Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8MSM6

Protein Details
Accession B8MSM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-338MGSRQRTKALERRRKKIAAKGKKDLPWARRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-338NKKREREVLREHKQREKQLIKEGKKSQPYFLKKSELKKEVLKKKYESMGSRQRTKALERRRKKIAAKGKKDLPWARR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MAISDALNKRLRARRDEEDDFEDEVSDEMEDIDKDDESNSDVDRPNSESEESAELEEGSEEEDDDDDDISDNQSTASTNDKKALQSEFRQISFGALAKAQNSISKKRKRGEEPETDDKTQSTLNDIRERLRKAREQKLGLTRDNETKNNNSGGHSKPKPPTRSSKHAPTVQSSKMAVSRKRIVIEPPSNATKPRDPRFDPAVSSSSARRNSTSNAYTFLDEYRASEIKQLKDQLARTKDPKQREELKRQLTSAEDRQRTLENKKREREVLREHKQREKQLIKEGKKSQPYFLKKSELKKEVLKKKYESMGSRQRTKALERRRKKIAAKGKKDLPWARRGVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.69
4 0.66
5 0.63
6 0.6
7 0.53
8 0.46
9 0.37
10 0.28
11 0.22
12 0.16
13 0.11
14 0.07
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.11
27 0.16
28 0.18
29 0.19
30 0.21
31 0.24
32 0.25
33 0.26
34 0.26
35 0.21
36 0.22
37 0.23
38 0.22
39 0.19
40 0.17
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.08
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.16
64 0.19
65 0.2
66 0.24
67 0.26
68 0.27
69 0.3
70 0.35
71 0.32
72 0.32
73 0.4
74 0.41
75 0.39
76 0.38
77 0.35
78 0.31
79 0.26
80 0.23
81 0.15
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.16
88 0.18
89 0.27
90 0.35
91 0.43
92 0.5
93 0.55
94 0.64
95 0.68
96 0.74
97 0.73
98 0.74
99 0.74
100 0.76
101 0.75
102 0.68
103 0.6
104 0.5
105 0.42
106 0.33
107 0.24
108 0.2
109 0.19
110 0.22
111 0.27
112 0.28
113 0.32
114 0.37
115 0.41
116 0.4
117 0.42
118 0.45
119 0.47
120 0.56
121 0.59
122 0.56
123 0.59
124 0.62
125 0.62
126 0.57
127 0.51
128 0.44
129 0.43
130 0.44
131 0.4
132 0.34
133 0.32
134 0.32
135 0.32
136 0.31
137 0.26
138 0.26
139 0.28
140 0.34
141 0.33
142 0.37
143 0.4
144 0.47
145 0.5
146 0.5
147 0.57
148 0.55
149 0.61
150 0.61
151 0.64
152 0.63
153 0.63
154 0.6
155 0.54
156 0.52
157 0.44
158 0.41
159 0.32
160 0.26
161 0.26
162 0.29
163 0.27
164 0.27
165 0.31
166 0.31
167 0.32
168 0.32
169 0.31
170 0.34
171 0.36
172 0.33
173 0.31
174 0.33
175 0.32
176 0.33
177 0.33
178 0.31
179 0.35
180 0.38
181 0.42
182 0.42
183 0.47
184 0.51
185 0.49
186 0.44
187 0.39
188 0.35
189 0.29
190 0.27
191 0.24
192 0.25
193 0.27
194 0.26
195 0.24
196 0.24
197 0.26
198 0.32
199 0.32
200 0.26
201 0.26
202 0.26
203 0.25
204 0.24
205 0.21
206 0.17
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.19
213 0.24
214 0.24
215 0.28
216 0.3
217 0.29
218 0.33
219 0.36
220 0.39
221 0.4
222 0.43
223 0.43
224 0.5
225 0.53
226 0.57
227 0.57
228 0.56
229 0.61
230 0.65
231 0.71
232 0.71
233 0.73
234 0.68
235 0.65
236 0.58
237 0.51
238 0.49
239 0.47
240 0.48
241 0.41
242 0.39
243 0.41
244 0.44
245 0.45
246 0.49
247 0.48
248 0.49
249 0.56
250 0.62
251 0.66
252 0.68
253 0.69
254 0.68
255 0.7
256 0.71
257 0.72
258 0.75
259 0.74
260 0.76
261 0.79
262 0.77
263 0.77
264 0.74
265 0.69
266 0.7
267 0.75
268 0.72
269 0.74
270 0.75
271 0.73
272 0.74
273 0.71
274 0.68
275 0.68
276 0.7
277 0.68
278 0.65
279 0.66
280 0.63
281 0.7
282 0.72
283 0.67
284 0.64
285 0.65
286 0.71
287 0.71
288 0.73
289 0.71
290 0.65
291 0.67
292 0.7
293 0.69
294 0.64
295 0.64
296 0.66
297 0.67
298 0.72
299 0.67
300 0.65
301 0.61
302 0.64
303 0.64
304 0.65
305 0.67
306 0.68
307 0.74
308 0.78
309 0.82
310 0.81
311 0.82
312 0.82
313 0.82
314 0.82
315 0.84
316 0.83
317 0.8
318 0.83
319 0.82
320 0.77
321 0.76