Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8MN78

Protein Details
Accession B8MN78    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
437-460LVKLSTRNLKLKNKKLQPRFVGPFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
562-570KKSRKRKRR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR041588  Integrase_H2C2  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF17921  Integrase_H2C2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS50994  INTEGRASE  
CDD cd18974  CD_POL_like  
Amino Acid Sequences MLAIVGAFKHWRHYLKGTQWCYYLTSYDFVIKWRSGSTNPADALSRRPDYIRQNQKDDPEDSSLRLLMTLGVKIARVQQICTSYRRRVMQSRDNENPQGSEEEKTCKVSEESTQASEKPQDMVTCVYDSESGRQVQVCPGPLGPSCVLTQKVTRQRARQAVLNEAPRQEPSEGLRQLVAAAQMEDAFYMRVDKDLSEGDSTRLHYGCTSDGVLLYKGRILVPNQRSLVHEILRLHHDEPSARHWGIQKTLDLLQRKFKWEGMRQDVEEYLSRPWKEISMDFITQLPVSKVGTEEYNTILTVVDRYTKMAIFLPVQDTIDAAEMAELLHKEVELRYGCPSGIVSDRDSRITTAFTYNNSMNHTLCVSPFKALYGFDPEFHIDVADNVLEGEIPTAKDHIQKLHKLRQGLRDQLNTARQRQIEYYNKRHTPKTFKRGSLVKLSTRNLKLKNKKLQPRFVGPFRITEVIGSQAYRLALPQQYSRLHDVFLIQLLKEYHPRKKQEIMPLPELEDNPEEYKVEEIQDKRMIKGKVHYLIKWTGWPSEYNQWIPEDDMNAPRLIQGFKKSRKRKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.54
3 0.64
4 0.63
5 0.61
6 0.6
7 0.55
8 0.51
9 0.43
10 0.37
11 0.29
12 0.25
13 0.22
14 0.25
15 0.24
16 0.24
17 0.27
18 0.24
19 0.24
20 0.25
21 0.28
22 0.25
23 0.32
24 0.35
25 0.37
26 0.37
27 0.37
28 0.36
29 0.34
30 0.38
31 0.38
32 0.35
33 0.3
34 0.31
35 0.37
36 0.43
37 0.53
38 0.58
39 0.58
40 0.63
41 0.66
42 0.71
43 0.69
44 0.63
45 0.57
46 0.52
47 0.47
48 0.41
49 0.38
50 0.32
51 0.26
52 0.23
53 0.19
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.19
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.26
66 0.32
67 0.35
68 0.41
69 0.42
70 0.42
71 0.49
72 0.52
73 0.54
74 0.57
75 0.63
76 0.66
77 0.68
78 0.71
79 0.72
80 0.73
81 0.7
82 0.62
83 0.54
84 0.46
85 0.41
86 0.33
87 0.28
88 0.24
89 0.25
90 0.26
91 0.28
92 0.26
93 0.25
94 0.25
95 0.24
96 0.27
97 0.28
98 0.29
99 0.29
100 0.31
101 0.29
102 0.3
103 0.31
104 0.27
105 0.23
106 0.21
107 0.19
108 0.18
109 0.2
110 0.19
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.18
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.19
121 0.19
122 0.21
123 0.23
124 0.22
125 0.2
126 0.19
127 0.21
128 0.2
129 0.24
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.22
137 0.27
138 0.36
139 0.43
140 0.48
141 0.51
142 0.58
143 0.64
144 0.64
145 0.6
146 0.53
147 0.53
148 0.52
149 0.52
150 0.46
151 0.4
152 0.38
153 0.33
154 0.33
155 0.25
156 0.22
157 0.19
158 0.25
159 0.24
160 0.24
161 0.23
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.17
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.17
188 0.18
189 0.16
190 0.15
191 0.13
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.21
208 0.24
209 0.3
210 0.3
211 0.3
212 0.32
213 0.33
214 0.35
215 0.26
216 0.26
217 0.21
218 0.22
219 0.23
220 0.24
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.23
228 0.21
229 0.22
230 0.24
231 0.26
232 0.28
233 0.28
234 0.24
235 0.21
236 0.26
237 0.28
238 0.29
239 0.28
240 0.32
241 0.33
242 0.36
243 0.35
244 0.34
245 0.37
246 0.39
247 0.46
248 0.45
249 0.45
250 0.42
251 0.42
252 0.39
253 0.33
254 0.27
255 0.2
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.15
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.1
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.12
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.17
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.19
335 0.17
336 0.16
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.18
342 0.19
343 0.2
344 0.22
345 0.22
346 0.18
347 0.18
348 0.18
349 0.14
350 0.14
351 0.16
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.18
363 0.19
364 0.18
365 0.18
366 0.16
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.07
381 0.09
382 0.13
383 0.15
384 0.22
385 0.27
386 0.34
387 0.42
388 0.5
389 0.52
390 0.54
391 0.58
392 0.6
393 0.61
394 0.62
395 0.6
396 0.54
397 0.54
398 0.54
399 0.57
400 0.51
401 0.48
402 0.45
403 0.4
404 0.39
405 0.39
406 0.43
407 0.44
408 0.49
409 0.54
410 0.58
411 0.64
412 0.66
413 0.68
414 0.67
415 0.68
416 0.7
417 0.71
418 0.7
419 0.66
420 0.7
421 0.71
422 0.67
423 0.67
424 0.61
425 0.58
426 0.57
427 0.57
428 0.58
429 0.58
430 0.61
431 0.59
432 0.64
433 0.68
434 0.7
435 0.77
436 0.79
437 0.83
438 0.85
439 0.86
440 0.83
441 0.82
442 0.8
443 0.75
444 0.74
445 0.65
446 0.59
447 0.52
448 0.47
449 0.37
450 0.3
451 0.25
452 0.2
453 0.2
454 0.17
455 0.13
456 0.13
457 0.14
458 0.13
459 0.12
460 0.13
461 0.15
462 0.18
463 0.21
464 0.25
465 0.29
466 0.33
467 0.38
468 0.34
469 0.32
470 0.3
471 0.28
472 0.23
473 0.24
474 0.22
475 0.15
476 0.18
477 0.19
478 0.21
479 0.28
480 0.33
481 0.38
482 0.45
483 0.51
484 0.54
485 0.6
486 0.65
487 0.68
488 0.72
489 0.7
490 0.68
491 0.64
492 0.61
493 0.56
494 0.49
495 0.41
496 0.33
497 0.29
498 0.24
499 0.23
500 0.21
501 0.18
502 0.2
503 0.18
504 0.19
505 0.22
506 0.22
507 0.28
508 0.35
509 0.36
510 0.37
511 0.42
512 0.42
513 0.39
514 0.45
515 0.47
516 0.49
517 0.53
518 0.52
519 0.51
520 0.54
521 0.52
522 0.5
523 0.44
524 0.39
525 0.35
526 0.35
527 0.35
528 0.38
529 0.42
530 0.39
531 0.38
532 0.36
533 0.36
534 0.37
535 0.33
536 0.27
537 0.25
538 0.27
539 0.26
540 0.25
541 0.23
542 0.22
543 0.23
544 0.23
545 0.24
546 0.29
547 0.38
548 0.48
549 0.59
550 0.68