Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I2GCB3

Protein Details
Accession A0A2I2GCB3    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-66SPSYERPSDRRNGRHRPRSFSRSLHydrophilic
223-244VSPYSRRSSPPQRRYGRTKATEHydrophilic
247-324DIYRPRSLSRSRSPRRSRSLSSGPPSPPPRRKSHSRMDSPPRRRRRSPSYSSYDYSSQSDRSRSSSRKRGDRYVSRRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-61PSDRRNGRHRPRS
230-293SSPPQRRYGRTKATEKHDIYRPRSLSRSRSPRRSRSLSSGPPSPPPRRKSHSRMDSPPRRRRRS
313-318RKRGDR
321-324SRRR
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034201  RNPS1_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12365  RRM_RNPS1  
Amino Acid Sequences MPATSSRGRSPTRSPHAVNYTRGTPAKRSLSPRSESRHTGSRSPSYERPSDRRNGRHRPRSFSRSLSPSRPTSRSLSRTPSRDRNWSRDSRSHGNRDNGRTFSSPDSSPRSSKIVVEKLTKNITESHLREIFGGFGDIRSLDLPMNKAFMTNRGTAYILYHDPADAEAAIAHMHEAQLDGAVLNVSIVLPRRAFSHSPPPESVRAFSRHTSGRSQPFDSRARVSPYSRRSSPPQRRYGRTKATEKHDIYRPRSLSRSRSPRRSRSLSSGPPSPPPRRKSHSRMDSPPRRRRRSPSYSSYDYSSQSDRSRSSSRKRGDRYVSRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.65
3 0.71
4 0.71
5 0.67
6 0.61
7 0.55
8 0.54
9 0.54
10 0.49
11 0.43
12 0.46
13 0.49
14 0.5
15 0.55
16 0.58
17 0.62
18 0.64
19 0.67
20 0.66
21 0.65
22 0.64
23 0.62
24 0.61
25 0.57
26 0.58
27 0.57
28 0.57
29 0.55
30 0.57
31 0.58
32 0.55
33 0.58
34 0.59
35 0.59
36 0.57
37 0.62
38 0.65
39 0.68
40 0.72
41 0.76
42 0.8
43 0.83
44 0.83
45 0.83
46 0.83
47 0.81
48 0.77
49 0.72
50 0.69
51 0.67
52 0.67
53 0.64
54 0.61
55 0.6
56 0.61
57 0.57
58 0.53
59 0.5
60 0.53
61 0.52
62 0.52
63 0.54
64 0.55
65 0.59
66 0.64
67 0.67
68 0.63
69 0.68
70 0.69
71 0.68
72 0.7
73 0.71
74 0.7
75 0.67
76 0.69
77 0.68
78 0.7
79 0.7
80 0.69
81 0.69
82 0.69
83 0.69
84 0.67
85 0.58
86 0.54
87 0.47
88 0.42
89 0.37
90 0.33
91 0.27
92 0.26
93 0.32
94 0.31
95 0.31
96 0.31
97 0.31
98 0.29
99 0.31
100 0.34
101 0.34
102 0.35
103 0.4
104 0.4
105 0.4
106 0.43
107 0.39
108 0.33
109 0.29
110 0.28
111 0.3
112 0.29
113 0.3
114 0.29
115 0.3
116 0.29
117 0.26
118 0.23
119 0.15
120 0.15
121 0.08
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.13
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.03
174 0.04
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.09
179 0.13
180 0.15
181 0.18
182 0.28
183 0.31
184 0.35
185 0.37
186 0.38
187 0.38
188 0.38
189 0.36
190 0.3
191 0.29
192 0.28
193 0.27
194 0.28
195 0.28
196 0.29
197 0.33
198 0.36
199 0.4
200 0.41
201 0.44
202 0.43
203 0.45
204 0.47
205 0.45
206 0.42
207 0.38
208 0.4
209 0.39
210 0.4
211 0.42
212 0.45
213 0.5
214 0.49
215 0.49
216 0.52
217 0.6
218 0.67
219 0.68
220 0.71
221 0.71
222 0.76
223 0.8
224 0.81
225 0.8
226 0.78
227 0.77
228 0.74
229 0.74
230 0.76
231 0.71
232 0.67
233 0.65
234 0.66
235 0.62
236 0.63
237 0.59
238 0.54
239 0.58
240 0.57
241 0.58
242 0.59
243 0.65
244 0.66
245 0.73
246 0.78
247 0.81
248 0.84
249 0.84
250 0.79
251 0.77
252 0.77
253 0.75
254 0.71
255 0.69
256 0.62
257 0.63
258 0.65
259 0.66
260 0.65
261 0.62
262 0.66
263 0.67
264 0.74
265 0.74
266 0.77
267 0.78
268 0.78
269 0.82
270 0.84
271 0.87
272 0.88
273 0.9
274 0.9
275 0.88
276 0.87
277 0.87
278 0.86
279 0.86
280 0.84
281 0.84
282 0.82
283 0.8
284 0.74
285 0.69
286 0.62
287 0.54
288 0.49
289 0.42
290 0.39
291 0.36
292 0.39
293 0.36
294 0.39
295 0.46
296 0.51
297 0.58
298 0.62
299 0.67
300 0.73
301 0.78
302 0.81
303 0.82
304 0.85