Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1CHQ5

Protein Details
Accession A0A2I1CHQ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-44SSDKENRQNSSRPRKRAQTQTMASSHydrophilic
84-103QDENERRRIRRELRELHRELBasic
438-462YDIKESIIKHRPKSRHSRRAVVGTVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027786  Nse4/EID  
IPR014854  Nse4_C  
IPR029225  Nse4_Nse3-bd  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF15412  Nse4-Nse3_bdg  
PF08743  Nse4_C  
Amino Acid Sequences MAGIARAREAESRSSSPESSSDKENRQNSSRPRKRAQTQTMASSGTNAKRQRLAQRASNIQGSQSQSSQSQRSDKDKRYYDPDQDENERRRIRRELRELHRELNGNSALSRHSYKLQASNCRNEYMQAGNIGIRETIEKANEIFQNVKQTSDATIDSRLLVTAANLGYKKTAQFTLGDASAGIDVDEFVSKCISFMRRGPSDPDAALSSTQRRRPRPSGRSQADPDESDDETGDAMNWDWLGRAACLRHNSRPSVSGFLLGPLSVQKRTRLVTQRRARERIDPSQAVRPQELQEKDLDRQETSNLTTMCANINKLLAETVTHGQNTVDRILSQMEEEPTEELVQEVMAKYHVADDGGVPLFHFCINPRSFGQSVENLFYVSFLVRDGTVGISTDSRQLPTLHPSKPYAPSEAQKKGVQKHQAIFSLDFETWRQLIDVYDIKESIIKHRPKSRHSRRAVVGTVERHLSFFVSDVWLLYRSDTHVVLDVIFILKLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.36
4 0.4
5 0.4
6 0.36
7 0.42
8 0.44
9 0.48
10 0.56
11 0.6
12 0.61
13 0.61
14 0.67
15 0.7
16 0.73
17 0.75
18 0.75
19 0.78
20 0.81
21 0.84
22 0.86
23 0.85
24 0.85
25 0.81
26 0.78
27 0.72
28 0.64
29 0.54
30 0.47
31 0.44
32 0.38
33 0.4
34 0.37
35 0.38
36 0.42
37 0.48
38 0.54
39 0.57
40 0.58
41 0.59
42 0.63
43 0.67
44 0.65
45 0.65
46 0.55
47 0.47
48 0.46
49 0.42
50 0.37
51 0.3
52 0.29
53 0.27
54 0.32
55 0.35
56 0.34
57 0.38
58 0.41
59 0.5
60 0.57
61 0.62
62 0.66
63 0.69
64 0.69
65 0.69
66 0.7
67 0.7
68 0.68
69 0.66
70 0.62
71 0.64
72 0.67
73 0.64
74 0.66
75 0.64
76 0.58
77 0.58
78 0.62
79 0.63
80 0.65
81 0.7
82 0.71
83 0.73
84 0.82
85 0.79
86 0.73
87 0.69
88 0.61
89 0.51
90 0.48
91 0.4
92 0.3
93 0.26
94 0.23
95 0.19
96 0.19
97 0.21
98 0.16
99 0.18
100 0.22
101 0.25
102 0.32
103 0.38
104 0.45
105 0.48
106 0.56
107 0.54
108 0.53
109 0.5
110 0.43
111 0.39
112 0.32
113 0.27
114 0.19
115 0.18
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.13
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.19
132 0.27
133 0.26
134 0.26
135 0.22
136 0.22
137 0.21
138 0.22
139 0.21
140 0.13
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.12
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.07
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.09
180 0.11
181 0.12
182 0.16
183 0.23
184 0.25
185 0.27
186 0.31
187 0.3
188 0.3
189 0.28
190 0.25
191 0.19
192 0.17
193 0.17
194 0.14
195 0.19
196 0.22
197 0.28
198 0.34
199 0.38
200 0.45
201 0.54
202 0.63
203 0.65
204 0.7
205 0.75
206 0.71
207 0.73
208 0.68
209 0.63
210 0.55
211 0.47
212 0.39
213 0.31
214 0.27
215 0.2
216 0.18
217 0.12
218 0.1
219 0.09
220 0.07
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.1
233 0.16
234 0.19
235 0.23
236 0.27
237 0.28
238 0.28
239 0.31
240 0.29
241 0.28
242 0.25
243 0.21
244 0.18
245 0.16
246 0.15
247 0.12
248 0.1
249 0.08
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.16
255 0.18
256 0.25
257 0.33
258 0.39
259 0.47
260 0.54
261 0.62
262 0.67
263 0.7
264 0.65
265 0.63
266 0.61
267 0.58
268 0.57
269 0.5
270 0.45
271 0.49
272 0.5
273 0.44
274 0.38
275 0.32
276 0.27
277 0.32
278 0.31
279 0.24
280 0.25
281 0.26
282 0.27
283 0.29
284 0.28
285 0.21
286 0.2
287 0.21
288 0.19
289 0.17
290 0.2
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.16
297 0.15
298 0.11
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.08
304 0.07
305 0.09
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.15
313 0.13
314 0.12
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.07
351 0.15
352 0.17
353 0.2
354 0.21
355 0.26
356 0.26
357 0.28
358 0.31
359 0.27
360 0.29
361 0.28
362 0.27
363 0.21
364 0.21
365 0.18
366 0.15
367 0.1
368 0.08
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.17
384 0.18
385 0.2
386 0.27
387 0.33
388 0.31
389 0.33
390 0.36
391 0.4
392 0.45
393 0.45
394 0.43
395 0.41
396 0.45
397 0.5
398 0.53
399 0.53
400 0.5
401 0.54
402 0.55
403 0.58
404 0.6
405 0.58
406 0.58
407 0.59
408 0.6
409 0.57
410 0.52
411 0.46
412 0.41
413 0.34
414 0.3
415 0.25
416 0.23
417 0.19
418 0.18
419 0.15
420 0.12
421 0.13
422 0.16
423 0.2
424 0.19
425 0.21
426 0.21
427 0.2
428 0.23
429 0.23
430 0.26
431 0.31
432 0.36
433 0.42
434 0.51
435 0.59
436 0.66
437 0.77
438 0.8
439 0.81
440 0.82
441 0.84
442 0.81
443 0.82
444 0.77
445 0.73
446 0.68
447 0.61
448 0.57
449 0.51
450 0.44
451 0.36
452 0.32
453 0.25
454 0.18
455 0.16
456 0.14
457 0.13
458 0.13
459 0.13
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.15
465 0.16
466 0.19
467 0.19
468 0.18
469 0.2
470 0.2
471 0.19
472 0.17
473 0.15
474 0.13