137 0.69
138 0.68
139 0.65
140 0.61
141 0.65
142 0.63
143 0.62
144 0.61
145 0.54
146 0.46
147 0.41
148 0.35
149 0.29
150 0.3
151 0.24
152 0.2
153 0.21
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.2
158 0.21
159 0.19
160 0.18
161 0.18
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.19
169 0.21
170 0.22
171 0.2
172 0.2
173 0.23
174 0.23
175 0.24
176 0.27
177 0.27
178 0.28
179 0.3
180 0.34
181 0.33
182 0.34
183 0.33
184 0.29
185 0.25
186 0.23
187 0.2
188 0.15
189 0.14
190 0.15
191 0.17
192 0.18
193 0.17
194 0.18
195 0.22
196 0.23
197 0.27
198 0.31
199 0.35
200 0.41
201 0.47
202 0.5
203 0.5
204 0.52
205 0.52
206 0.45
207 0.42
208 0.34
209 0.3
210 0.26
211 0.23
212 0.2
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.17
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.14
224 0.12
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.1
232 0.09
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.12
248 0.16
249 0.24
250 0.25
251 0.31
252 0.35
253 0.35
254 0.37
255 0.4
256 0.46
257 0.48
258 0.56
259 0.58
260 0.57
261 0.57
262 0.59
263 0.54
264 0.47
265 0.44
266 0.38
267 0.35
268 0.35
269 0.39
270 0.4
271 0.43
272 0.5
273 0.49
274 0.5
275 0.48
276 0.47
277 0.46
278 0.43
279 0.39
280 0.32
281 0.31
282 0.33
283 0.35
284 0.38
285 0.38
286 0.4
287 0.42
288 0.41
289 0.4
290 0.39
291 0.39
292 0.43
293 0.46
294 0.5
295 0.58
296 0.64
297 0.69
298 0.73
299 0.78
300 0.76
301 0.79
302 0.77
303 0.77
304 0.78
305 0.76
306 0.68
307 0.6
308 0.52
309 0.41
310 0.36
311 0.26
312 0.19
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.12
325 0.14
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.13
333 0.12
334 0.14
335 0.15
336 0.17
337 0.17
338 0.18
339 0.17
340 0.12
341 0.15
342 0.15
343 0.17
344 0.16
345 0.17
346 0.18
347 0.17
348 0.18
349 0.14
350 0.12
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.13
376 0.13
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.15
382 0.15
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.13
388 0.13
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.08
398 0.12
399 0.13
400 0.12
401 0.13
402 0.15
403 0.21
404 0.26
405 0.25
406 0.23
407 0.24
408 0.24
409 0.23
410 0.23
411 0.16
412 0.12
413 0.12
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.16
420 0.16
421 0.17
422 0.22
423 0.21
424 0.23
425 0.27
426 0.26
427 0.19
428 0.22
429 0.23
430 0.19
431 0.19
432 0.16
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.07
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.02
449 0.02
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.13
458 0.13
459 0.14
460 0.17
461 0.2
462 0.21
463 0.23
464 0.26
465 0.33
466 0.35
467 0.36
468 0.36
469 0.33
470 0.3
471 0.33
472 0.33
473 0.29
474 0.31
475 0.31
476 0.29
477 0.31
478 0.31
479 0.25
480 0.25
481 0.2
482 0.17
483 0.15
484 0.14
485 0.15
486 0.15
487 0.16
488 0.14
489 0.13
490 0.12
491 0.11
492 0.11
493 0.08
494 0.07
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.11
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.13
511 0.12
512 0.12
513 0.08
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.16
518 0.16
519 0.19
520 0.2
521 0.2
522 0.18
523 0.22
524 0.25
525 0.22
526 0.31
527 0.29
528 0.3
529 0.31
530 0.31
531 0.28
532 0.29
533 0.28
534 0.2
535 0.2
536 0.19
537 0.19
538 0.19
539 0.2
540 0.25
541 0.27
542 0.28
543 0.35
544 0.43
545 0.5
546 0.54
547 0.59
548 0.53
549 0.56
550 0.57
551 0.54
552 0.56
553 0.52
554 0.5
555 0.53
556 0.51
557 0.45
558 0.42
559 0.37
560 0.29
561 0.29
562 0.35
563 0.31
564 0.34
565 0.36
566 0.39
567 0.38
568 0.37
569 0.32
570 0.25
571 0.27
572 0.24
573 0.27
574 0.24
575 0.25
576 0.23
577 0.23
578 0.23
579 0.17
580 0.19
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.13
587 0.12
588 0.12
589 0.15
590 0.17
591 0.24
592 0.31
593 0.33
594 0.33
595 0.37
596 0.37
597 0.38
598 0.39
599 0.4
600 0.39
601 0.43
602 0.5
603 0.48
604 0.51
605 0.54
606 0.51
607 0.47
608 0.49
609 0.52
610 0.49
611 0.53
612 0.5
613 0.45
614 0.49
615 0.49
616 0.41
617 0.34
618 0.29
619 0.26
620 0.26
621 0.24
622 0.23
623 0.24
624 0.24
625 0.27
626 0.26
627 0.23
628 0.2
629 0.19
630 0.16
631 0.18
632 0.18
633 0.14
634 0.14
635 0.14
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.11
640 0.1
641 0.11
642 0.11
643 0.13
644 0.12
645 0.14
646 0.14
647 0.13
648 0.12
649 0.11
650 0.11
651 0.1
652 0.1
653 0.07
654 0.07
655 0.08
656 0.08
657 0.09
658 0.11
659 0.15
660 0.18
661 0.21
662 0.29
663 0.38
664 0.49
665 0.58
666 0.65
667 0.65
668 0.7
669 0.75
670 0.73
671 0.73
672 0.71
673 0.69
674 0.66
675 0.62
676 0.56
677 0.49
678 0.44
679 0.38
680 0.31
681 0.27
682 0.21
683 0.22
684 0.22
685 0.23
686 0.22
687 0.2
688 0.2
689 0.23
690 0.27
691 0.29
692 0.33
693 0.32
694 0.33
695 0.36
696 0.4
697 0.38
698 0.37
699 0.41
700 0.35
701 0.33
702 0.31
703 0.28
704 0.22
705 0.2
706 0.17
707 0.13
708 0.13
709 0.14
710 0.14
711 0.14
712 0.13
713 0.12
714 0.1
715 0.09
716 0.09
717 0.1
718 0.09
719 0.11
720 0.12
721 0.14
722 0.16
723 0.25
724 0.31
725 0.37
726 0.41
727 0.44
728 0.49
729 0.54
730 0.53
731 0.53
732 0.54
733 0.56
734 0.56
735 0.53
736 0.53
737 0.54
738 0.61
739 0.61
740 0.6
741 0.6
742 0.59
743 0.62
744 0.61
745 0.58
746 0.51
747 0.46
748 0.37
749 0.31
750 0.29
751 0.22
752 0.17
753 0.13
754 0.12
755 0.09
756 0.1
757 0.07
758 0.07
759 0.08
760 0.08
761 0.07
762 0.06
763 0.06
764 0.07
765 0.08
766 0.07
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.1
772 0.1
773 0.11
774 0.12
775 0.15
776 0.17
777 0.2
778 0.23
779 0.22
780 0.24
781 0.23
782 0.27
783 0.26
784 0.26
785 0.29
786 0.3
787 0.3
788 0.3
789 0.35
790 0.38
791 0.46
792 0.53
793 0.56