FuNGI

B8MDY6

Protein Details

Accession

B8MDY6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
422-453	FPPLLPRKLRVTRARKMSKKRDANPPRRAPTD	Hydrophilic
495-525	TDQFKFKSKSRGGSKGKPKNRSSRRAAAYRA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
146-152	EKARRKM
422-476	FPPLLPRKLRVTRARKMSKKRDANPPRRAPTDSAHSTLRGRVKKLLGRAGASKLR
499-536	KFKSKSRGGSKGKPKNRSSRRAAAYRASGGRAGRKAAE

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MAKKSKSKSDKSEQAKSNGAAASTTLTKDAPIDPLLASLFEKSAGPVKTPSIQYKEFVPKPQSAKPLPEVAELEDGAEDSEDDDSDDTSSSDMDMQDADQNDEDSQFESEKEQPAEVQPSRKRKRGAADNLEDAYMQKLAREEEREKARRKMEKSKEHDVESDASAESDEDFAADSEENSDTPPPVHETVSGAVEAEELDKSNRTVFLGNVSNKAITSKSDKKALLAHISSFLPSLPKSHTPHKIESIRFRSTAYGTQQGVPRRAAYAHKETMDSTTLSTNAYVVFSTSIAAQKAPGALNGTVVLGRHLRVDNIAHPAAIDNKRCVFVGNLDFVGQENDAEGDEENPKKKKNTPPADVEEGLWRTFNANTGVAEKKNAAGGNVESVRVVRDQATRVGKGFAYVQFHDPNCVEAALLLDGKKFPPLLPRKLRVTRARKMSKKRDANPPRRAPTDSAHSTLRGRVKKLLGRAGASKLRNGNDGKPFIFEGQRAVEKTDQFKFKSKSRGGSKGKPKNRSSRRAAAYRASGGRAGRKAAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.75
3	0.66
4	0.6
5	0.52
6	0.43
7	0.33
8	0.27
9	0.24
10	0.19
11	0.19
12	0.15
13	0.14
14	0.14
15	0.16
16	0.17
17	0.17
18	0.16
19	0.17
20	0.15
21	0.17
22	0.17
23	0.16
24	0.15
25	0.12
26	0.11
27	0.11
28	0.11
29	0.11
30	0.17
31	0.17
32	0.19
33	0.2
34	0.23
35	0.29
36	0.34
37	0.4
38	0.4
39	0.42
40	0.4
41	0.46
42	0.53
43	0.51
44	0.53
45	0.51
46	0.51
47	0.55
48	0.61
49	0.61
50	0.55
51	0.57
52	0.53
53	0.56
54	0.51
55	0.49
56	0.43
57	0.37
58	0.36
59	0.29
60	0.26
61	0.18
62	0.16
63	0.12
64	0.11
65	0.08
66	0.05
67	0.06
68	0.05
69	0.06
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.09
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.12
84	0.13
85	0.15
86	0.13
87	0.14
88	0.14
89	0.14
90	0.14
91	0.11
92	0.12
93	0.1
94	0.1
95	0.13
96	0.16
97	0.2
98	0.21
99	0.2
100	0.2
101	0.23
102	0.31
103	0.3
104	0.36
105	0.39
106	0.49
107	0.56
108	0.61
109	0.62
110	0.6
111	0.67
112	0.68
113	0.71
114	0.7
115	0.69
116	0.67
117	0.63
118	0.58
119	0.47
120	0.37
121	0.28
122	0.19
123	0.13
124	0.1
125	0.1
126	0.12
127	0.16
128	0.22
129	0.23
130	0.29
131	0.4
132	0.46
133	0.5
134	0.56
135	0.6
136	0.62
137	0.67
138	0.7
139	0.7
140	0.73
141	0.75
142	0.78
143	0.75
144	0.69
145	0.64
146	0.55
147	0.47
148	0.38
149	0.32
150	0.21
151	0.16
152	0.13
153	0.12
154	0.09
155	0.07
156	0.06
157	0.04
158	0.05
159	0.05
160	0.06
161	0.06
162	0.05
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.08
167	0.09
168	0.08
169	0.08
170	0.09
171	0.12
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.14
176	0.15
177	0.16
178	0.14
179	0.11
180	0.09
181	0.08
182	0.08
183	0.07
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.09
194	0.14
195	0.2
196	0.21
197	0.22
198	0.22
199	0.21
200	0.2
201	0.21
202	0.16
203	0.12
204	0.19
205	0.25
206	0.27
207	0.34
208	0.34
209	0.34
210	0.38
211	0.4
212	0.37
213	0.29
214	0.27
215	0.23
216	0.23
217	0.22
218	0.17
219	0.14
220	0.1
221	0.09
222	0.1
223	0.11
224	0.18
225	0.21
226	0.28
227	0.37
228	0.4
229	0.43
230	0.49
231	0.52
232	0.5
233	0.55
234	0.55
235	0.49
236	0.45
237	0.42
238	0.36
239	0.31
240	0.32
241	0.26
242	0.25
243	0.23
244	0.25
245	0.28
246	0.3
247	0.3
248	0.27
249	0.24
250	0.19
251	0.2
252	0.2
253	0.22
254	0.24
255	0.25
256	0.25
257	0.25
258	0.25
259	0.25
260	0.23
261	0.18
262	0.13
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.09
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.07
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.1
298	0.12
299	0.12
300	0.17
301	0.17
302	0.14
303	0.14
304	0.14
305	0.2
306	0.23
307	0.22
308	0.19
309	0.21
310	0.22
311	0.22
312	0.22
313	0.16
314	0.17
315	0.18
316	0.18
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.15
321	0.15
322	0.1
323	0.07
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.1
331	0.13
332	0.18
333	0.2
334	0.23
335	0.26
336	0.34
337	0.42
338	0.49
339	0.56
340	0.58
341	0.63
342	0.67
343	0.69
344	0.62
345	0.53
346	0.48
347	0.4
348	0.33
349	0.26
350	0.19
351	0.14
352	0.14
353	0.16
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.16
358	0.19
359	0.18
360	0.19
361	0.17
362	0.16
363	0.18
364	0.17
365	0.14
366	0.13
367	0.13
368	0.18
369	0.18
370	0.17
371	0.14
372	0.14
373	0.15
374	0.13
375	0.14
376	0.11
377	0.14
378	0.16
379	0.23
380	0.28
381	0.28
382	0.28
383	0.29
384	0.26
385	0.24
386	0.25
387	0.21
388	0.21
389	0.22
390	0.25
391	0.28
392	0.28
393	0.31
394	0.28
395	0.25
396	0.21
397	0.19
398	0.15
399	0.1
400	0.11
401	0.09
402	0.1
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.12
408	0.12
409	0.11
410	0.2
411	0.29
412	0.38
413	0.47
414	0.53
415	0.6
416	0.67
417	0.75
418	0.76
419	0.77
420	0.75
421	0.76
422	0.81
423	0.81
424	0.84
425	0.86
426	0.86
427	0.88
428	0.86
429	0.87
430	0.88
431	0.89
432	0.89
433	0.88
434	0.85
435	0.79
436	0.75
437	0.68
438	0.63
439	0.61
440	0.55
441	0.48
442	0.43
443	0.41
444	0.39
445	0.41
446	0.44
447	0.4
448	0.39
449	0.42
450	0.48
451	0.5
452	0.56
453	0.57
454	0.53
455	0.51
456	0.52
457	0.52
458	0.52
459	0.48
460	0.47
461	0.44
462	0.42
463	0.45
464	0.45
465	0.45
466	0.46
467	0.49
468	0.44
469	0.41
470	0.41
471	0.38
472	0.38
473	0.31
474	0.26
475	0.27
476	0.32
477	0.3
478	0.32
479	0.34
480	0.35
481	0.4
482	0.44
483	0.45
484	0.44
485	0.52
486	0.54
487	0.57
488	0.63
489	0.63
490	0.66
491	0.68
492	0.75
493	0.75
494	0.79
495	0.83
496	0.83
497	0.86
498	0.86
499	0.86
500	0.86
501	0.88
502	0.88
503	0.86
504	0.85
505	0.85
506	0.83
507	0.8
508	0.76
509	0.72
510	0.7
511	0.64
512	0.56
513	0.51
514	0.46
515	0.49
516	0.44

B8MDY6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer