Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1CP05

Protein Details
Accession A0A2I1CP05    Localization Confidence Low Confidence Score 6.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-59HGNRHTQRPRHHPLHHPKIPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9, extr 9, nucl 4, cyto 4, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR007233  TRAPPC  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0030008  C:TRAPP complex  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04099  Sybindin  
CDD cd14856  TRAPPC4_synbindin  
Amino Acid Sequences AVFSLIIINKAGGLIYQREFQPGLRKLSTNDYLVLAGTFHGNRHTQRPRHHPLHHPKIPIPAPLPTTPASSSNVALSSPSGTSTPTPAASAYSLPNPGVPVTGLESLETDKFRLTCFQTLTGTKFLLFTDPLMANIDAVIKKIYELYSDYVMKNPFYQLEMPVRCEAFDRHLGGWLRGRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.17
4 0.18
5 0.21
6 0.21
7 0.23
8 0.3
9 0.32
10 0.37
11 0.36
12 0.37
13 0.37
14 0.44
15 0.46
16 0.37
17 0.33
18 0.28
19 0.25
20 0.24
21 0.21
22 0.13
23 0.09
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.11
28 0.15
29 0.17
30 0.26
31 0.35
32 0.39
33 0.48
34 0.57
35 0.63
36 0.69
37 0.74
38 0.75
39 0.76
40 0.8
41 0.77
42 0.72
43 0.65
44 0.64
45 0.59
46 0.52
47 0.43
48 0.35
49 0.33
50 0.3
51 0.31
52 0.24
53 0.24
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.18
58 0.18
59 0.15
60 0.15
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.08
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.11
95 0.11
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.13
101 0.15
102 0.18
103 0.19
104 0.21
105 0.23
106 0.25
107 0.28
108 0.26
109 0.23
110 0.19
111 0.18
112 0.16
113 0.14
114 0.13
115 0.1
116 0.12
117 0.12
118 0.13
119 0.15
120 0.15
121 0.12
122 0.12
123 0.15
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.08
128 0.09
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.12
133 0.14
134 0.19
135 0.21
136 0.22
137 0.24
138 0.26
139 0.25
140 0.24
141 0.23
142 0.19
143 0.19
144 0.2
145 0.2
146 0.28
147 0.3
148 0.33
149 0.35
150 0.34
151 0.31
152 0.32
153 0.3
154 0.26
155 0.3
156 0.29
157 0.26
158 0.33
159 0.35
160 0.36