Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8MGH4

Protein Details
Accession B8MGH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-167EASAALRRKRQKKGDASIVDHydrophilic
480-504VYAATDKFRQNRKKGFRGHNNAGYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-160RRKRQKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10, cyto 10, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MASLVNYDSSGDESDKPKSTTFTSATKIVAAPEVNTEDSSSLQLIAGAGNSTALTYNATYDDLTRPAQGPVNPFKPNGVGNGLKRKNVPTGHAEEAAISEATFTAQHHTFQSLGYTRDPSRPDAFVGDLARAAQYGGRDFVQMKPSREASAALRRKRQKKGDASIVDGEGAYLGPWAKYENDDQVYEEEAAEAGYELASDEEFVEEEDGTSVSKLPTMATDYQDDASQAETTEFHGSEQFDYLGRTYMHIPQDLDIDLKKEPGSTKNFIPRKLVHTWKSHTKPITSLRFFPGSGHLLLSSAADGKAKIWDVYHQRELLRTFSGHSKSISDTTFHPTGKTFLTASYDRQIKLWDTEYGKCISRFSTGKTPHVVRINPDPEHSHEFLAGMSDKKIVQFDTRTGEMVQEYDHHLAAVNTITFVDNNRRFITTSDDKSLRAWEYGIPVPIKYIAEADMFAMVRACPHPSGKYVAFQSGDNQIVVYAATDKFRQNRKKGFRGHNNAGYAIDITFSPDGQFIASGDSGGYACFWDWKTGKMYHKIQAGGKDGSAVTCLDWHPQETSKVVTGGLEGVIKYWD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.32
4 0.32
5 0.33
6 0.35
7 0.38
8 0.39
9 0.39
10 0.39
11 0.4
12 0.39
13 0.37
14 0.34
15 0.28
16 0.28
17 0.22
18 0.19
19 0.2
20 0.22
21 0.21
22 0.21
23 0.21
24 0.17
25 0.17
26 0.18
27 0.14
28 0.12
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.06
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.13
48 0.16
49 0.17
50 0.18
51 0.19
52 0.19
53 0.2
54 0.25
55 0.25
56 0.3
57 0.35
58 0.41
59 0.41
60 0.4
61 0.4
62 0.38
63 0.36
64 0.33
65 0.3
66 0.3
67 0.34
68 0.44
69 0.46
70 0.46
71 0.47
72 0.47
73 0.49
74 0.46
75 0.44
76 0.4
77 0.43
78 0.44
79 0.43
80 0.4
81 0.32
82 0.3
83 0.27
84 0.19
85 0.12
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.07
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.16
97 0.16
98 0.21
99 0.19
100 0.2
101 0.21
102 0.25
103 0.25
104 0.31
105 0.33
106 0.33
107 0.33
108 0.32
109 0.31
110 0.29
111 0.28
112 0.26
113 0.24
114 0.2
115 0.16
116 0.15
117 0.14
118 0.12
119 0.1
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.13
127 0.17
128 0.25
129 0.29
130 0.31
131 0.34
132 0.35
133 0.35
134 0.35
135 0.33
136 0.3
137 0.36
138 0.41
139 0.42
140 0.5
141 0.57
142 0.65
143 0.73
144 0.76
145 0.75
146 0.77
147 0.79
148 0.8
149 0.74
150 0.7
151 0.63
152 0.54
153 0.44
154 0.34
155 0.25
156 0.15
157 0.12
158 0.07
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.17
168 0.19
169 0.19
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.2
174 0.17
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.11
205 0.13
206 0.14
207 0.16
208 0.16
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.16
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.16
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.16
250 0.21
251 0.22
252 0.26
253 0.35
254 0.38
255 0.38
256 0.42
257 0.39
258 0.39
259 0.43
260 0.46
261 0.42
262 0.44
263 0.47
264 0.52
265 0.53
266 0.53
267 0.48
268 0.42
269 0.42
270 0.44
271 0.49
272 0.42
273 0.4
274 0.37
275 0.37
276 0.36
277 0.31
278 0.26
279 0.19
280 0.17
281 0.15
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.07
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.12
297 0.18
298 0.24
299 0.26
300 0.27
301 0.26
302 0.29
303 0.3
304 0.26
305 0.22
306 0.17
307 0.16
308 0.2
309 0.22
310 0.2
311 0.2
312 0.19
313 0.19
314 0.22
315 0.21
316 0.16
317 0.16
318 0.2
319 0.24
320 0.22
321 0.21
322 0.19
323 0.2
324 0.19
325 0.19
326 0.14
327 0.1
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.21
332 0.24
333 0.22
334 0.22
335 0.23
336 0.2
337 0.21
338 0.21
339 0.21
340 0.21
341 0.23
342 0.24
343 0.25
344 0.26
345 0.24
346 0.22
347 0.18
348 0.21
349 0.2
350 0.23
351 0.3
352 0.32
353 0.35
354 0.39
355 0.4
356 0.4
357 0.45
358 0.41
359 0.35
360 0.41
361 0.43
362 0.38
363 0.38
364 0.35
365 0.34
366 0.39
367 0.37
368 0.28
369 0.22
370 0.22
371 0.19
372 0.19
373 0.16
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.13
380 0.12
381 0.15
382 0.16
383 0.18
384 0.22
385 0.22
386 0.23
387 0.22
388 0.21
389 0.18
390 0.16
391 0.13
392 0.1
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.11
397 0.12
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.08
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.09
407 0.19
408 0.21
409 0.24
410 0.26
411 0.27
412 0.27
413 0.28
414 0.35
415 0.33
416 0.34
417 0.37
418 0.37
419 0.37
420 0.37
421 0.4
422 0.33
423 0.26
424 0.22
425 0.17
426 0.2
427 0.22
428 0.25
429 0.21
430 0.2
431 0.2
432 0.21
433 0.19
434 0.15
435 0.13
436 0.11
437 0.11
438 0.12
439 0.11
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.13
448 0.12
449 0.15
450 0.17
451 0.19
452 0.25
453 0.25
454 0.3
455 0.3
456 0.32
457 0.31
458 0.29
459 0.29
460 0.29
461 0.28
462 0.22
463 0.2
464 0.15
465 0.14
466 0.14
467 0.12
468 0.09
469 0.09
470 0.11
471 0.13
472 0.18
473 0.25
474 0.36
475 0.45
476 0.51
477 0.61
478 0.69
479 0.76
480 0.82
481 0.85
482 0.87
483 0.87
484 0.87
485 0.83
486 0.76
487 0.68
488 0.58
489 0.47
490 0.37
491 0.27
492 0.18
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.07
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.06
512 0.06
513 0.11
514 0.12
515 0.19
516 0.2
517 0.24
518 0.29
519 0.35
520 0.43
521 0.48
522 0.53
523 0.52
524 0.58
525 0.59
526 0.58
527 0.58
528 0.56
529 0.48
530 0.42
531 0.38
532 0.33
533 0.28
534 0.25
535 0.18
536 0.12
537 0.14
538 0.15
539 0.17
540 0.19
541 0.2
542 0.23
543 0.26
544 0.29
545 0.28
546 0.31
547 0.28
548 0.27
549 0.25
550 0.22
551 0.19
552 0.17
553 0.16
554 0.14
555 0.11