Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1CMD3

Protein Details
Accession A0A2I1CMD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
446-466IRESRRADSRRPDVRRFRIKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-457PIRESRRADSRRP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000270  PB1_dom  
IPR034892  PB1_NoxR  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF00515  TPR_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
CDD cd06408  PB1_NoxR  
Amino Acid Sequences MSLKQQEIETWVLALEHYDNQEYEEAIRIFGHIADTSKIFFNCGVIYATLGEHEKAVQCYQRAVSLDQYLAIAYFQEGVSNFLLGDFEEALANFNDTLLYLRGNTSIDYEQLGLKFRLFSCEVLFNRGLCYIYLQQMGPGMQDLEYAAKEKVTPDHDVIDDAIRERAEGYTVFSIPVGVVYRPNEAKVKNLKTKDYLGKARLIAASSQGNARNGHQPTDLIRTQSAFDDRPAESISFAATNLVQKNLSGRSRQQSEPPLNRTLFPPTPPPEGDKSITKSPSGGSVGANGRPGSVRAARPPRLNLDRPGSQPNGRSSADMPASDKPRIGTTRTASEPRGPPSRHYPRGLNGPEADRYLPPRETGGHRRGTSETSSASVPRNGYGEDACGVYTSPRSMASSGRRGVPPQQQRYIDEEEEYVGDMCGAHGARGIYESPGSSQRRTRSPIRESRRADSRRPDVRRFRIKVHAFEDTRYIMIGPTLEYSEFEAKIREKFGFRSLLRIRMQDEGDMITMVDQEDLELLLSSATEAARKEGSEMGKMEIWVEERPMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.12
4 0.14
5 0.16
6 0.16
7 0.18
8 0.19
9 0.18
10 0.17
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.18
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.17
19 0.11
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.2
25 0.19
26 0.19
27 0.17
28 0.17
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.12
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.14
38 0.12
39 0.11
40 0.13
41 0.15
42 0.17
43 0.21
44 0.23
45 0.23
46 0.26
47 0.27
48 0.29
49 0.29
50 0.28
51 0.29
52 0.28
53 0.27
54 0.24
55 0.23
56 0.18
57 0.15
58 0.13
59 0.09
60 0.06
61 0.07
62 0.06
63 0.08
64 0.09
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.08
72 0.1
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.19
100 0.16
101 0.15
102 0.18
103 0.17
104 0.21
105 0.21
106 0.21
107 0.2
108 0.28
109 0.28
110 0.3
111 0.31
112 0.26
113 0.26
114 0.26
115 0.24
116 0.15
117 0.19
118 0.16
119 0.18
120 0.2
121 0.18
122 0.18
123 0.19
124 0.19
125 0.15
126 0.13
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.15
139 0.17
140 0.2
141 0.19
142 0.22
143 0.22
144 0.22
145 0.22
146 0.19
147 0.16
148 0.14
149 0.14
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.11
164 0.09
165 0.07
166 0.1
167 0.11
168 0.15
169 0.16
170 0.18
171 0.21
172 0.2
173 0.27
174 0.34
175 0.41
176 0.45
177 0.48
178 0.49
179 0.48
180 0.55
181 0.54
182 0.53
183 0.51
184 0.45
185 0.46
186 0.43
187 0.42
188 0.36
189 0.29
190 0.22
191 0.18
192 0.17
193 0.14
194 0.16
195 0.16
196 0.17
197 0.17
198 0.19
199 0.24
200 0.23
201 0.25
202 0.22
203 0.21
204 0.21
205 0.27
206 0.26
207 0.2
208 0.2
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.14
214 0.14
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.17
219 0.15
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.12
233 0.16
234 0.18
235 0.18
236 0.21
237 0.27
238 0.31
239 0.33
240 0.35
241 0.39
242 0.45
243 0.49
244 0.49
245 0.48
246 0.44
247 0.44
248 0.4
249 0.38
250 0.31
251 0.26
252 0.28
253 0.26
254 0.29
255 0.29
256 0.31
257 0.28
258 0.29
259 0.3
260 0.27
261 0.28
262 0.29
263 0.29
264 0.26
265 0.23
266 0.2
267 0.22
268 0.19
269 0.16
270 0.11
271 0.15
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.14
276 0.13
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.14
281 0.14
282 0.21
283 0.29
284 0.32
285 0.35
286 0.37
287 0.4
288 0.43
289 0.45
290 0.42
291 0.4
292 0.4
293 0.4
294 0.43
295 0.39
296 0.35
297 0.35
298 0.34
299 0.33
300 0.3
301 0.28
302 0.24
303 0.26
304 0.25
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.24
309 0.23
310 0.23
311 0.18
312 0.21
313 0.23
314 0.24
315 0.24
316 0.23
317 0.28
318 0.31
319 0.33
320 0.3
321 0.35
322 0.36
323 0.35
324 0.41
325 0.37
326 0.37
327 0.44
328 0.53
329 0.52
330 0.52
331 0.51
332 0.46
333 0.55
334 0.54
335 0.47
336 0.39
337 0.35
338 0.33
339 0.31
340 0.29
341 0.2
342 0.21
343 0.22
344 0.21
345 0.19
346 0.19
347 0.2
348 0.26
349 0.33
350 0.36
351 0.4
352 0.39
353 0.42
354 0.42
355 0.42
356 0.37
357 0.31
358 0.25
359 0.19
360 0.2
361 0.19
362 0.19
363 0.19
364 0.17
365 0.16
366 0.17
367 0.15
368 0.16
369 0.14
370 0.13
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.17
384 0.23
385 0.3
386 0.31
387 0.34
388 0.35
389 0.36
390 0.42
391 0.45
392 0.49
393 0.49
394 0.54
395 0.53
396 0.54
397 0.58
398 0.57
399 0.48
400 0.39
401 0.32
402 0.25
403 0.23
404 0.2
405 0.15
406 0.09
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.11
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.19
423 0.23
424 0.25
425 0.3
426 0.35
427 0.42
428 0.47
429 0.54
430 0.55
431 0.62
432 0.68
433 0.72
434 0.76
435 0.74
436 0.76
437 0.77
438 0.73
439 0.71
440 0.7
441 0.71
442 0.71
443 0.74
444 0.77
445 0.77
446 0.82
447 0.85
448 0.8
449 0.76
450 0.76
451 0.75
452 0.72
453 0.67
454 0.66
455 0.56
456 0.53
457 0.51
458 0.42
459 0.36
460 0.29
461 0.24
462 0.15
463 0.14
464 0.13
465 0.1
466 0.1
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.15
471 0.18
472 0.18
473 0.18
474 0.21
475 0.22
476 0.25
477 0.27
478 0.27
479 0.26
480 0.28
481 0.34
482 0.39
483 0.36
484 0.43
485 0.45
486 0.5
487 0.51
488 0.51
489 0.47
490 0.44
491 0.45
492 0.36
493 0.33
494 0.26
495 0.23
496 0.2
497 0.17
498 0.12
499 0.11
500 0.1
501 0.09
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.08
515 0.09
516 0.12
517 0.14
518 0.14
519 0.16
520 0.21
521 0.23
522 0.26
523 0.27
524 0.28
525 0.28
526 0.28
527 0.27
528 0.24
529 0.23
530 0.2