Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8MJE7

Protein Details
Accession B8MJE7    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-109DARVEAKARAKRRQQKQQAGGDDDHydrophilic
302-332ARLGKGLRKKPKWQLKNKSKNKKSKAESNGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-273KDIRRAKEAADKRENERRERDK
304-326LGKGLRKKPKWQLKNKSKNKKSK
479-483KPPSK
500-505KSKQKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MSRSVRPKRAGEDYARTHQAEDELDGPSNTKKPRFDLRNPSALAPDELEDDAVLDADEIGRRGQGVRRNAVNLDGYQSDSENEGFDARVEAKARAKRRQQKQQAGGDDDDDMFADDMEEEVEEEMGEDEAYRKNKKNVRFLRDDEIEGQANKSRGGRAVHVDLSRPLDVRGAEDVESESESEVDETERARVDEGMDEEVGAGGKKTHAPLIDAFNMRAEQEEGRFDEQGNYVRKAADPDAIHDTWLDGVSKKDIRRAKEAADKRENERRERDKKNDSILAADLLRTLITHMQRGETVLEALARLGKGLRKKPKWQLKNKSKNKKSKAESNGDEDVEMTEENPEETARKKAIDDVTGAADLLLTRGQTEIYDQEREMLTRQFKRETGEDWVDPPEVDDTQVADGNKAADSGTLWEYRWSDARDGGETHGPYDSAMMQSWNDAGYFGEGVEFRRVGGAEDDWSEKSPRPYEKKQGLLLKSKPPSKDRHSRYAVTRIVDIKLKSKQKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.6
4 0.52
5 0.47
6 0.42
7 0.34
8 0.29
9 0.23
10 0.2
11 0.2
12 0.19
13 0.19
14 0.2
15 0.25
16 0.28
17 0.32
18 0.34
19 0.39
20 0.5
21 0.58
22 0.64
23 0.69
24 0.7
25 0.73
26 0.72
27 0.67
28 0.6
29 0.52
30 0.44
31 0.34
32 0.27
33 0.2
34 0.19
35 0.17
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.08
40 0.07
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.11
50 0.16
51 0.23
52 0.29
53 0.35
54 0.39
55 0.42
56 0.42
57 0.43
58 0.4
59 0.33
60 0.3
61 0.24
62 0.22
63 0.19
64 0.19
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.11
74 0.1
75 0.13
76 0.14
77 0.17
78 0.24
79 0.32
80 0.39
81 0.46
82 0.55
83 0.62
84 0.71
85 0.79
86 0.83
87 0.86
88 0.88
89 0.87
90 0.84
91 0.79
92 0.69
93 0.59
94 0.49
95 0.39
96 0.29
97 0.2
98 0.14
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.06
116 0.11
117 0.15
118 0.2
119 0.24
120 0.32
121 0.39
122 0.47
123 0.56
124 0.61
125 0.65
126 0.68
127 0.68
128 0.68
129 0.65
130 0.59
131 0.5
132 0.43
133 0.37
134 0.3
135 0.27
136 0.22
137 0.2
138 0.19
139 0.18
140 0.16
141 0.18
142 0.2
143 0.22
144 0.23
145 0.26
146 0.29
147 0.29
148 0.29
149 0.27
150 0.28
151 0.26
152 0.22
153 0.18
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.05
189 0.03
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.09
194 0.09
195 0.11
196 0.13
197 0.18
198 0.22
199 0.22
200 0.21
201 0.2
202 0.2
203 0.18
204 0.16
205 0.13
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.15
215 0.2
216 0.21
217 0.21
218 0.2
219 0.2
220 0.2
221 0.2
222 0.2
223 0.19
224 0.15
225 0.17
226 0.22
227 0.21
228 0.21
229 0.18
230 0.17
231 0.12
232 0.13
233 0.11
234 0.06
235 0.06
236 0.09
237 0.13
238 0.14
239 0.2
240 0.24
241 0.26
242 0.32
243 0.34
244 0.35
245 0.41
246 0.46
247 0.48
248 0.52
249 0.51
250 0.5
251 0.56
252 0.55
253 0.51
254 0.54
255 0.55
256 0.56
257 0.62
258 0.65
259 0.65
260 0.66
261 0.67
262 0.61
263 0.52
264 0.44
265 0.37
266 0.31
267 0.22
268 0.18
269 0.12
270 0.08
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.08
275 0.09
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.1
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.09
293 0.16
294 0.24
295 0.34
296 0.39
297 0.48
298 0.58
299 0.68
300 0.75
301 0.8
302 0.83
303 0.84
304 0.89
305 0.91
306 0.93
307 0.92
308 0.92
309 0.9
310 0.88
311 0.83
312 0.82
313 0.8
314 0.78
315 0.72
316 0.67
317 0.62
318 0.52
319 0.46
320 0.36
321 0.27
322 0.19
323 0.15
324 0.09
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.2
337 0.23
338 0.24
339 0.24
340 0.21
341 0.22
342 0.21
343 0.2
344 0.14
345 0.11
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.07
355 0.11
356 0.14
357 0.16
358 0.16
359 0.18
360 0.19
361 0.2
362 0.2
363 0.21
364 0.26
365 0.3
366 0.34
367 0.35
368 0.36
369 0.4
370 0.4
371 0.37
372 0.37
373 0.37
374 0.34
375 0.32
376 0.33
377 0.29
378 0.26
379 0.24
380 0.18
381 0.13
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.11
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.09
394 0.07
395 0.07
396 0.1
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.17
401 0.18
402 0.2
403 0.24
404 0.24
405 0.23
406 0.25
407 0.27
408 0.26
409 0.27
410 0.28
411 0.28
412 0.26
413 0.25
414 0.22
415 0.2
416 0.17
417 0.17
418 0.15
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.09
433 0.09
434 0.12
435 0.16
436 0.15
437 0.13
438 0.15
439 0.16
440 0.15
441 0.18
442 0.17
443 0.15
444 0.17
445 0.2
446 0.2
447 0.22
448 0.22
449 0.24
450 0.29
451 0.34
452 0.41
453 0.47
454 0.55
455 0.64
456 0.7
457 0.74
458 0.75
459 0.78
460 0.75
461 0.75
462 0.73
463 0.72
464 0.72
465 0.7
466 0.69
467 0.67
468 0.69
469 0.69
470 0.73
471 0.71
472 0.73
473 0.75
474 0.75
475 0.75
476 0.76
477 0.72
478 0.64
479 0.61
480 0.53
481 0.5
482 0.48
483 0.43
484 0.41
485 0.45